More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0676 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0676  methylcoenzyme M reductase system, component A2  100 
 
 		 584 aa  1190    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1651  ABC transporter, ATPase subunit  65.05 
 
 		 573 aa  771    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0887  ABC transporter related  50.96 
 
 		 567 aa  537  1e-151  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.324794  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0858  ABC transporter related  44.95 
 
 		 549 aa  478  1e-133  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0218323  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1779  ABC transporter related  44.95 
 
 		 549 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1040  ABC transporter related  44.25 
 
 		 549 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0877  ABC transporter related  43.75 
 
 		 549 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00117666 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0939  ABC transporter related  43.46 
 
 		 549 aa  463  1e-129  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0271  methyl coenzyme M reductase system, component A2  28.5 
 
 		 531 aa  226  8e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0287  ABC transporter related  29.3 
 
 		 531 aa  226  1e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0985  ABC transporter related  28.6 
 
 		 531 aa  225  2e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.144818  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2311  ABC transporter related  29.08 
 
 		 534 aa  224  3e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1643  ABC transporter related  28.6 
 
 		 531 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.952867  normal  0.730688 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0707  ABC transporter, ATP-binding protein  27.87 
 
 		 537 aa  219  8.999999999999998e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1902  ABC transporter, fused ATPase subunits  28.76 
 
 		 538 aa  218  2e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.135632  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1493  ABC transporter related  28.74 
 
 		 531 aa  216  8e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.831657  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2065  ABC transporter-related protein  29.03 
 
 		 537 aa  209  1e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0255  methyl coenzyme M reductase system, component A2  27.59 
 
 		 540 aa  192  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.490617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2344  methyl coenzyme M reductase system, component A2  26.54 
 
 		 531 aa  191  4e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.221384 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0555  hypothetical protein  26.07 
 
 		 589 aa  182  2e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.688427  normal  0.0247588 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0729  hypothetical protein  25.67 
 
 		 545 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.214117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2434  ABC transporter related  27.93 
 
 		 540 aa  178  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0500  ABC transporter related  31.59 
 
 		 533 aa  174  5e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  27.94 
 
 		 541 aa  158  3e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2784  ABC transporter related  24.73 
 
 		 535 aa  156  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.026139  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18700  ABC transporter, ATP binding component  26.57 
 
 		 542 aa  150  6e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106187  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2758  AAA ATPase  25.48 
 
 		 532 aa  150  9e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3752  ABC transporter related  24.88 
 
 		 597 aa  150  9e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  24.96 
 
 		 576 aa  149  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3220  ABC transporter, ATP-binding protein  25.12 
 
 		 539 aa  146  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1541  ABC transporter related  25.62 
 
 		 541 aa  145  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3154  ABC transporter-related protein  24.14 
 
 		 557 aa  144  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26180  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  23.94 
 
 		 575 aa  144  4e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.204743 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3776  ABC transporter-related protein  25.91 
 
 		 535 aa  144  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.529237  normal  0.544592 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37840  putative ATP-binding component of ABC transporter  26.02 
 
 		 536 aa  144  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000360917  normal  0.225303 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3394  ABC transporter related  25.47 
 
 		 543 aa  143  7e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3456  ABC transporter related  25.47 
 
 		 543 aa  143  7e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0542416  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3404  ABC transporter related  25.47 
 
 		 543 aa  143  7e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.455946 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7191  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  23.63 
 
 		 564 aa  142  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453207  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5970  ABC transporter related  23.9 
 
 		 631 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.356135 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0292  ABC transporter foroligopeptide/dipeptide ATP-binding protein  22.88 
 
 		 530 aa  142  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1540  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  24.33 
 
 		 562 aa  141  3e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.20129  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7123  ABC transporter related  23.9 
 
 		 629 aa  140  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.333209  normal  0.399658 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0331  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  25.94 
 
 		 573 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00643219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3403  ABC transporter related  25.04 
 
 		 538 aa  139  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3149  ABC transporter related protein  25.43 
 
 		 587 aa  139  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7201  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  23.95 
 
 		 543 aa  138  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0277171  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7172  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  24.73 
 
 		 547 aa  137  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.892646  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2423  ABC transporter related  24.4 
 
 		 563 aa  137  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00102758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5413  ABC transporter related  24.22 
 
 		 557 aa  137  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.5929 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3482  ABC transporter related  24.03 
 
 		 563 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2915  ABC transporter related  23.81 
 
 		 540 aa  137  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0265985  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03560  ABC-type dipeptide transport system, ATPase component  24.01 
 
 		 564 aa  137  8e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3919  ABC transporter related  25.35 
 
 		 543 aa  136  9e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2314  ABC transporter related  23.96 
 
 		 536 aa  136  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.399989  normal  0.717185 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1250  methionine import ATP-binding protein MetN  34.84 
 
 		 318 aa  136  9.999999999999999e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1233  methionine import ATP-binding protein MetN  34.48 
 
 		 340 aa  136  9.999999999999999e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4592  ABC transporter related  23.01 
 
 		 629 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390249  normal  0.807513 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3117  ABC transporter-like  24.27 
 
 		 527 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5368  ABC transporter, ATPase subunit  23.35 
 
 		 540 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  26.59 
 
 		 557 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  26.76 
 
 		 510 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  24.63 
 
 		 568 aa  135  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4177  ABC transporter related  24.25 
 
 		 561 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2269  ABC transporter related  23.64 
 
 		 532 aa  135  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16200  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  25.17 
 
 		 532 aa  134  3.9999999999999996e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.758879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2965  ABC transporter  35.16 
 
 		 265 aa  134  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0568085  normal  0.400951 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0534  ABC transporter related protein  33.46 
 
 		 328 aa  134  5e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1075  methionine import ATP-binding protein MetN  34.65 
 
 		 318 aa  134  6e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2116  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  23.22 
 
 		 553 aa  134  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1407  ABC transporter related  23.02 
 
 		 550 aa  134  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288538  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2689  ABC transporter related protein  25.29 
 
 		 530 aa  133  7.999999999999999e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0292  ABC transporter related  32.2 
 
 		 339 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02211  ABC transporter, ATP binding component  24.29 
 
 		 531 aa  133  9e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.393006  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1272  ABC transporter-related protein  23.61 
 
 		 548 aa  132  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000618356 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0358  ABC transporter, ATP-binding protein  32.33 
 
 		 339 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3032  peptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  24.3 
 
 		 525 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158001  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1838  ABC transporter related  23.26 
 
 		 556 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1395  ABC transporter related  37.5 
 
 		 337 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  25.44 
 
 		 539 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1217  ABC transporter related  23.37 
 
 		 540 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322449  normal  0.502892 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0644  ABC transporter, ATP-binding protein  34.22 
 
 		 318 aa  132  2.0000000000000002e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0341  ABC transporter, ATP-binding protein  32.33 
 
 		 339 aa  131  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0343  ABC transporter, ATP-binding protein  31.44 
 
 		 339 aa  131  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0264  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  23.5 
 
 		 527 aa  131  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0297  ABC transporter ATP-binding protein  31.44 
 
 		 339 aa  131  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5904  ABC transporter related  23.22 
 
 		 555 aa  131  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969657  normal  0.702258 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0312  ABC transporter ATP-binding protein  31.44 
 
 		 339 aa  131  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0385  ABC transporter, ATP-binding protein  32.33 
 
 		 339 aa  131  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15540  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  22.92 
 
 		 616 aa  131  3e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2143  ABC transporter-related protein  25.22 
 
 		 549 aa  131  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6423  ABC transporter related  24.1 
 
 		 543 aa  131  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0849413  normal  0.0525416 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0281  ABC transporter, ATP-binding protein  31.76 
 
 		 339 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0284  ABC transporter, ATP-binding protein  32.33 
 
 		 339 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1149  ABC transporter related  24.26 
 
 		 546 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.108293 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6018  ABC transporter related  23.18 
 
 		 540 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.685553  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0560  ABC transporter related  25.09 
 
 		 542 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000861738  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2059  ABC transporter related  23.18 
 
 		 540 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0427547  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0967  ABC transporter ATP-binding protein  34.3 
 
 		 322 aa  130  5.0000000000000004e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2078  ABC transporter related  22.84 
 
 		 540 aa  130  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0240438  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>