More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2827 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_2827  ABC transporter related  100 
 
 
537 aa  1080    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0414  sugar transport ATP-binding protein  50.28 
 
 
528 aa  528  1e-148  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0051  ABC transporter related  44.67 
 
 
535 aa  430  1e-119  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2054  ABC transporter related  42.08 
 
 
533 aa  427  1e-118  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.204676  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0121  ABC transporter related protein  38.1 
 
 
539 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4192  ABC transporter related protein  32.35 
 
 
545 aa  302  9e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  36.8 
 
 
497 aa  299  8e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2738  ABC transporter related protein  33.59 
 
 
520 aa  297  3e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  35.83 
 
 
495 aa  297  3e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1781  ABC transporter related  33.2 
 
 
503 aa  296  9e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000368661  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5155  ABC transporter related  31.82 
 
 
512 aa  295  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  35.76 
 
 
492 aa  294  3e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0783  ABC transporter related  31.3 
 
 
558 aa  291  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  33.4 
 
 
501 aa  291  2e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  34.45 
 
 
494 aa  291  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  35.38 
 
 
505 aa  291  3e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0808  ABC transporter related  32.77 
 
 
604 aa  291  3e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  34.02 
 
 
496 aa  289  8e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  32.83 
 
 
492 aa  289  1e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  36.86 
 
 
503 aa  288  1e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2089  ABC transporter related protein  33.66 
 
 
514 aa  288  2e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  33.46 
 
 
497 aa  287  2.9999999999999996e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0825  ABC transporter related  32.76 
 
 
527 aa  286  5.999999999999999e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.523889  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0402  ABC transporter related  34.47 
 
 
509 aa  286  7e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.351513  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  32.57 
 
 
495 aa  286  7e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  34.97 
 
 
494 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  33.98 
 
 
501 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0995  ABC transporter related protein  32.1 
 
 
534 aa  285  1.0000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  32.38 
 
 
498 aa  285  1.0000000000000001e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0752  ABC transporter related  32.09 
 
 
551 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.971835  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1607  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  34.07 
 
 
528 aa  285  2.0000000000000002e-75  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  30.09 
 
 
505 aa  283  6.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3235  ABC transporter related  33.83 
 
 
506 aa  282  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.365394  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2524  ABC transporter related  34.3 
 
 
505 aa  282  1e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0157  ABC transporter related  35.03 
 
 
507 aa  281  3e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  34.89 
 
 
499 aa  280  4e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09550  ABC transporter related  36.24 
 
 
500 aa  280  4e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.58805  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0921  ABC transporter related  35.69 
 
 
496 aa  280  4e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  34.65 
 
 
502 aa  280  5e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04900  ATPase component of uncharacterized ABC-type transporter  30.96 
 
 
532 aa  280  7e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1177  ABC transporter related  33.64 
 
 
509 aa  279  1e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0544  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  34.18 
 
 
521 aa  279  1e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25750  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  31.41 
 
 
522 aa  279  1e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342553  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2946  ABC transporter related  31.16 
 
 
527 aa  278  2e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000498253 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  29.96 
 
 
523 aa  278  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1425  ABC transporter related  34.05 
 
 
530 aa  278  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.577416  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3406  ABC transporter related  34.77 
 
 
507 aa  277  3e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.551553  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0768  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.47 
 
 
496 aa  277  3e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000105666  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1138  ABC transporter related  31.79 
 
 
547 aa  277  3e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2803  ABC transporter related  31.84 
 
 
501 aa  277  3e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.508475  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  31.91 
 
 
525 aa  277  4e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1620  ABC transporter related  33.27 
 
 
493 aa  277  4e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08780  ABC transporter related  32.56 
 
 
513 aa  277  4e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000334619  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0227  ABC transporter related  34.46 
 
 
507 aa  276  6e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1986  ABC transporter related  34.23 
 
 
511 aa  276  8e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  32.09 
 
 
514 aa  276  8e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2069  ABC transporter related protein  32.96 
 
 
508 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  31.82 
 
 
505 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  32.02 
 
 
501 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  32.58 
 
 
499 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  32.58 
 
 
499 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  28.81 
 
 
499 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0372  ABC transporter related  33.59 
 
 
509 aa  274  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1667  ABC transporter related  33.9 
 
 
507 aa  274  3e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.2144  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1792  ABC transporter related  34.87 
 
 
494 aa  274  3e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0113555  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1860  xylose ABC transporter ATPase  33.58 
 
 
517 aa  274  3e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.05268  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0614  ABC transporter related  32.44 
 
 
511 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  32.55 
 
 
517 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  31.63 
 
 
501 aa  274  4.0000000000000004e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  32.1 
 
 
525 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  34.22 
 
 
495 aa  273  5.000000000000001e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  31.83 
 
 
501 aa  273  5.000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1452  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  32.57 
 
 
506 aa  273  6e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00705254  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3977  D-ribose transporter ATP binding protein  32.02 
 
 
501 aa  273  6e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0542  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  33.79 
 
 
511 aa  273  7e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.146804  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  31.83 
 
 
501 aa  273  8.000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  32.64 
 
 
501 aa  272  9e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  31.53 
 
 
506 aa  272  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  32.42 
 
 
507 aa  272  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2326  ABC transporter related protein  33.21 
 
 
501 aa  272  1e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  33.9 
 
 
501 aa  271  1e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2746  ABC transporter related  31.08 
 
 
524 aa  271  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2863  ABC transporter related  33.02 
 
 
518 aa  272  1e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.18747  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2138  L-arabinose transport ATP-binding protein araG  31.64 
 
 
516 aa  272  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.960653  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6710  ABC transporter, ATP binding subunit (putative high-affinity D-ribose transport)  32.68 
 
 
507 aa  272  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11533  normal  0.0914748 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1153  ABC transporter related  34.27 
 
 
510 aa  272  1e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3660  ABC transporter related  34.04 
 
 
512 aa  271  2e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  31.65 
 
 
511 aa  271  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  31.19 
 
 
507 aa  271  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  32.46 
 
 
504 aa  271  2.9999999999999997e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  33.9 
 
 
501 aa  271  2.9999999999999997e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4115  D-ribose transporter ATP binding protein  31.72 
 
 
501 aa  271  2.9999999999999997e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.684938  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0839  ABC transporter related  32.02 
 
 
515 aa  270  4e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500489  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0800  ABC transporter related  32.62 
 
 
509 aa  270  4e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  32.42 
 
 
507 aa  270  4e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  31.52 
 
 
501 aa  270  4e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  31.52 
 
 
501 aa  270  5e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  31.52 
 
 
501 aa  270  5e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  31.52 
 
 
501 aa  270  5e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  31.52 
 
 
501 aa  270  5e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>