More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1902 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0707  ABC transporter, ATP-binding protein  67.6 
 
 		 537 aa  778    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1902  ABC transporter, fused ATPase subunits  100 
 
 		 538 aa  1100    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.135632  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0500  ABC transporter related  60.75 
 
 		 533 aa  676    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2311  ABC transporter related  54.38 
 
 		 534 aa  605  9.999999999999999e-173  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2065  ABC transporter-related protein  54.43 
 
 		 537 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2434  ABC transporter related  54.22 
 
 		 540 aa  600  1e-170  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0255  methyl coenzyme M reductase system, component A2  53.54 
 
 		 540 aa  596  1e-169  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.490617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0555  hypothetical protein  52.5 
 
 		 589 aa  588  1e-167  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.688427  normal  0.0247588 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2344  methyl coenzyme M reductase system, component A2  52.46 
 
 		 531 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.221384 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0271  methyl coenzyme M reductase system, component A2  52.55 
 
 		 531 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0729  hypothetical protein  52.64 
 
 		 545 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.214117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0287  ABC transporter related  51.98 
 
 		 531 aa  568  1e-161  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1643  ABC transporter related  51.98 
 
 		 531 aa  570  1e-161  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.952867  normal  0.730688 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1493  ABC transporter related  51.42 
 
 		 531 aa  568  1e-160  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.831657  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0985  ABC transporter related  52.36 
 
 		 531 aa  566  1e-160  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.144818  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1651  ABC transporter, ATPase subunit  29.46 
 
 		 573 aa  231  2e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0676  methylcoenzyme M reductase system, component A2  28.93 
 
 		 584 aa  226  6e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0887  ABC transporter related  30.19 
 
 		 567 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.324794  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0858  ABC transporter related  28.16 
 
 		 549 aa  218  2e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0218323  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0877  ABC transporter related  28.4 
 
 		 549 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00117666 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1779  ABC transporter related  27.7 
 
 		 549 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1040  ABC transporter related  27.66 
 
 		 549 aa  208  2e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0939  ABC transporter related  28.4 
 
 		 549 aa  205  2e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (dipeptide)  28.18 
 
 		 555 aa  180  4.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7201  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  25.9 
 
 		 543 aa  179  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0277171  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  27.82 
 
 		 510 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1794  ABC transporter related  25.36 
 
 		 550 aa  164  4.0000000000000004e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.224756 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0810  ABC transporter related  26.7 
 
 		 932 aa  163  6e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  24.23 
 
 		 539 aa  161  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1243  ABC transporter related  23.12 
 
 		 575 aa  160  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3159  ABC transporter, 2 fused ATPase and 1 inner membrane subunits  26.91 
 
 		 901 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.827226  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3896  ABC transporter related  26.73 
 
 		 901 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.184002 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2423  ABC transporter related  23.99 
 
 		 563 aa  157  6e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00102758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5970  ABC transporter related  24.36 
 
 		 631 aa  156  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.356135 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1396  ABC transporter related  25 
 
 		 537 aa  155  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3157  ABC transporter for oligopeptide ATP-binding protein  26.33 
 
 		 587 aa  155  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1504  ABC transporter related  25.37 
 
 		 914 aa  155  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1310  ABC transporter related  25.67 
 
 		 544 aa  155  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0559382  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7123  ABC transporter related  24.02 
 
 		 629 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.333209  normal  0.399658 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2905  ABC transporter  24.4 
 
 		 525 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0658  ABC peptide transporter  23.27 
 
 		 533 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0749  ABC transporter related  26.32 
 
 		 904 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118496  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  26.82 
 
 		 512 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3129  ABC transporter related  24.17 
 
 		 582 aa  154  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7849  ABC transporter permease ATP-binding protein  25.65 
 
 		 915 aa  153  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0180786  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3675  ABC sugar transporter, ATPase subunit  28.02 
 
 		 495 aa  153  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.973573  normal  0.0920445 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1561  ABC transporter related  26.77 
 
 		 918 aa  153  7e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5450  ABC transporter related  23.32 
 
 		 583 aa  153  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0152019 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3744  ABC transporter-like  24.09 
 
 		 537 aa  152  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0060  ABC transporter related protein  27 
 
 		 534 aa  151  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.721414  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3434  ABC transporter related  25.18 
 
 		 536 aa  151  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.560851 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2244  ABC transporter related  27.66 
 
 		 495 aa  152  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1510  ABC transporter related  25.09 
 
 		 534 aa  152  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.706226  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16500  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  24.96 
 
 		 531 aa  151  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.892768  normal  0.399532 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2170  ABC transporter related  26.59 
 
 		 579 aa  151  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1612  ABC transporter related  26.98 
 
 		 935 aa  150  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  24.87 
 
 		 545 aa  150  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05580  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  27.19 
 
 		 583 aa  150  5e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.158462  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0777  ABC transporter related  24.81 
 
 		 527 aa  150  5e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.501487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3880  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  27.24 
 
 		 914 aa  150  5e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.859575  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4326  ABC transporter related  24.23 
 
 		 548 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0444322  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3117  ABC transporter-like  23.45 
 
 		 527 aa  150  6e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70609  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0985  ABC transporter related protein  27.17 
 
 		 607 aa  150  6e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.674675  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0504  ABC transporter related protein  24.82 
 
 		 562 aa  150  6e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0536  ABC transporter related  25.14 
 
 		 912 aa  150  7e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.94583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  23.69 
 
 		 571 aa  150  7e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2116  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  25.44 
 
 		 553 aa  150  8e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3274  ABC transporter related  25.91 
 
 		 496 aa  149  9e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.201144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2976  ABC transporter related  23.56 
 
 		 562 aa  149  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4266  ABC transporter related  24.04 
 
 		 548 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2126  ABC transporter related  24.18 
 
 		 556 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.562113  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1541  ABC transporter related  25.64 
 
 		 541 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3743  ABC transporter related  24.86 
 
 		 531 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3720  ABC transporter, ATP-binding protein  23.29 
 
 		 536 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59645  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0962  ABC transporter related  27.16 
 
 		 495 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5181  ABC transporter related  24.5 
 
 		 573 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal  0.292066 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2269  ABC transporter related  25.09 
 
 		 532 aa  149  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69070  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  24.86 
 
 		 916 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  24.59 
 
 		 549 aa  148  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0264  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  24.01 
 
 		 527 aa  148  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0170  ABC-2 type transport system  25.28 
 
 		 925 aa  148  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.476544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0609  ABC transporter related  24.6 
 
 		 609 aa  148  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436309  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2915  ABC transporter related  24.72 
 
 		 540 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0265985  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2014  ABC transporter related  25 
 
 		 534 aa  147  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0103436  normal  0.550427 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0565  ABC transporter related  24.44 
 
 		 912 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.620253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  24.18 
 
 		 546 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  24.73 
 
 		 568 aa  147  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3216  hypothetical protein  25.97 
 
 		 901 aa  147  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.881603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  25 
 
 		 510 aa  147  5e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7191  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  23.49 
 
 		 564 aa  147  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453207  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0018  ABC transporter related  25.56 
 
 		 909 aa  147  5e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0529  ABC transporter related  23.27 
 
 		 533 aa  147  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.328091 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  24.19 
 
 		 544 aa  147  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1350  ABC transporter, ATP binding/permease protein  26.18 
 
 		 922 aa  146  8.000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3032  peptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  24.59 
 
 		 525 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158001  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1950  ABC transporter related  24.55 
 
 		 921 aa  146  8.000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26180  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  25.63 
 
 		 575 aa  146  8.000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.204743 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0464  ABC transporter, ATP-binding protein  25.09 
 
 		 536 aa  146  8.000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  24.91 
 
 		 534 aa  146  9e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0210  ABC transporter related  25.66 
 
 		 916 aa  146  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10228  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>