More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0500 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0707  ABC transporter, ATP-binding protein  62.38 
 
 		 537 aa  684    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1902  ABC transporter, fused ATPase subunits  60.75 
 
 		 538 aa  676    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.135632  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0500  ABC transporter related  100 
 
 		 533 aa  1078    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2065  ABC transporter-related protein  56.53 
 
 		 537 aa  615  1e-175  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2311  ABC transporter related  57.04 
 
 		 534 aa  617  1e-175  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2434  ABC transporter related  56.39 
 
 		 540 aa  608  1e-173  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2344  methyl coenzyme M reductase system, component A2  56.98 
 
 		 531 aa  606  9.999999999999999e-173  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.221384 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0271  methyl coenzyme M reductase system, component A2  52.92 
 
 		 531 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0729  hypothetical protein  56.72 
 
 		 545 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.214117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0255  methyl coenzyme M reductase system, component A2  56.85 
 
 		 540 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.490617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0555  hypothetical protein  54.9 
 
 		 589 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.688427  normal  0.0247588 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1643  ABC transporter related  53.3 
 
 		 531 aa  596  1e-169  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.952867  normal  0.730688 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0287  ABC transporter related  54.41 
 
 		 531 aa  597  1e-169  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0985  ABC transporter related  53.3 
 
 		 531 aa  593  1e-168  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.144818  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1493  ABC transporter related  51.13 
 
 		 531 aa  587  1e-166  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.831657  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0939  ABC transporter related  29.87 
 
 		 549 aa  229  1e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1779  ABC transporter related  29.24 
 
 		 549 aa  227  3e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0877  ABC transporter related  29.86 
 
 		 549 aa  226  8e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00117666 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0887  ABC transporter related  32.4 
 
 		 567 aa  224  2e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.324794  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0858  ABC transporter related  28.98 
 
 		 549 aa  223  9.999999999999999e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0218323  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1651  ABC transporter, ATPase subunit  29.73 
 
 		 573 aa  219  7.999999999999999e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1040  ABC transporter related  29.08 
 
 		 549 aa  219  7.999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (dipeptide)  29.79 
 
 		 555 aa  181  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1794  ABC transporter related  30.47 
 
 		 550 aa  179  8e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.224756 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  27.61 
 
 		 593 aa  177  5e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3377  ABC transporter related  28.81 
 
 		 575 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.169433  normal  0.0551648 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7123  ABC transporter related  27.41 
 
 		 629 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.333209  normal  0.399658 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  28.18 
 
 		 549 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0676  methylcoenzyme M reductase system, component A2  31.59 
 
 		 584 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5450  ABC transporter related  28.78 
 
 		 583 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0152019 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5181  ABC transporter related  28.84 
 
 		 573 aa  171  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal  0.292066 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2656  ABC transporter related  25.04 
 
 		 552 aa  169  8e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  25.83 
 
 		 571 aa  169  9e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  28.26 
 
 		 542 aa  169  9e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4688  ABC transporter related  28.7 
 
 		 533 aa  168  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678377  normal  0.275572 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  28.34 
 
 		 568 aa  169  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2636  ABC transporter related  27.34 
 
 		 547 aa  168  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.723017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5970  ABC transporter related  27.12 
 
 		 631 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.356135 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1646  ABC transporter-like protein protein  27.71 
 
 		 549 aa  167  2.9999999999999998e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.495994  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1402  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  26.61 
 
 		 534 aa  167  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.536477  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0245  ABC transporter related  26.3 
 
 		 542 aa  167  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  26.73 
 
 		 615 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1755  ABC transporter  27.84 
 
 		 536 aa  166  8e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0108432 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2758  AAA ATPase  28.39 
 
 		 532 aa  166  8e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2563  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  26.02 
 
 		 571 aa  166  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000295279  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1243  ABC transporter related  25.09 
 
 		 575 aa  165  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0434  ABC transporter related  25.85 
 
 		 522 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2905  ABC transporter  27.34 
 
 		 525 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0701  peptide ABC transporter ATPase  27.21 
 
 		 543 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  27.74 
 
 		 539 aa  164  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2386  peptide ABC transporter  29.09 
 
 		 536 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3220  ABC transporter, ATP-binding protein  29.6 
 
 		 539 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16500  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  28.52 
 
 		 531 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.892768  normal  0.399532 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1813  ABC transporter related  27.12 
 
 		 545 aa  164  4.0000000000000004e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3404  ABC transporter related  27.14 
 
 		 543 aa  164  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.455946 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7201  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  28.01 
 
 		 543 aa  164  5.0000000000000005e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0277171  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3394  ABC transporter related  27.14 
 
 		 543 aa  164  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  27.26 
 
 		 539 aa  164  5.0000000000000005e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3456  ABC transporter related  27.14 
 
 		 543 aa  164  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0542416  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3752  ABC transporter related  29.3 
 
 		 597 aa  163  6e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3860  ABC transporter related  27.58 
 
 		 531 aa  163  8.000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0561  ABC transporter for peptide ATP-binding protein  25.48 
 
 		 566 aa  163  8.000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0292  ABC transporter foroligopeptide/dipeptide ATP-binding protein  25.05 
 
 		 530 aa  163  9e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1913  ABC transporter related protein  26.61 
 
 		 530 aa  162  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0800  ABC transporter related  28.23 
 
 		 540 aa  162  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.614188  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3776  ABC transporter-related protein  28.44 
 
 		 535 aa  162  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.529237  normal  0.544592 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  27.13 
 
 		 612 aa  161  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0264  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  27.34 
 
 		 527 aa  161  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1540  ABC transporter related  26.68 
 
 		 533 aa  161  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7051  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  26.49 
 
 		 545 aa  161  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2576  ABC transporter related protein  26.71 
 
 		 601 aa  161  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0615694 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2014  ABC transporter related  28.6 
 
 		 534 aa  161  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0103436  normal  0.550427 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0529  ABC transporter related  28.15 
 
 		 533 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.328091 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1915  ABC transporter related  26.86 
 
 		 545 aa  160  4e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3720  ABC transporter, ATP-binding protein  27.66 
 
 		 536 aa  160  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59645  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0658  ABC peptide transporter  27.14 
 
 		 533 aa  160  5e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2356  ABC transporter related  27.04 
 
 		 543 aa  160  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.10022 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  27.82 
 
 		 545 aa  160  6e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5559  ABC transporter related  25.98 
 
 		 570 aa  160  7e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.153225  normal  0.0799333 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1642  ABC transporter related  26.56 
 
 		 538 aa  159  8e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3032  peptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  26.29 
 
 		 525 aa  159  8e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158001  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0142  ABC transporter  26.96 
 
 		 527 aa  159  8e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5294  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  26.54 
 
 		 549 aa  160  8e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26421  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3919  ABC transporter related  27.34 
 
 		 543 aa  159  8e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4993  ABC transporter-like  26.94 
 
 		 550 aa  159  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.703021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3261  ABC transporter related protein  26.96 
 
 		 554 aa  159  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12190  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  29.58 
 
 		 516 aa  159  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1504  ABC transporter related  28.94 
 
 		 914 aa  159  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1269  ABC transporter related  28.88 
 
 		 559 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6562  ABC transporter related  28.88 
 
 		 559 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6168  ABC transporter related  29.07 
 
 		 559 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282987  normal  0.0147704 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1268  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  28.72 
 
 		 540 aa  159  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0006  ABC transporter, ATP-binding protein  25.41 
 
 		 541 aa  157  4e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3744  ABC transporter-like  27.29 
 
 		 537 aa  157  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  28.65 
 
 		 510 aa  157  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3434  ABC transporter related  28.11 
 
 		 536 aa  157  4e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.560851 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37840  putative ATP-binding component of ABC transporter  26.11 
 
 		 536 aa  157  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000360917  normal  0.225303 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0006  ABC transporter, ATP-binding protein  25.41 
 
 		 550 aa  157  4e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0296287  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  24.01 
 
 		 578 aa  157  6e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2269  ABC transporter related  27.52 
 
 		 532 aa  157  6e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973177  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>