More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0121 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0121  ABC transporter related protein  100 
 
 
539 aa  1093    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0051  ABC transporter related  57.44 
 
 
535 aa  596  1e-169  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2054  ABC transporter related  50.95 
 
 
533 aa  539  9.999999999999999e-153  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.204676  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0414  sugar transport ATP-binding protein  42.16 
 
 
528 aa  436  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2827  ABC transporter related  38.1 
 
 
537 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  37.82 
 
 
494 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  35.92 
 
 
496 aa  336  5.999999999999999e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38 
 
 
501 aa  326  7e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12280  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  39.42 
 
 
505 aa  324  3e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.171798  normal  0.428152 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  37.81 
 
 
501 aa  322  9.000000000000001e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  37.57 
 
 
513 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  37.67 
 
 
505 aa  320  3e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  37.48 
 
 
513 aa  320  6e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  35.91 
 
 
501 aa  318  1e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  36.15 
 
 
499 aa  318  2e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3073  ABC transporter related  38.39 
 
 
508 aa  317  3e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  37.09 
 
 
495 aa  317  3e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0783  ABC transporter related  39.08 
 
 
558 aa  317  4e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3125  ABC transporter related  37.43 
 
 
495 aa  316  5e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  34.49 
 
 
501 aa  316  7e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3604  ABC transporter related  38.42 
 
 
513 aa  316  8e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.88039  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  34.49 
 
 
501 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  35.84 
 
 
501 aa  315  9.999999999999999e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0343  ABC transporter related  39.1 
 
 
497 aa  315  9.999999999999999e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  34.49 
 
 
501 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3977  D-ribose transporter ATP binding protein  35.65 
 
 
501 aa  315  9.999999999999999e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2524  ABC transporter related  35.33 
 
 
505 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  34.57 
 
 
516 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.777457 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  34.49 
 
 
501 aa  315  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  34.67 
 
 
516 aa  315  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  34.67 
 
 
516 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  34.67 
 
 
516 aa  315  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0544  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
521 aa  314  1.9999999999999998e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  34.49 
 
 
501 aa  315  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  34.49 
 
 
501 aa  315  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4245  D-ribose transporter ATP binding protein  34.49 
 
 
501 aa  314  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0036959 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  36.63 
 
 
501 aa  314  2.9999999999999996e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4165  D-ribose transporter ATP binding protein  34.68 
 
 
501 aa  313  4.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.846402  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5185  D-ribose transporter ATP binding protein  34.49 
 
 
501 aa  313  4.999999999999999e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0631054  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  35.65 
 
 
497 aa  313  5.999999999999999e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  35.07 
 
 
501 aa  313  6.999999999999999e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  35.52 
 
 
511 aa  313  6.999999999999999e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3051  ABC transporter related  37.74 
 
 
511 aa  313  6.999999999999999e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  36.14 
 
 
500 aa  312  7.999999999999999e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0515  D-ribose transporter ATP binding protein  35.47 
 
 
501 aa  312  1e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  36.64 
 
 
513 aa  312  1e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5155  ABC transporter related  37.48 
 
 
512 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1317  ABC transporter related  38.07 
 
 
525 aa  311  2.9999999999999997e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_004310  BR0542  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.84 
 
 
511 aa  310  4e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.146804  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4115  D-ribose transporter ATP binding protein  34.87 
 
 
501 aa  310  4e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.684938  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1859  ABC transporter related  34.69 
 
 
499 aa  309  9e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0906  ABC sugar transporter, ATPase subunit  36.4 
 
 
517 aa  309  9e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0350072 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0157  ABC transporter related  36.52 
 
 
507 aa  309  9e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  36.84 
 
 
524 aa  308  1.0000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  34.68 
 
 
501 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0341  D-ribose transporter ATP binding protein  35.09 
 
 
501 aa  308  1.0000000000000001e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  37.6 
 
 
495 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  35.87 
 
 
492 aa  308  2.0000000000000002e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  34.44 
 
 
494 aa  307  3e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  34.44 
 
 
494 aa  307  3e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  36.74 
 
 
512 aa  307  3e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  34.44 
 
 
494 aa  307  3e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  34.38 
 
 
494 aa  307  3e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2599  ABC transporter-like  39.62 
 
 
491 aa  306  6e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.766453  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  35.25 
 
 
516 aa  306  6e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  34.31 
 
 
517 aa  306  7e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3406  ABC transporter related  37.63 
 
 
507 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.551553  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  34.82 
 
 
494 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  34.09 
 
 
501 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1634  ABC transporter related  37.38 
 
 
527 aa  305  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  34.24 
 
 
494 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1873  sugar transport ATP-binding protein  35.83 
 
 
515 aa  304  2.0000000000000002e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0103225 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25750  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  38.23 
 
 
522 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342553  normal  0.485424 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  35.63 
 
 
499 aa  304  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  35.63 
 
 
499 aa  304  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1781  ABC transporter related  36.48 
 
 
503 aa  304  3.0000000000000004e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000368661  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  36.62 
 
 
504 aa  304  3.0000000000000004e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  34.95 
 
 
496 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2244  ABC transporter related  37.11 
 
 
495 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141236  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1703  ABC transporter related protein  33.84 
 
 
504 aa  304  3.0000000000000004e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  34.24 
 
 
494 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2138  L-arabinose transport ATP-binding protein araG  36.59 
 
 
516 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.960653  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3044  ABC transporter related  35.58 
 
 
515 aa  303  4.0000000000000003e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2972  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  35.58 
 
 
515 aa  303  5.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  33.72 
 
 
496 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  35.94 
 
 
503 aa  303  5.000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  34.24 
 
 
494 aa  303  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  35.57 
 
 
497 aa  303  7.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1667  ABC transporter related  36.24 
 
 
507 aa  303  7.000000000000001e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.2144  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1425  ABC transporter related  36.19 
 
 
530 aa  302  8.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.577416  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  35.53 
 
 
501 aa  301  1e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0391  ABC transporter related protein  36.56 
 
 
499 aa  302  1e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.302991  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  34.31 
 
 
500 aa  300  3e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3176  ABC transporter related  36.43 
 
 
517 aa  300  5e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.111078  normal  0.67189 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  33.91 
 
 
501 aa  300  6e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3041  ABC transporter related protein  33.46 
 
 
511 aa  299  7e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0614  ABC transporter related  35.62 
 
 
511 aa  299  9e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1998  ABC ribose transporter, fused ATPase subunits  38.28 
 
 
532 aa  299  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0790932  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3675  ABC sugar transporter, ATPase subunit  36.52 
 
 
495 aa  298  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.973573  normal  0.0920445 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0738  ABC transporter related  35.25 
 
 
505 aa  299  1e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>