More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2311 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2434  ABC transporter related  73.26 
 
 
540 aa  832    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0555  hypothetical protein  66.36 
 
 
589 aa  767    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.688427  normal  0.0247588 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2065  ABC transporter-related protein  72.18 
 
 
537 aa  813    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2311  ABC transporter related  100 
 
 
534 aa  1094    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0729  hypothetical protein  65.05 
 
 
545 aa  756    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.214117  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2344  methyl coenzyme M reductase system, component A2  66.6 
 
 
531 aa  763    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.221384 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0255  methyl coenzyme M reductase system, component A2  70.92 
 
 
540 aa  820    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.490617  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0707  ABC transporter, ATP-binding protein  55.41 
 
 
537 aa  621  1e-177  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395243  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0500  ABC transporter related  57.04 
 
 
533 aa  617  1e-175  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1902  ABC transporter, fused ATPase subunits  54.38 
 
 
538 aa  605  9.999999999999999e-173  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.135632  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0985  ABC transporter related  52.17 
 
 
531 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.144818  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0287  ABC transporter related  52.92 
 
 
531 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0271  methyl coenzyme M reductase system, component A2  51.61 
 
 
531 aa  571  1e-161  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1643  ABC transporter related  51.8 
 
 
531 aa  569  1e-161  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.952867  normal  0.730688 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1493  ABC transporter related  52.44 
 
 
531 aa  568  1e-160  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.831657  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0676  methylcoenzyme M reductase system, component A2  29.08 
 
 
584 aa  224  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0939  ABC transporter related  30.69 
 
 
549 aa  217  5e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1779  ABC transporter related  29.15 
 
 
549 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0858  ABC transporter related  28.33 
 
 
549 aa  213  5.999999999999999e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0218323  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0887  ABC transporter related  29.44 
 
 
567 aa  213  9e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.324794  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1040  ABC transporter related  28.74 
 
 
549 aa  206  6e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0877  ABC transporter related  28.69 
 
 
549 aa  206  7e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00117666 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1651  ABC transporter, ATPase subunit  26.47 
 
 
573 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4993  ABC transporter-like  26.82 
 
 
550 aa  178  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.703021  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5450  ABC transporter related  26.84 
 
 
583 aa  172  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0152019 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5559  ABC transporter related  27.85 
 
 
570 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.153225  normal  0.0799333 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5181  ABC transporter related  26.37 
 
 
573 aa  167  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal  0.292066 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  26.27 
 
 
549 aa  163  9e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3377  ABC transporter related  26.33 
 
 
575 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.169433  normal  0.0551648 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1510  ABC transporter related  25.09 
 
 
539 aa  162  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  26.32 
 
 
534 aa  162  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1646  ABC transporter-like protein protein  26.12 
 
 
549 aa  161  3e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.495994  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0942  ABC transporter related  25.8 
 
 
551 aa  160  4e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.337051  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2656  ABC transporter related  26.32 
 
 
552 aa  160  5e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19880  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  26.42 
 
 
551 aa  159  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00329982  hitchhiker  0.000556762 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2563  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  24.37 
 
 
571 aa  159  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000295279  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  28.6 
 
 
510 aa  159  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5294  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  27.17 
 
 
549 aa  159  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26421  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0504  ABC transporter related protein  25.39 
 
 
562 aa  159  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00492  ABC transporter ATPase component  23.63 
 
 
571 aa  158  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3465  ABC transporter related  25.41 
 
 
548 aa  158  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17462  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7201  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  26.73 
 
 
543 aa  158  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0277171  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2423  ABC transporter related  27.74 
 
 
563 aa  158  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00102758  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0425  ABC transporter related  25.74 
 
 
569 aa  158  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703933  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3743  ABC transporter related  25.65 
 
 
531 aa  158  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  23.02 
 
 
571 aa  156  7e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1305  ATPase  25.09 
 
 
536 aa  156  7e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0561  ABC transporter for peptide ATP-binding protein  23.82 
 
 
566 aa  155  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  25.57 
 
 
593 aa  154  5e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2976  ABC transporter related  24.87 
 
 
562 aa  154  5e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100933  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  24.06 
 
 
545 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  25.23 
 
 
539 aa  153  7e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  24.78 
 
 
547 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0196  ABC transporter related  23.95 
 
 
530 aa  152  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0190  ABC transporter related  23.95 
 
 
530 aa  152  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1794  ABC transporter related  24.28 
 
 
550 aa  151  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.224756 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1268  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  26.63 
 
 
540 aa  150  5e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  24.6 
 
 
568 aa  150  6e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1243  ABC transporter related  23.32 
 
 
575 aa  150  6e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0857  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  25.52 
 
 
558 aa  150  7e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0264  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  24.82 
 
 
527 aa  150  8e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3220  ABC transporter, ATP-binding protein  25.31 
 
 
539 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94364  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4266  ABC transporter related  24.91 
 
 
548 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1054  ABC transporter related  24.69 
 
 
563 aa  149  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.763117  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4326  ABC transporter related  25.23 
 
 
548 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0444322  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05580  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  25 
 
 
583 aa  147  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.158462  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0292  ABC transporter foroligopeptide/dipeptide ATP-binding protein  24.08 
 
 
530 aa  147  3e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  25.81 
 
 
544 aa  147  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1402  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  25.13 
 
 
534 aa  147  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.536477  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2126  ABC transporter related  25.59 
 
 
556 aa  146  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.562113  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0777  ABC transporter related  24.39 
 
 
527 aa  146  9e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.501487  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0090  oligopeptide transport ATP-binding protein  24.91 
 
 
530 aa  145  1e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5404  ABC transporter related  25.65 
 
 
544 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.235507  decreased coverage  0.00147169 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2764  ABC transporter related  28.16 
 
 
631 aa  146  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02211  ABC transporter, ATP binding component  25.09 
 
 
531 aa  146  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.393006  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3811  ABC transporter related  24.41 
 
 
563 aa  146  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.148208 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2816  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  36.75 
 
 
401 aa  145  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154881  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4500  ABC transporter related  26 
 
 
543 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.670508  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3807  ABC transporter related  25.68 
 
 
568 aa  145  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325053  hitchhiker  0.00204057 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2838  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  36.75 
 
 
401 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0106247  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1272  ABC transporter-related protein  25.71 
 
 
548 aa  145  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000618356 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  25.59 
 
 
542 aa  145  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2597  glycine betaine/L-proline ABC transporter ATP-binding protein  36.32 
 
 
401 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2549  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  36.32 
 
 
401 aa  144  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201348  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2516  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  36.32 
 
 
401 aa  144  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.87382  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1041  peptide ABC transporter ATPase  25.23 
 
 
565 aa  144  3e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.571096 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2786  glycine betaine/L-proline ABC transporter ATP-binding protein  36.32 
 
 
401 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2793  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  36.32 
 
 
401 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00688669 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4688  ABC transporter related  26.89 
 
 
533 aa  144  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678377  normal  0.275572 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0142  ABC transporter  24.13 
 
 
527 aa  144  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0028  ABC transporter related  24.32 
 
 
546 aa  144  5e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0987785  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  24.66 
 
 
578 aa  144  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0011  ABC transporter related  24.55 
 
 
553 aa  143  7e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0403  ABC transporter related  25.41 
 
 
550 aa  143  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7123  ABC transporter related  24.65 
 
 
629 aa  143  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.333209  normal  0.399658 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1510  ABC transporter related  24.73 
 
 
534 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.706226  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3130  ABC transporter related  25.45 
 
 
552 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1195  Sulfate-transporting ATPase  24.82 
 
 
552 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  25.56 
 
 
510 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3776  ABC transporter-related protein  25.18 
 
 
535 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.529237  normal  0.544592 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>