More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0414 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0414  sugar transport ATP-binding protein  100 
 
 		 528 aa  1075    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2827  ABC transporter related  50.28 
 
 		 537 aa  528  1e-148  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0051  ABC transporter related  44.55 
 
 		 535 aa  452  1.0000000000000001e-126  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2054  ABC transporter related  43.86 
 
 		 533 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.204676  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0121  ABC transporter related protein  42.16 
 
 		 539 aa  436  1e-121  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1667  ABC transporter related  37.8 
 
 		 507 aa  297  4e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.2144  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  36.24 
 
 		 505 aa  295  2e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  34.73 
 
 		 496 aa  294  3e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  35.13 
 
 		 497 aa  293  4e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0544  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  35 
 
 		 521 aa  280  3e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5155  ABC transporter related  33.73 
 
 		 512 aa  280  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2577  ABC transporter related  35.97 
 
 		 507 aa  280  5e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1177  ABC transporter related  34.42 
 
 		 509 aa  279  1e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0906  ABC sugar transporter, ATPase subunit  31.68 
 
 		 517 aa  277  3e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0350072 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19490  ABC transporter related  33.72 
 
 		 509 aa  277  3e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.524485  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2069  ABC transporter related protein  34.42 
 
 		 508 aa  276  5e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3948  ABC transporter related  31.08 
 
 		 504 aa  275  1.0000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718752 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0157  ABC transporter related  34.52 
 
 		 507 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0542  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  34.6 
 
 		 511 aa  275  2.0000000000000002e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.146804  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1781  ABC transporter related  33.71 
 
 		 503 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000368661  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1986  ABC transporter related  36.65 
 
 		 511 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08780  ABC transporter related  33.72 
 
 		 513 aa  273  4.0000000000000004e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000334619  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3041  ABC transporter related protein  33.4 
 
 		 511 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3406  ABC transporter related  34.34 
 
 		 507 aa  273  5.000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.551553  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  32.42 
 
 		 506 aa  273  5.000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1986  ABC transporter related  35.29 
 
 		 501 aa  273  5.000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.437257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  33.4 
 
 		 504 aa  273  6e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1703  ABC transporter related protein  34.12 
 
 		 504 aa  273  7e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0380  ABC transporter related  32.74 
 
 		 544 aa  273  8.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0402  ABC transporter related  33.78 
 
 		 509 aa  272  1e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.351513  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0343  ABC transporter related  34.32 
 
 		 497 aa  271  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1303  ABC transporter related  32.31 
 
 		 506 aa  271  1e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0296697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0783  ABC transporter related  32.12 
 
 		 558 aa  271  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1410  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  35.61 
 
 		 510 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0297132  hitchhiker  0.00935726 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1188  ABC transporter related  33.27 
 
 		 511 aa  270  4e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.909394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0808  ABC transporter related  33.01 
 
 		 604 aa  270  5.9999999999999995e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4341  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  32.54 
 
 		 544 aa  270  7e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  34.77 
 
 		 494 aa  269  8.999999999999999e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1949  ABC transporter, ATP-binding protein  33.78 
 
 		 507 aa  269  1e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.740579  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0839  ABC transporter related  33.59 
 
 		 515 aa  269  1e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500489  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  32.48 
 
 		 525 aa  269  1e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1792  ABC transporter related  35.57 
 
 		 494 aa  268  1e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0113555  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0032  ABC transporter related  31.36 
 
 		 512 aa  269  1e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3174  ABC transporter related  33.33 
 
 		 512 aa  268  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4192  ABC transporter related protein  32.96 
 
 		 545 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2913  ABC transporter related  33.14 
 
 		 512 aa  267  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169153  normal  0.630322 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3073  ABC transporter related  32.68 
 
 		 508 aa  267  4e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6710  ABC transporter, ATP binding subunit (putative high-affinity D-ribose transport)  33.07 
 
 		 507 aa  266  5e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11533  normal  0.0914748 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1153  ABC transporter related  34.79 
 
 		 510 aa  266  8.999999999999999e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  34.85 
 
 		 502 aa  265  1e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  32.35 
 
 		 496 aa  265  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0372  ABC transporter related  33.4 
 
 		 509 aa  265  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3450  ABC transporter related protein  33.59 
 
 		 496 aa  265  1e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0752  ABC transporter related  32.25 
 
 		 551 aa  265  1e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.971835  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0017  ABC transporter related  32.7 
 
 		 507 aa  266  1e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3176  ABC transporter related  33.4 
 
 		 517 aa  264  2e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.111078  normal  0.67189 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  33.47 
 
 		 503 aa  265  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2746  ABC transporter related  31.5 
 
 		 524 aa  264  2e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1181  ABC transporter related  32.88 
 
 		 520 aa  265  2e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000288216 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2945  ABC transporter related  32.94 
 
 		 541 aa  265  2e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.854224 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2442  ABC transporter-related protein  34.33 
 
 		 510 aa  264  3e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0142053  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04900  ATPase component of uncharacterized ABC-type transporter  32.2 
 
 		 532 aa  264  3e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3889  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  35.04 
 
 		 510 aa  264  4e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.228489  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  32.81 
 
 		 495 aa  263  4e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0421  ABC transporter related  34.03 
 
 		 510 aa  263  4e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0207744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4769  ABC transporter related  30.3 
 
 		 494 aa  263  4e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.132101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3604  ABC transporter related  32.09 
 
 		 513 aa  263  4.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.88039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1607  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  34.18 
 
 		 528 aa  263  6e-69  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2089  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 514 aa  263  6e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25750  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  31.29 
 
 		 522 aa  263  6e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342553  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3235  ABC transporter related  32.88 
 
 		 506 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.365394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5263  ABC transporter related  31.92 
 
 		 530 aa  263  6.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.417586  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2519  ABC transporter related protein  31.51 
 
 		 515 aa  263  8e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.760037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0384  ABC transporter related  32.22 
 
 		 509 aa  263  8e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0697  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  33.39 
 
 		 536 aa  263  8e-69  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3402  ABC transporter related protein  31.85 
 
 		 522 aa  263  8e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.146962 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3532  ABC transporter, ATP-binding protein  35.23 
 
 		 510 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3926  sugar ABC transporter ATP-binding protein  35.23 
 
 		 510 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0557636  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  33.86 
 
 		 497 aa  262  8.999999999999999e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  31.49 
 
 		 514 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  31.68 
 
 		 514 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  31.49 
 
 		 514 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  33.07 
 
 		 495 aa  263  8.999999999999999e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  33.33 
 
 		 495 aa  262  8.999999999999999e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3642  sugar ABC transporter ATP-binding protein  35.42 
 
 		 508 aa  262  1e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3218  ABC transporter-related protein  31.07 
 
 		 503 aa  262  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0134521 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0239  ABC transporter related protein  32.43 
 
 		 512 aa  261  2e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.301252  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3550  ABC transporter, ATP-binding protein  35.23 
 
 		 510 aa  261  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0119888  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  31.36 
 
 		 523 aa  261  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1046  ABC transporter related  33.14 
 
 		 521 aa  261  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1586  ABC transporter related  33.98 
 
 		 513 aa  261  2e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.192443  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3825  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  34.53 
 
 		 510 aa  260  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37688  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0757  ABC transporter related protein  31.12 
 
 		 525 aa  261  3e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0933075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3838  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  34.53 
 
 		 510 aa  260  3e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3803  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  35.04 
 
 		 510 aa  261  3e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000201894 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0955  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  32.5 
 
 		 511 aa  260  5.0000000000000005e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3660  ABC transporter related  33.6 
 
 		 512 aa  260  5.0000000000000005e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2025  ABC transporter related  32.09 
 
 		 519 aa  260  5.0000000000000005e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1634  ABC transporter related  32.51 
 
 		 527 aa  260  5.0000000000000005e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3166  ABC transporter related  32.03 
 
 		 500 aa  260  5.0000000000000005e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>