More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2434 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2065  ABC transporter-related protein  75.51 
 
 		 537 aa  851    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0555  hypothetical protein  67.28 
 
 		 589 aa  778    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.688427  normal  0.0247588 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0707  ABC transporter, ATP-binding protein  56.74 
 
 		 537 aa  637    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2311  ABC transporter related  73.26 
 
 		 534 aa  832    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0729  hypothetical protein  66.17 
 
 		 545 aa  767    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.214117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2344  methyl coenzyme M reductase system, component A2  72.02 
 
 		 531 aa  809    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.221384 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2434  ABC transporter related  100 
 
 		 540 aa  1104    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0255  methyl coenzyme M reductase system, component A2  75.75 
 
 		 540 aa  860    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.490617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0500  ABC transporter related  56.39 
 
 		 533 aa  608  1e-173  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1902  ABC transporter, fused ATPase subunits  54.22 
 
 		 538 aa  600  1e-170  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.135632  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1643  ABC transporter related  54.06 
 
 		 531 aa  586  1e-166  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.952867  normal  0.730688 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1493  ABC transporter related  52.44 
 
 		 531 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.831657  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0271  methyl coenzyme M reductase system, component A2  53.31 
 
 		 531 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0985  ABC transporter related  53.12 
 
 		 531 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.144818  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0287  ABC transporter related  53.3 
 
 		 531 aa  580  1e-164  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0939  ABC transporter related  30.7 
 
 		 549 aa  211  3e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1651  ABC transporter, ATPase subunit  29.82 
 
 		 573 aa  210  6e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0858  ABC transporter related  29.06 
 
 		 549 aa  209  1e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0218323  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1040  ABC transporter related  29.82 
 
 		 549 aa  207  3e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1779  ABC transporter related  28.4 
 
 		 549 aa  205  2e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0877  ABC transporter related  28.07 
 
 		 549 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00117666 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0887  ABC transporter related  31.5 
 
 		 567 aa  200  5e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.324794  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4993  ABC transporter-like  25.83 
 
 		 550 aa  182  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.703021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  25.08 
 
 		 571 aa  181  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00492  ABC transporter ATPase component  24.92 
 
 		 571 aa  179  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0676  methylcoenzyme M reductase system, component A2  27.93 
 
 		 584 aa  178  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1305  ATPase  27.01 
 
 		 536 aa  178  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1646  ABC transporter-like protein protein  27.26 
 
 		 549 aa  178  3e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.495994  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2563  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  24.66 
 
 		 571 aa  175  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000295279  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3377  ABC transporter related  29.06 
 
 		 575 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.169433  normal  0.0551648 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0504  ABC transporter related protein  29.05 
 
 		 562 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0425  ABC transporter related  28.15 
 
 		 569 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703933  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4266  ABC transporter related  26.25 
 
 		 548 aa  173  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0777  ABC transporter related  27.81 
 
 		 527 aa  172  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.501487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1510  ABC transporter related  26.81 
 
 		 539 aa  172  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4326  ABC transporter related  26.07 
 
 		 548 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0444322  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2656  ABC transporter related  25.88 
 
 		 552 aa  171  3e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  28.07 
 
 		 534 aa  170  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2456  ABC transporter related  28.8 
 
 		 566 aa  169  8e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0403  ABC transporter related  26.61 
 
 		 550 aa  169  9e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  26.99 
 
 		 538 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0561  ABC transporter for peptide ATP-binding protein  24.79 
 
 		 566 aa  168  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2207  ABC transporter related  26.68 
 
 		 549 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252505  normal  0.194829 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  27.42 
 
 		 544 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  27.34 
 
 		 539 aa  164  5.0000000000000005e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0245  ABC transporter related  27.08 
 
 		 542 aa  164  5.0000000000000005e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2452  ABC transporter related  27.5 
 
 		 571 aa  163  9e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000520728 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  27.01 
 
 		 568 aa  162  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  26.75 
 
 		 593 aa  161  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (dipeptide)  28.37 
 
 		 555 aa  161  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0292  ABC transporter foroligopeptide/dipeptide ATP-binding protein  25.95 
 
 		 530 aa  160  4e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1540  ABC transporter related  26.96 
 
 		 533 aa  160  5e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  25.31 
 
 		 545 aa  159  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2126  ABC transporter related  27.35 
 
 		 556 aa  159  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.562113  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  25.5 
 
 		 549 aa  158  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  26.48 
 
 		 543 aa  157  4e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0502  ABC transporter related  23.99 
 
 		 567 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.348202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  25.91 
 
 		 539 aa  156  7e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08440  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  25.24 
 
 		 599 aa  155  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.508486  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4330  putative ABC transporter, ATP-binding protein  26.23 
 
 		 540 aa  156  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03560  ABC-type dipeptide transport system, ATPase component  25.04 
 
 		 564 aa  155  1e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0264  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  25.18 
 
 		 527 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26180  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  25.64 
 
 		 575 aa  155  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.204743 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  25.93 
 
 		 572 aa  155  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  26.14 
 
 		 543 aa  155  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  25.63 
 
 		 555 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3744  ABC transporter-like  24.95 
 
 		 537 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1149  ABC transporter related  26.37 
 
 		 546 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.108293 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  25.45 
 
 		 542 aa  155  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0982  ABC transporter component  26.64 
 
 		 541 aa  154  4e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.616195  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3169  ABC transporter component  26.69 
 
 		 553 aa  154  4e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3743  ABC transporter related  26.37 
 
 		 531 aa  154  4e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0751  ABC transporter related  25.66 
 
 		 557 aa  154  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  25.14 
 
 		 547 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0190  ABC transporter related  24.64 
 
 		 530 aa  153  7e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2423  ABC transporter related  25.68 
 
 		 563 aa  153  7e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00102758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7123  ABC transporter related  25.27 
 
 		 629 aa  153  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.333209  normal  0.399658 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0196  ABC transporter related  24.64 
 
 		 530 aa  153  7e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3261  ABC transporter related protein  27.98 
 
 		 554 aa  153  8e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4998  ABC transporter, ATPase subunit  25.13 
 
 		 547 aa  153  8.999999999999999e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.465618 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0011  ABC transporter related  25.63 
 
 		 553 aa  153  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1510  ABC transporter related  25.87 
 
 		 534 aa  152  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.706226  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3776  ABC transporter-related protein  25.67 
 
 		 535 aa  152  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.529237  normal  0.544592 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5450  ABC transporter related  25.55 
 
 		 583 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0152019 
 
 
-
 
NC_004310  BR0006  ABC transporter, ATP-binding protein  25.27 
 
 		 541 aa  152  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0006  ABC transporter, ATP-binding protein  25.27 
 
 		 550 aa  152  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0296287  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0942  ABC transporter related  26.53 
 
 		 551 aa  152  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.337051  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4454  ABC transporter related  25.13 
 
 		 619 aa  152  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023315 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4150  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  25.96 
 
 		 534 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.971322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4915  ABC transporter related  27.98 
 
 		 933 aa  151  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3465  ABC transporter related  25.68 
 
 		 548 aa  151  3e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5181  ABC transporter related  26 
 
 		 573 aa  151  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal  0.292066 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3811  ABC transporter related  24.68 
 
 		 563 aa  151  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.148208 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1715  ABC transporter related  25.96 
 
 		 535 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19880  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  27 
 
 		 551 aa  150  4e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00329982  hitchhiker  0.000556762 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4835  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.9 
 
 		 572 aa  150  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.671613 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7051  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  25.87 
 
 		 545 aa  150  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6641  ABC transporter related  25.55 
 
 		 542 aa  150  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1402  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  26.63 
 
 		 534 aa  150  5e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.536477  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3919  ABC transporter related  25.98 
 
 		 543 aa  150  6e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>