More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0729 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0729  hypothetical protein  100 
 
 		 545 aa  1108    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.214117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2344  methyl coenzyme M reductase system, component A2  62.9 
 
 		 531 aa  716    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.221384 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2434  ABC transporter related  66.17 
 
 		 540 aa  767    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0555  hypothetical protein  78.89 
 
 		 589 aa  892    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.688427  normal  0.0247588 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0255  methyl coenzyme M reductase system, component A2  65.67 
 
 		 540 aa  751    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.490617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2311  ABC transporter related  65.05 
 
 		 534 aa  756    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2065  ABC transporter-related protein  64.86 
 
 		 537 aa  740    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0500  ABC transporter related  56.72 
 
 		 533 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0707  ABC transporter, ATP-binding protein  52.87 
 
 		 537 aa  594  1e-168  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1902  ABC transporter, fused ATPase subunits  52.64 
 
 		 538 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.135632  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0271  methyl coenzyme M reductase system, component A2  49.06 
 
 		 531 aa  545  1e-154  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0985  ABC transporter related  48.87 
 
 		 531 aa  543  1e-153  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.144818  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1643  ABC transporter related  48.31 
 
 		 531 aa  535  1e-151  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.952867  normal  0.730688 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1493  ABC transporter related  47.29 
 
 		 531 aa  529  1e-149  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.831657  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0287  ABC transporter related  47.93 
 
 		 531 aa  527  1e-148  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1779  ABC transporter related  28.26 
 
 		 549 aa  224  3e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0877  ABC transporter related  28 
 
 		 549 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00117666 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1040  ABC transporter related  27.76 
 
 		 549 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0858  ABC transporter related  27.56 
 
 		 549 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0218323  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0939  ABC transporter related  27.76 
 
 		 549 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0887  ABC transporter related  27.4 
 
 		 567 aa  192  9e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.324794  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0676  methylcoenzyme M reductase system, component A2  25.67 
 
 		 584 aa  181  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4993  ABC transporter-like  25.56 
 
 		 550 aa  170  6e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.703021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1651  ABC transporter, ATPase subunit  29.79 
 
 		 573 aa  169  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1646  ABC transporter-like protein protein  26.51 
 
 		 549 aa  168  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.495994  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7191  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  27.42 
 
 		 564 aa  168  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453207  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2452  ABC transporter related  25.73 
 
 		 571 aa  163  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000520728 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1305  ATPase  24.56 
 
 		 536 aa  160  4e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1510  ABC transporter related  25.46 
 
 		 539 aa  161  4e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1794  ABC transporter related  25.35 
 
 		 550 aa  161  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.224756 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  24.96 
 
 		 555 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0777  ABC transporter related  24.19 
 
 		 527 aa  157  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.501487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0502  ABC transporter related  24.07 
 
 		 567 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.348202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4266  ABC transporter related  24.36 
 
 		 548 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4326  ABC transporter related  24.55 
 
 		 548 aa  157  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0444322  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3130  ABC transporter related  25.5 
 
 		 552 aa  157  6e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  27.59 
 
 		 510 aa  157  6e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2563  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  22.59 
 
 		 571 aa  157  6e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000295279  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3489  glutathione import ATP-binding protein GsiA  24.65 
 
 		 537 aa  156  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  24.91 
 
 		 545 aa  155  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0942  ABC transporter related  26.35 
 
 		 551 aa  155  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.337051  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  25.05 
 
 		 534 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7172  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  26.57 
 
 		 547 aa  154  5.9999999999999996e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.892646  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1755  ABC transporter  25.85 
 
 		 536 aa  153  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0108432 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  25.58 
 
 		 539 aa  153  8.999999999999999e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3220  ABC transporter, ATP-binding protein  24.35 
 
 		 539 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2574  ABC transporter related  25.77 
 
 		 552 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3603  ABC transporter related protein  25.85 
 
 		 518 aa  152  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.449109  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  24.01 
 
 		 568 aa  152  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0264  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  24.11 
 
 		 527 aa  151  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1642  ABC transporter related  24.03 
 
 		 538 aa  151  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1217  ABC transporter related  23.94 
 
 		 540 aa  151  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322449  normal  0.502892 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0247  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  24.29 
 
 		 542 aa  151  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  25.09 
 
 		 547 aa  150  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0245  ABC transporter related  25.56 
 
 		 542 aa  150  6e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0292  ABC transporter foroligopeptide/dipeptide ATP-binding protein  23.32 
 
 		 530 aa  150  6e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  25.3 
 
 		 543 aa  150  7e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0751  ABC transporter related  24.22 
 
 		 557 aa  150  7e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0142  ABC transporter  24.68 
 
 		 527 aa  149  9e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3154  ABC transporter-related protein  25.86 
 
 		 557 aa  149  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5368  ABC transporter, ATPase subunit  24.12 
 
 		 540 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3919  ABC transporter related  24.87 
 
 		 543 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3722  ABC transporter related  24.27 
 
 		 535 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00680128  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0006  ABC transporter, ATP-binding protein  23.9 
 
 		 541 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4449  ABC transporter related  24.68 
 
 		 545 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.875798 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0011  ABC transporter related  24.42 
 
 		 553 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1913  ABC transporter related protein  23.21 
 
 		 530 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2057  ABC transporter related  24.38 
 
 		 537 aa  148  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0471715  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0006  ABC transporter, ATP-binding protein  23.9 
 
 		 550 aa  147  3e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0296287  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0035  ABC transporter related  27.31 
 
 		 543 aa  148  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.806878  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2721  ABC transporter related  24.87 
 
 		 564 aa  148  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.496484  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26180  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  24.22 
 
 		 575 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.204743 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3363  ABC transporter related  24.47 
 
 		 542 aa  147  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4150  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  24.39 
 
 		 534 aa  147  6e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.971322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4835  putative ABC transporter ATP-binding protein  24.7 
 
 		 572 aa  146  8.000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.671613 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05580  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  27.54 
 
 		 583 aa  146  9e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.158462  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  25.09 
 
 		 542 aa  146  9e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1715  ABC transporter related  24.64 
 
 		 535 aa  146  9e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  23.63 
 
 		 593 aa  146  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2636  ABC transporter related  24.65 
 
 		 547 aa  146  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.723017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  24.61 
 
 		 543 aa  146  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1961  ABC transporter related  24.3 
 
 		 540 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.323177  normal  0.323319 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41160  putative ATP-binding component of ABC transporter  24.6 
 
 		 536 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18010  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  24.32 
 
 		 568 aa  145  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.527166  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1041  peptide ABC transporter ATPase  23.42 
 
 		 565 aa  145  2e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.571096 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0090  oligopeptide transport ATP-binding protein  24.74 
 
 		 530 aa  145  2e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1639  ABC peptide transporter, ATPase subunit  24.83 
 
 		 543 aa  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0125273  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2091  ABC transporter related  23.95 
 
 		 540 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.160498  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  24.86 
 
 		 510 aa  145  2e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5404  ABC transporter related  24.69 
 
 		 544 aa  145  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.235507  decreased coverage  0.00147169 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2549  ABC transporter related  24.29 
 
 		 530 aa  144  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0857  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  24.62 
 
 		 558 aa  144  3e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1804  ABC transporter related  26.01 
 
 		 537 aa  144  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.147708 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1054  ABC transporter related  25.14 
 
 		 563 aa  144  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.763117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29680  ABC transporter, ATP binding component  25.87 
 
 		 537 aa  144  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0246021  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0346  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  24.34 
 
 		 572 aa  144  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4135  ABC transporter related  24.05 
 
 		 545 aa  144  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3475  ABC transporter related  24.77 
 
 		 536 aa  144  5e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6018  ABC transporter related  23.77 
 
 		 540 aa  144  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.685553  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4851  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.32 
 
 		 546 aa  144  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.508729  normal  0.466263 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>