More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0857 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0857  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 
558 aa  1125    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0346  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  55.58 
 
 
572 aa  590  1e-167  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0331  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.44 
 
 
573 aa  458  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00643219  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3572  ABC transporter, ATP-binding protein  44.66 
 
 
575 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0481418 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1668  oligopeptidee ABC transporter, ATP-binding protein  40.88 
 
 
659 aa  376  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8318  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.17 
 
 
674 aa  376  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.734122 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1147  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.98 
 
 
676 aa  373  1e-102  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  39.17 
 
 
578 aa  370  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  39.45 
 
 
615 aa  369  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  38.49 
 
 
611 aa  368  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3930  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  38.15 
 
 
611 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4004  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.15 
 
 
611 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3945  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.15 
 
 
611 aa  365  1e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0762521 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0936  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.86 
 
 
615 aa  365  1e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1630  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  36.87 
 
 
712 aa  363  4e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2656  ABC transporter related  36.46 
 
 
552 aa  363  4e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0890  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.48 
 
 
690 aa  361  2e-98  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1953  glutathione import ATP-binding protein GsiA  36.08 
 
 
686 aa  360  3e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1810  ABC transporter related  40.61 
 
 
566 aa  360  3e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.295405  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  38.36 
 
 
612 aa  359  6e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0747  hypothetical protein  37.67 
 
 
602 aa  358  9.999999999999999e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1380  ABC transporter related  38.72 
 
 
539 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0115992  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2498  ABC transporter related  38.37 
 
 
544 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000299365  normal  0.0176936 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0728  hypothetical protein  37.5 
 
 
603 aa  356  5.999999999999999e-97  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4998  ABC transporter, ATPase subunit  39.15 
 
 
547 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.465618 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  38.38 
 
 
611 aa  355  8.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0502  ABC transporter related  37.59 
 
 
567 aa  354  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.348202  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2456  ABC transporter related  40.87 
 
 
566 aa  355  2e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11307  oligopeptide-transport ATP-binding protein ABC transporter oppD  37.82 
 
 
612 aa  354  2e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3115  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  37.63 
 
 
671 aa  354  2.9999999999999997e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.426861  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5592  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.97 
 
 
725 aa  353  4e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.854543  normal  0.453092 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1639  ABC peptide transporter, ATPase subunit  38.75 
 
 
543 aa  352  8e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0125273  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4781  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.68 
 
 
703 aa  352  1e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  38.09 
 
 
611 aa  352  1e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6665  ABC transporter related  37.66 
 
 
611 aa  351  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00669103 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3744  ABC transporter-like  37.48 
 
 
537 aa  351  2e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398747  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  40.11 
 
 
619 aa  351  2e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1722  ABC transporter related  38.84 
 
 
544 aa  351  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.185167  normal  0.489331 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7123  ABC transporter related  38.47 
 
 
629 aa  350  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.333209  normal  0.399658 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5116  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  38.37 
 
 
555 aa  350  4e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5970  ABC transporter related  38.87 
 
 
631 aa  350  4e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.356135 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2990  ABC transporter, ATPase subunit  39.07 
 
 
559 aa  350  5e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6371  ABC transporter related  38.66 
 
 
544 aa  350  5e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1707  ABC transporter related  38.66 
 
 
544 aa  350  5e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2259  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.91 
 
 
611 aa  349  8e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115174  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1319  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  38.69 
 
 
658 aa  348  1e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.179908  normal  0.0765459 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8315  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.16 
 
 
711 aa  348  2e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.718859 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2563  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  35.81 
 
 
571 aa  347  3e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000295279  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3806  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.06 
 
 
749 aa  347  3e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2143  ABC transporter-related protein  37.79 
 
 
549 aa  347  3e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4143  ABC transporter related  38.64 
 
 
556 aa  347  3e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.538724 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1962  ABC transporter related protein  38.8 
 
 
573 aa  347  3e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3632  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.56 
 
 
691 aa  347  4e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.208084  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4532  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.44 
 
 
736 aa  346  5e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.124709  normal  0.790856 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0918  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.57 
 
 
677 aa  347  5e-94  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.233334 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00492  ABC transporter ATPase component  34.84 
 
 
571 aa  346  7e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1252  putative phosphonate C-P lyase system protein PhnK  36.63 
 
 
629 aa  346  7e-94  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167547 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5904  ABC transporter related  38.74 
 
 
555 aa  345  8.999999999999999e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969657  normal  0.702258 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  35.11 
 
 
571 aa  345  1e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7226  ABC transporter related  37.5 
 
 
624 aa  345  1e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0885974  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3727  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.39 
 
 
665 aa  345  1e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0264  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  37.03 
 
 
527 aa  344  2e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0142  ABC transporter  36.67 
 
 
527 aa  345  2e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  36.16 
 
 
547 aa  344  2e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  38.74 
 
 
555 aa  344  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2549  ABC transporter related  38.71 
 
 
530 aa  345  2e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3646  ABC transporter related  37.08 
 
 
609 aa  344  2e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1981  ABC transporter, ATP-binding protein  38.79 
 
 
544 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000154276  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  39.47 
 
 
549 aa  344  2.9999999999999997e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3919  ABC transporter related  39.15 
 
 
543 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  37.25 
 
 
617 aa  344  2.9999999999999997e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4339  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.46 
 
 
708 aa  343  4e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.108178  normal  0.933802 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  38.68 
 
 
539 aa  343  4e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4432  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.63 
 
 
611 aa  343  5e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.62214  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4592  ABC transporter related  36.43 
 
 
629 aa  342  8e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390249  normal  0.807513 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1541  ABC transporter related  37.89 
 
 
541 aa  342  9e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2236  ATPase  37.78 
 
 
554 aa  342  1e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.274783 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  39.4 
 
 
571 aa  342  1e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4454  ABC transporter related  37.2 
 
 
619 aa  342  1e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00023315 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0561  ABC transporter for peptide ATP-binding protein  34.77 
 
 
566 aa  341  2e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0147  ABC transporter related  37.39 
 
 
624 aa  341  2.9999999999999998e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888744  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1451  ABC transporter related  37.94 
 
 
555 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3363  ABC transporter related  38.67 
 
 
542 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2226  ABC transporter related protein  36.58 
 
 
620 aa  340  4e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.993746  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  35.27 
 
 
539 aa  340  4e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  38.24 
 
 
613 aa  340  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1176  ABC transporter ATP-binding protein  40.04 
 
 
551 aa  339  5.9999999999999996e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000161898  normal  0.341996 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4015  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.02 
 
 
756 aa  339  5.9999999999999996e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0535  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.3 
 
 
725 aa  339  8e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2045  ABC transporter-like  36.94 
 
 
627 aa  339  9e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0344887  normal  0.804601 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4790  ABC transporter-like protein protein  35.99 
 
 
617 aa  339  9e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.918505  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2828  ABC transporter related  40.56 
 
 
613 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.966478  normal  0.396925 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0245  ABC transporter related  39.05 
 
 
542 aa  339  9.999999999999999e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1111  ABC transporter related  40.14 
 
 
551 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.778341 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  38 
 
 
539 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2651  ABC transporter related  38.07 
 
 
593 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0447316  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  38 
 
 
539 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1804  ABC transporter related  37.54 
 
 
537 aa  337  3.9999999999999995e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.147708 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3970  ABC transporter related  37.16 
 
 
640 aa  337  5e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1017  ABC transporter related  39.39 
 
 
551 aa  337  5e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0546481 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>