More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4341 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4341  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  100 
 
 		 544 aa  1088    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0380  ABC transporter related  97.06 
 
 		 544 aa  1037    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2025  ABC transporter related  59.56 
 
 		 519 aa  561  1e-158  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4739  ABC transporter related  55.85 
 
 		 497 aa  544  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.383875  hitchhiker  0.00325994 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4365  ABC transporter related  50.19 
 
 		 585 aa  479  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.309192  normal  0.0851247 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6222  sugar ABC transporter ATP-binding protein  48.5 
 
 		 503 aa  449  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.597291 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1224  ABC transporter related  44.09 
 
 		 510 aa  451  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1987  ABC transporter related  44.82 
 
 		 500 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.063033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1987  ABC transporter related  44.82 
 
 		 499 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.479214  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2074  ABC transporter related  44.82 
 
 		 499 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.144534  hitchhiker  0.0000031172 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0983  ABC transporter related  45.11 
 
 		 501 aa  439  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2148  ABC transporter related  43.91 
 
 		 499 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.123365  normal  0.259949 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1854  ABC transporter related  49.8 
 
 		 505 aa  441  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.99038  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  43.31 
 
 		 497 aa  437  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0969  ABC transporter related  45.45 
 
 		 500 aa  436  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0413  ABC transporter related  46.44 
 
 		 500 aa  436  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2058  ABC transporter related  43.29 
 
 		 499 aa  435  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2128  putative ABC transporter ATP-binding protein  46.28 
 
 		 516 aa  437  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4909  ABC transporter related  46.45 
 
 		 505 aa  433  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.368986  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04097  predicted sugar transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  45.82 
 
 		 500 aa  431  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3765  ABC transporter related protein  45.82 
 
 		 500 aa  430  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04061  hypothetical protein  45.82 
 
 		 500 aa  431  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4228  ABC transporter related protein  44.65 
 
 		 506 aa  429  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2370  ABC sugar transporter, ATPase subunit  48.45 
 
 		 518 aa  430  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3782  ABC transporter related  45.82 
 
 		 500 aa  429  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4038  ABC transporter related  44.65 
 
 		 506 aa  432  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5049  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  44.9 
 
 		 512 aa  429  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2215  ABC transporter related  47.89 
 
 		 509 aa  429  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0215537  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2238  ABC transporter related  47.89 
 
 		 504 aa  429  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4798  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.82 
 
 		 500 aa  428  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4706  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.82 
 
 		 500 aa  426  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.706122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0148  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  46.02 
 
 		 496 aa  428  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.361964  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0767  putative sugar uptake ABC transporter ATP-binding protein  43.57 
 
 		 501 aa  426  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.162932 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4067  ABC transporter related  46.02 
 
 		 496 aa  428  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0476  putative sugar ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  46.02 
 
 		 496 aa  428  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.251819  normal  0.0934917 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4482  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.82 
 
 		 500 aa  428  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1048  ABC transporter related  46.64 
 
 		 506 aa  428  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1721  ABC transporter related  45.71 
 
 		 507 aa  425  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0492105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2119  ABC transporter related  45.75 
 
 		 504 aa  421  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.307687  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1905  ABC transporter related  45.31 
 
 		 507 aa  421  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308353  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  43.78 
 
 		 497 aa  420  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3534  ABC transporter related  42.16 
 
 		 523 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.116696 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6482  ABC transporter related  46.89 
 
 		 504 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.611957  normal  0.251961 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6194  ABC transporter related  46.86 
 
 		 504 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5925  ABC transporter related  46.86 
 
 		 504 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.737944  normal  0.893001 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5962  ABC transporter related  46.32 
 
 		 503 aa  413  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0248969 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5626  ABC transporter related  46.89 
 
 		 504 aa  415  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000841006  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0420  ABC transporter related protein  45.51 
 
 		 507 aa  412  1e-114  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  40.73 
 
 		 500 aa  413  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5991  ABC transporter related  46.89 
 
 		 504 aa  415  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122815  normal  0.14883 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  41.94 
 
 		 501 aa  410  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0046  sugar ABC transporter ATPase  42.12 
 
 		 513 aa  409  1e-113  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0138528  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4096  ABC transporter related  44.81 
 
 		 525 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  44.1 
 
 		 504 aa  411  1e-113  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4208  ABC transporter related  44.81 
 
 		 525 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.577364  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3040  ABC transporter related protein  45 
 
 		 529 aa  411  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2251  ABC transporter-related protein  45.45 
 
 		 511 aa  409  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.687423  hitchhiker  0.00000468234 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  42.66 
 
 		 501 aa  407  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  42.07 
 
 		 517 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0279  ABC transporter related  43.29 
 
 		 526 aa  408  1.0000000000000001e-112  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.60123  normal  0.12609 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2524  ABC transporter related  42.57 
 
 		 505 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  42.45 
 
 		 501 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  41.26 
 
 		 494 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01030  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  43.84 
 
 		 522 aa  404  1e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  39.88 
 
 		 496 aa  405  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  42.45 
 
 		 501 aa  404  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4767  ABC transporter-related protein  44.66 
 
 		 503 aa  400  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.883977 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  42.97 
 
 		 507 aa  397  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  39.4 
 
 		 494 aa  396  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.4 
 
 		 494 aa  396  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.6 
 
 		 494 aa  396  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1417  ABC transporter related  43.48 
 
 		 515 aa  398  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.441776  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2343  ATP binding protein of ABC transporter  47.06 
 
 		 502 aa  398  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.97 
 
 		 507 aa  397  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  42.97 
 
 		 507 aa  397  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.4 
 
 		 494 aa  396  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  44.38 
 
 		 508 aa  395  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1920  ABC transporter related  43.31 
 
 		 526 aa  396  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.528555  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0515  D-ribose transporter ATP binding protein  41.93 
 
 		 501 aa  394  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  41.13 
 
 		 501 aa  392  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  41.65 
 
 		 506 aa  394  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5517  ABC transporter related  44.96 
 
 		 516 aa  395  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.422457  normal  0.0683787 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.4 
 
 		 494 aa  395  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  38.82 
 
 		 494 aa  394  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  41.13 
 
 		 501 aa  392  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  39 
 
 		 496 aa  395  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4656  ABC transporter related protein  45.24 
 
 		 506 aa  394  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479751 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  41.34 
 
 		 506 aa  392  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5185  D-ribose transporter ATP binding protein  41.13 
 
 		 501 aa  390  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0631054  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  41.13 
 
 		 501 aa  392  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4165  D-ribose transporter ATP binding protein  41.41 
 
 		 501 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.846402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  43.09 
 
 		 495 aa  390  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1371  D-ribose transporter ATP binding protein  40.12 
 
 		 504 aa  390  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.6 
 
 		 494 aa  390  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4245  D-ribose transporter ATP binding protein  40.93 
 
 		 501 aa  389  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0036959 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3977  D-ribose transporter ATP binding protein  41.33 
 
 		 501 aa  392  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  41.13 
 
 		 501 aa  392  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  41.13 
 
 		 501 aa  392  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.8 
 
 		 494 aa  391  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  41.13 
 
 		 501 aa  391  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>