More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0255 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2344  methyl coenzyme M reductase system, component A2  75.86 
 
 		 531 aa  848    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.221384 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0255  methyl coenzyme M reductase system, component A2  100 
 
 		 540 aa  1101    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.490617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0729  hypothetical protein  65.67 
 
 		 545 aa  751    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.214117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0555  hypothetical protein  66.24 
 
 		 589 aa  763    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.688427  normal  0.0247588 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2065  ABC transporter-related protein  75.19 
 
 		 537 aa  847    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2434  ABC transporter related  75.75 
 
 		 540 aa  860    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2311  ABC transporter related  70.92 
 
 		 534 aa  820    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0707  ABC transporter, ATP-binding protein  56.37 
 
 		 537 aa  631  1e-179  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0500  ABC transporter related  56.85 
 
 		 533 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1902  ABC transporter, fused ATPase subunits  53.54 
 
 		 538 aa  596  1e-169  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.135632  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0287  ABC transporter related  51.41 
 
 		 531 aa  568  1e-161  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1643  ABC transporter related  50.66 
 
 		 531 aa  553  1e-156  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.952867  normal  0.730688 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0271  methyl coenzyme M reductase system, component A2  49.72 
 
 		 531 aa  552  1e-156  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1493  ABC transporter related  50.28 
 
 		 531 aa  549  1e-155  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.831657  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0985  ABC transporter related  49.91 
 
 		 531 aa  551  1e-155  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.144818  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0887  ABC transporter related  29.71 
 
 		 567 aa  204  2e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.324794  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0939  ABC transporter related  30.56 
 
 		 549 aa  204  3e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0858  ABC transporter related  28.67 
 
 		 549 aa  203  6e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0218323  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1040  ABC transporter related  28.48 
 
 		 549 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1779  ABC transporter related  28.81 
 
 		 549 aa  195  2e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0777  ABC transporter related  28.32 
 
 		 527 aa  194  3e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.501487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0877  ABC transporter related  29.12 
 
 		 549 aa  194  3e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00117666 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0676  methylcoenzyme M reductase system, component A2  27.59 
 
 		 584 aa  192  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1651  ABC transporter, ATPase subunit  27.75 
 
 		 573 aa  183  8.000000000000001e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1510  ABC transporter related  27.19 
 
 		 539 aa  182  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1243  ABC transporter related  25.91 
 
 		 575 aa  176  8e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0403  ABC transporter related  26.65 
 
 		 550 aa  173  7.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00492  ABC transporter ATPase component  24.23 
 
 		 571 aa  173  7.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3377  ABC transporter related  29.01 
 
 		 575 aa  172  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.169433  normal  0.0551648 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4993  ABC transporter-like  25.44 
 
 		 550 aa  171  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.703021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2207  ABC transporter related  26.34 
 
 		 549 aa  171  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252505  normal  0.194829 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2656  ABC transporter related  25.04 
 
 		 552 aa  170  6e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (dipeptide)  29 
 
 		 555 aa  167  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1646  ABC transporter-like protein protein  25.18 
 
 		 549 aa  166  9e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.495994  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  26.23 
 
 		 549 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  27.08 
 
 		 544 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4326  ABC transporter related  26.1 
 
 		 548 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0444322  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4266  ABC transporter related  25.78 
 
 		 548 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0196  ABC transporter related  25.41 
 
 		 530 aa  165  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4130  ABC transporter related  27.27 
 
 		 561 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0190  ABC transporter related  25.41 
 
 		 530 aa  165  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1305  ATPase  26.46 
 
 		 536 aa  164  3e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1642  ABC transporter related  25.71 
 
 		 538 aa  164  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7201  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  26.42 
 
 		 543 aa  164  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0277171  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5450  ABC transporter related  25.55 
 
 		 583 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0152019 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2593  ABC transporter ATP-binding protein  25.54 
 
 		 608 aa  163  7e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.170302 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3752  ABC transporter related  26.1 
 
 		 597 aa  163  9e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  26.42 
 
 		 568 aa  162  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  25.79 
 
 		 593 aa  162  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4330  putative ABC transporter, ATP-binding protein  26.34 
 
 		 540 aa  162  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  26.02 
 
 		 539 aa  162  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  25.5 
 
 		 545 aa  160  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1602  ABC transporter-like protein  27.61 
 
 		 547 aa  160  4e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7123  ABC transporter related  26.4 
 
 		 629 aa  160  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.333209  normal  0.399658 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1913  ABC transporter related protein  25.09 
 
 		 530 aa  160  6e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  26.63 
 
 		 542 aa  160  6e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  25.91 
 
 		 534 aa  160  7e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2636  ABC transporter related  27.09 
 
 		 547 aa  159  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.723017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3743  ABC transporter related  25.82 
 
 		 531 aa  159  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4797  ABC transporter related  26.33 
 
 		 565 aa  158  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.115874  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2423  ABC transporter related  27.77 
 
 		 563 aa  158  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00102758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  25.96 
 
 		 547 aa  158  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1804  ABC transporter related  26.3 
 
 		 537 aa  158  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.147708 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0245  ABC transporter related  25.54 
 
 		 542 aa  157  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3489  glutathione import ATP-binding protein GsiA  25.49 
 
 		 537 aa  157  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5181  ABC transporter related  25.5 
 
 		 573 aa  157  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal  0.292066 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3117  ABC transporter-like  26.89 
 
 		 527 aa  157  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08440  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  25.5 
 
 		 599 aa  157  5.0000000000000005e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.508486  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0502  ABC transporter related  24.35 
 
 		 567 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.348202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  25.22 
 
 		 543 aa  157  5.0000000000000005e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0011  ABC transporter related  25.63 
 
 		 553 aa  157  6e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5404  ABC transporter related  25.84 
 
 		 544 aa  157  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.235507  decreased coverage  0.00147169 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26180  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  25.93 
 
 		 575 aa  156  7e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.204743 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3811  ABC transporter related  25.41 
 
 		 563 aa  156  8e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.148208 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  25.23 
 
 		 539 aa  156  9e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19880  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  26.93 
 
 		 551 aa  156  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00329982  hitchhiker  0.000556762 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5970  ABC transporter related  26 
 
 		 631 aa  156  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.356135 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1101  ABC transporter related  26.34 
 
 		 545 aa  155  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3776  ABC transporter-related protein  25.94 
 
 		 535 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.529237  normal  0.544592 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05580  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  26.7 
 
 		 583 aa  155  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.158462  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0264  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  24.96 
 
 		 527 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2126  ABC transporter related  27.31 
 
 		 556 aa  155  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.562113  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0985  ABC transporter related protein  26.47 
 
 		 607 aa  155  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.674675  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1234  ABC transporter related  26.48 
 
 		 545 aa  155  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  25.78 
 
 		 623 aa  155  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00796  fused predicted peptide transport subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  25.65 
 
 		 612 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.885832  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5352  ABC transporter related  25.95 
 
 		 544 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.692209 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00813  hypothetical protein  25.65 
 
 		 612 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.991571  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5559  ABC transporter related  25.68 
 
 		 570 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.153225  normal  0.0799333 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2456  ABC transporter related  27.59 
 
 		 566 aa  154  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7269  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  26.94 
 
 		 614 aa  154  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4500  ABC transporter related  25.54 
 
 		 543 aa  154  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.670508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0980  glutathione transporter ATP-binding protein  24.74 
 
 		 629 aa  154  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  25.86 
 
 		 546 aa  154  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2813  ABC transporter related protein  25.65 
 
 		 623 aa  154  5e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3919  ABC transporter related  26.57 
 
 		 543 aa  154  5e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2764  ABC transporter related  28.7 
 
 		 631 aa  153  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0900  glutathione transporter ATP-binding protein  25.65 
 
 		 623 aa  153  7e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3149  ABC transporter related protein  31.06 
 
 		 587 aa  153  7e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  25.27 
 
 		 543 aa  153  8e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>