More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3157 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_3157  ABC transporter for oligopeptide ATP-binding protein  100 
 
 
587 aa  1200    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14270  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  46.39 
 
 
577 aa  478  1e-133  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0598  ABC transporter related  46.99 
 
 
588 aa  471  1.0000000000000001e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  46.06 
 
 
568 aa  464  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7226  ABC transporter related  44.6 
 
 
624 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0885974  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3602  ABC transporter related  45.19 
 
 
534 aa  456  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121107  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  42.54 
 
 
609 aa  457  1e-127  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2773  ABC transporter, ATPase subunit  45.42 
 
 
558 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3682  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  44.57 
 
 
590 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.732686  normal  0.333976 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0534  ABC transporter, ATP-binding protein  45.64 
 
 
536 aa  449  1e-125  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  44.04 
 
 
539 aa  450  1e-125  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0464  ABC transporter, ATP-binding protein  45.64 
 
 
536 aa  450  1e-125  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  45.88 
 
 
539 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  44.16 
 
 
576 aa  445  1.0000000000000001e-124  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4688  ABC transporter related  45.19 
 
 
533 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678377  normal  0.275572 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  43.49 
 
 
539 aa  447  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6474  ABC transporter related  43.86 
 
 
624 aa  445  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.506325  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  45.88 
 
 
539 aa  442  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7123  ABC transporter related  44.52 
 
 
629 aa  443  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.333209  normal  0.399658 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  46 
 
 
531 aa  443  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5970  ABC transporter related  43.99 
 
 
631 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.356135 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  42.88 
 
 
543 aa  443  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2286  ABC transporter related  40.32 
 
 
617 aa  444  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.411723 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3377  ABC transporter related  43.19 
 
 
575 aa  443  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.169433  normal  0.0551648 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  46.07 
 
 
539 aa  444  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0142  ABC transporter  45.64 
 
 
527 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2828  ABC transporter related  44.39 
 
 
613 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.966478  normal  0.396925 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  43.93 
 
 
562 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2425  ABC transporter-like protein  45.67 
 
 
568 aa  440  9.999999999999999e-123  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  44.01 
 
 
547 aa  440  9.999999999999999e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  42.56 
 
 
572 aa  441  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1272  ABC transporter-related protein  45.74 
 
 
548 aa  439  9.999999999999999e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000618356 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1824  ABC transporter related  45.21 
 
 
542 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160839  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  42.7 
 
 
543 aa  441  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2823  ABC transporter related  41.09 
 
 
619 aa  440  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0582166  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5559  ABC transporter related  44.22 
 
 
570 aa  442  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.153225  normal  0.0799333 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1933  ABC transporter related  44.82 
 
 
542 aa  436  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120655  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0264  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.83 
 
 
527 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2209  ABC transporter related  45 
 
 
542 aa  436  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326804  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1351  ABC transporter related  45.02 
 
 
544 aa  436  1e-121  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0625  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.21 
 
 
623 aa  432  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  42.43 
 
 
586 aa  432  1e-120  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4135  ABC transporter related  44.9 
 
 
545 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1810  ABC transporter related  44.91 
 
 
566 aa  433  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.295405  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3744  ABC transporter-like  44.92 
 
 
537 aa  432  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398747  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3249  peptide ABC transporter ATPase  42.38 
 
 
557 aa  432  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3252  peptide ABC transporter ATPase  44 
 
 
592 aa  433  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0247  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  44.53 
 
 
542 aa  434  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5450  ABC transporter related  42.83 
 
 
583 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0152019 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26180  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  42.78 
 
 
575 aa  433  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.204743 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0196  ABC transporter related  41.76 
 
 
530 aa  434  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3986  ABC transporter related  44 
 
 
592 aa  433  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4449  ABC transporter related  44.9 
 
 
545 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.875798 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0190  ABC transporter related  41.76 
 
 
530 aa  434  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0006  ABC transporter, ATP-binding protein  44.3 
 
 
550 aa  433  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0296287  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1490  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.49 
 
 
633 aa  431  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0006  ABC transporter, ATP-binding protein  44.34 
 
 
541 aa  430  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4592  ABC transporter related  43.13 
 
 
629 aa  431  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390249  normal  0.807513 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  40.82 
 
 
623 aa  429  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0985  ABC transporter related protein  42.15 
 
 
607 aa  429  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.674675  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3722  ABC transporter related  44.03 
 
 
535 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00680128  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0035  ABC transporter related  44.84 
 
 
543 aa  429  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.806878  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  44.53 
 
 
542 aa  429  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0817  ABC transporter related  46.14 
 
 
545 aa  431  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252314  normal  0.0669471 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2975  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.43 
 
 
633 aa  429  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3983  ABC transporter related  42.2 
 
 
557 aa  430  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0961  ABC transporter related protein  43.19 
 
 
563 aa  430  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0532  putative peptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.51 
 
 
530 aa  427  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3489  glutathione import ATP-binding protein GsiA  43.04 
 
 
537 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2045  ABC transporter-like  39.33 
 
 
627 aa  426  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0344887  normal  0.804601 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1402  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  44.28 
 
 
534 aa  427  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.536477  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4108  ABC transporter related  40.65 
 
 
623 aa  427  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.486076  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1913  ABC transporter related protein  43.25 
 
 
530 aa  427  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0950  ABC transporter related  42.86 
 
 
571 aa  427  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.331965  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  41.92 
 
 
578 aa  426  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4797  ABC transporter related  43.67 
 
 
565 aa  429  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.115874  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0011  ABC transporter related  43.56 
 
 
553 aa  428  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3363  ABC transporter related  44.14 
 
 
542 aa  426  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0199  ABC transporter related  38.4 
 
 
682 aa  427  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.814117 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3273  acetamidase/formamidase  42.93 
 
 
592 aa  425  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4143  ABC transporter related  44.03 
 
 
556 aa  426  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.538724 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  41.94 
 
 
546 aa  426  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3032  peptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.63 
 
 
525 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158001  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3720  ABC transporter, ATP-binding protein  43.31 
 
 
536 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59645  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1755  ABC transporter  43.15 
 
 
536 aa  423  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0108432 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2905  ABC transporter  44.16 
 
 
525 aa  425  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3932  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  43.06 
 
 
628 aa  423  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5904  ABC transporter related  43.81 
 
 
555 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969657  normal  0.702258 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3723  ABC transporter related  44.26 
 
 
545 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4790  ABC transporter-like protein protein  39.16 
 
 
617 aa  425  1e-117  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.918505  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2143  ABC transporter-related protein  43.65 
 
 
549 aa  424  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0716  ABC transporter related  40.49 
 
 
606 aa  425  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.953426  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0658  ABC peptide transporter  44.71 
 
 
533 aa  423  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1323  glutathione transporter ATP-binding protein  41.29 
 
 
623 aa  422  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5181  ABC transporter related  41.91 
 
 
573 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal  0.292066 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0292  ABC transporter foroligopeptide/dipeptide ATP-binding protein  45.69 
 
 
530 aa  425  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2570  ABC transporter ATP-binding protein  43.77 
 
 
602 aa  422  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.088253  normal  0.116617 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4130  ABC transporter related  42.33 
 
 
561 aa  421  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0701  peptide ABC transporter ATPase  44.1 
 
 
543 aa  421  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0143  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  43.67 
 
 
579 aa  419  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.18152 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>