More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0887 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0887  ABC transporter related  100 
 
 		 567 aa  1145    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.324794  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1651  ABC transporter, ATPase subunit  51.42 
 
 		 573 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0676  methylcoenzyme M reductase system, component A2  51.13 
 
 		 584 aa  561  1e-158  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1040  ABC transporter related  42.88 
 
 		 549 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1779  ABC transporter related  43.68 
 
 		 549 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0877  ABC transporter related  42.48 
 
 		 549 aa  449  1e-125  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00117666 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0939  ABC transporter related  43.49 
 
 		 549 aa  451  1e-125  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0858  ABC transporter related  42.41 
 
 		 549 aa  450  1e-125  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0218323  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0271  methyl coenzyme M reductase system, component A2  31.36 
 
 		 531 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1643  ABC transporter related  30.9 
 
 		 531 aa  248  1e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.952867  normal  0.730688 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0985  ABC transporter related  30.51 
 
 		 531 aa  246  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.144818  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0500  ABC transporter related  32.4 
 
 		 533 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0287  ABC transporter related  30.78 
 
 		 531 aa  242  1e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1902  ABC transporter, fused ATPase subunits  30.19 
 
 		 538 aa  236  7e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.135632  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0707  ABC transporter, ATP-binding protein  30.36 
 
 		 537 aa  232  1e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1493  ABC transporter related  29.08 
 
 		 531 aa  232  2e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.831657  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2311  ABC transporter related  29.44 
 
 		 534 aa  223  6e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0255  methyl coenzyme M reductase system, component A2  29.71 
 
 		 540 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.490617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2344  methyl coenzyme M reductase system, component A2  28.57 
 
 		 531 aa  219  2e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.221384 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2434  ABC transporter related  30.34 
 
 		 540 aa  213  5.999999999999999e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0555  hypothetical protein  28.45 
 
 		 589 aa  211  2e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.688427  normal  0.0247588 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2065  ABC transporter-related protein  28.42 
 
 		 537 aa  211  3e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0729  hypothetical protein  27.47 
 
 		 545 aa  204  2e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.214117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  27.79 
 
 		 553 aa  162  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18700  ABC transporter, ATP binding component  27.77 
 
 		 542 aa  158  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106187  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  28.57 
 
 		 510 aa  159  2e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0190  ABC transporter related  24.56 
 
 		 530 aa  157  7e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0196  ABC transporter related  24.56 
 
 		 530 aa  157  7e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2143  ABC transporter-related protein  25.77 
 
 		 549 aa  150  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0292  ABC transporter foroligopeptide/dipeptide ATP-binding protein  25.83 
 
 		 530 aa  149  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1794  ABC transporter related  26.94 
 
 		 550 aa  148  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.224756 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2990  ABC transporter, ATPase subunit  25.89 
 
 		 559 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1451  ABC transporter related  25.72 
 
 		 555 aa  148  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1082  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  25.72 
 
 		 573 aa  146  8.000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2126  ABC transporter related  25.93 
 
 		 556 aa  146  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.562113  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1243  ABC transporter related  25.83 
 
 		 575 aa  145  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  25.42 
 
 		 543 aa  145  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3091  nickel ABC transporter, ATP-binding protein, putative  25.8 
 
 		 548 aa  144  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00987515  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1233  methionine import ATP-binding protein MetN  35.89 
 
 		 340 aa  144  6e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5904  ABC transporter related  23.93 
 
 		 555 aa  143  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969657  normal  0.702258 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1395  ABC transporter related  40.25 
 
 		 337 aa  143  9e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1111  ABC transporter related  23.95 
 
 		 551 aa  143  9e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.778341 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  28.25 
 
 		 557 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2549  ABC transporter related  24.48 
 
 		 530 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0563  ABC transporter related  26.06 
 
 		 581 aa  141  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000790645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5160  ABC transporter related  36.84 
 
 		 388 aa  141  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1804  ABC transporter related  25.82 
 
 		 537 aa  141  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.147708 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4400  ABC transporter related  25.67 
 
 		 543 aa  141  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  0.828936 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3377  ABC transporter related  26.66 
 
 		 575 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.169433  normal  0.0551648 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2435  ABC transporter related  25.64 
 
 		 530 aa  140  4.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5181  ABC transporter related  26.17 
 
 		 573 aa  140  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal  0.292066 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1017  ABC transporter related  23.56 
 
 		 551 aa  140  6e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0546481 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3079  ABC transporter related protein  34.42 
 
 		 342 aa  140  6e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0902  ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 		 352 aa  140  7.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.693076  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  24.11 
 
 		 543 aa  140  7.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0967  ABC transporter ATP-binding protein  35.89 
 
 		 322 aa  140  7.999999999999999e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1145  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  31.08 
 
 		 377 aa  140  8.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3220  ABC transporter, ATP-binding protein  25.61 
 
 		 539 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1217  ABC transporter related  25.26 
 
 		 540 aa  139  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322449  normal  0.502892 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0961  ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 		 352 aa  139  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5450  ABC transporter related  26.04 
 
 		 583 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0152019 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0658  ABC peptide transporter  24.79 
 
 		 533 aa  139  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4143  ABC transporter related  24.41 
 
 		 556 aa  139  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538724 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  24.14 
 
 		 555 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2457  ABC transporter related  32.39 
 
 		 368 aa  138  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0560  ABC transporter related  25 
 
 		 542 aa  139  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000861738  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1541  ABC transporter related  25.04 
 
 		 541 aa  139  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2636  ABC transporter related  26.2 
 
 		 547 aa  139  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.723017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1547  ABC transporter ATP-binding protein  34.78 
 
 		 328 aa  138  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2661  ABC transporter, ATP-binding protein  34.78 
 
 		 328 aa  138  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2742  ABC transporter related  34.78 
 
 		 328 aa  138  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3403  ABC transporter related  26.23 
 
 		 538 aa  137  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0805  ABC transporter related protein  32.37 
 
 		 322 aa  137  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.63859 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2498  ABC transporter related  24.51 
 
 		 544 aa  137  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000299365  normal  0.0176936 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3154  ABC transporter-related protein  25.13 
 
 		 557 aa  137  5e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3513  ABC transporter related protein  24.14 
 
 		 541 aa  137  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.709638  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  25.3 
 
 		 531 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22300  ABC transporter related  33.46 
 
 		 352 aa  137  7.000000000000001e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.321678  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1272  ABC transporter-related protein  26.18 
 
 		 548 aa  136  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000618356 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2961  ABC transporter  25.96 
 
 		 547 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0701  peptide ABC transporter ATPase  25.17 
 
 		 543 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3768  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  34.88 
 
 		 331 aa  135  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.227967  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3919  ABC transporter related  25.17 
 
 		 543 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5258  putative ABC transporter ATP-binding protein  24.91 
 
 		 548 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.170302 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1380  ABC transporter related  25.4 
 
 		 539 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0115992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0377  ABC transporter-like  33.47 
 
 		 244 aa  134  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250088 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1981  ABC transporter, ATP-binding protein  25.09 
 
 		 544 aa  134  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000154276  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1639  ABC peptide transporter, ATPase subunit  25.04 
 
 		 543 aa  134  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0125273  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2686  ABC transporter-like protein  25.73 
 
 		 484 aa  134  5e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.473658  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  24.35 
 
 		 542 aa  134  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2356  ABC transporter related  25.17 
 
 		 543 aa  134  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.10022 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0751  ABC transporter related  24.47 
 
 		 557 aa  133  7.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0195  D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein  33.6 
 
 		 351 aa  132  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2301  ABC transporter related  33.69 
 
 		 392 aa  132  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.249837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0065  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  34.15 
 
 		 335 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  27.29 
 
 		 534 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0973  ABC transporter related  32.86 
 
 		 338 aa  133  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  23.26 
 
 		 539 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1447  ABC transporter related  34.71 
 
 		 342 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513841  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0496  ABC transporter related  32.23 
 
 		 342 aa  132  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000100343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>