More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0051 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0051  ABC transporter related  100 
 
 
535 aa  1074    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2054  ABC transporter related  59.21 
 
 
533 aa  634  1e-180  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.204676  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0121  ABC transporter related protein  57.44 
 
 
539 aa  596  1e-169  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0414  sugar transport ATP-binding protein  44.55 
 
 
528 aa  452  1.0000000000000001e-126  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2827  ABC transporter related  44.67 
 
 
537 aa  430  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  37.86 
 
 
496 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5155  ABC transporter related  39.6 
 
 
512 aa  320  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  38.39 
 
 
497 aa  319  7.999999999999999e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3406  ABC transporter related  38.32 
 
 
507 aa  313  5.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.551553  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  36.93 
 
 
501 aa  311  1e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0544  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.93 
 
 
521 aa  311  2e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  38.37 
 
 
494 aa  310  4e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1667  ABC transporter related  39.81 
 
 
507 aa  308  1.0000000000000001e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.2144  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  37.52 
 
 
505 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19490  ABC transporter related  37.26 
 
 
509 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.524485  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3604  ABC transporter related  37.74 
 
 
513 aa  307  3e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.88039  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1317  ABC transporter related  38.11 
 
 
525 aa  307  4.0000000000000004e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1620  ABC transporter related  38.36 
 
 
493 aa  306  6e-82  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1662  ABC transporter related  35.59 
 
 
503 aa  306  6e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0101569  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0542  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.77 
 
 
511 aa  306  9.000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.146804  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12280  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  37.6 
 
 
505 aa  305  1.0000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.171798  normal  0.428152 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1933  ABC transporter related protein  34.67 
 
 
503 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0512785  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3073  ABC transporter related  37.67 
 
 
508 aa  304  3.0000000000000004e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  37.36 
 
 
505 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  37.02 
 
 
501 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  36.87 
 
 
492 aa  303  6.000000000000001e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  37.12 
 
 
513 aa  303  7.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0157  ABC transporter related  38.33 
 
 
507 aa  302  1e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  37.12 
 
 
501 aa  300  4e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3948  ABC transporter related  37.71 
 
 
504 aa  300  6e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00718752 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  36.7 
 
 
497 aa  299  8e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  35.77 
 
 
494 aa  298  1e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  37.48 
 
 
514 aa  299  1e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  38.39 
 
 
499 aa  298  1e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  35.96 
 
 
494 aa  298  2e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4192  ABC transporter related protein  36.84 
 
 
545 aa  298  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  38.31 
 
 
495 aa  298  2e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0783  ABC transporter related  36.61 
 
 
558 aa  298  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1236  ABC transporter related  38.37 
 
 
520 aa  297  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154748  normal  0.642442 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1584  ABC transporter related  39 
 
 
537 aa  297  4e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.133672  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  35.77 
 
 
494 aa  296  5e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  35.77 
 
 
494 aa  296  5e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  35.77 
 
 
494 aa  296  5e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  36.22 
 
 
501 aa  296  5e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  36.64 
 
 
495 aa  296  5e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  35.94 
 
 
496 aa  296  5e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3125  ABC transporter related  35.99 
 
 
495 aa  296  6e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  35.84 
 
 
501 aa  296  6e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3051  ABC transporter related  35.99 
 
 
511 aa  296  7e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0906  ABC sugar transporter, ATPase subunit  35.15 
 
 
517 aa  296  7e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0350072 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1127  ABC transporter related  39.19 
 
 
537 aa  296  8e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.071444  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1607  ABC transporter related  39.19 
 
 
537 aa  296  8e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.111484  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  38.49 
 
 
499 aa  295  1e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25750  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  37.04 
 
 
522 aa  295  1e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342553  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  35.95 
 
 
499 aa  295  1e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  36.67 
 
 
503 aa  295  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1792  ABC transporter related  38.27 
 
 
494 aa  295  1e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0113555  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1634  ABC transporter related  37.08 
 
 
527 aa  294  2e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1425  ABC transporter related  36.38 
 
 
517 aa  295  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3218  ABC transporter-related protein  35.06 
 
 
503 aa  295  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0134521 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3977  D-ribose transporter ATP binding protein  35.96 
 
 
501 aa  295  2e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1998  ABC ribose transporter, fused ATPase subunits  38.06 
 
 
532 aa  294  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0790932  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3176  ABC transporter related  36.59 
 
 
517 aa  293  4e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.111078  normal  0.67189 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  36.38 
 
 
495 aa  293  4e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1465  ABC transporter related  36.19 
 
 
517 aa  293  4e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.748698  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0391  ABC transporter related protein  36.02 
 
 
499 aa  293  4e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.302991  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2301  xylose transporter ATP-binding subunit  34.58 
 
 
518 aa  293  5e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.538906  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  35.31 
 
 
492 aa  293  6e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  37.14 
 
 
500 aa  293  6e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  35.38 
 
 
501 aa  293  6e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  35.38 
 
 
494 aa  293  6e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1703  ABC transporter related protein  36.03 
 
 
504 aa  293  7e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1668  ABC transporter-like protein  34.77 
 
 
529 aa  293  8e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0834819  normal  0.0616705 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1188  ABC transporter related  36.91 
 
 
511 aa  293  8e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.909394  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  36.94 
 
 
494 aa  292  9e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1711  ABC transporter related  36.75 
 
 
517 aa  292  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0318504 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3415  xylose transporter ATP-binding subunit  34.79 
 
 
511 aa  292  1e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.055967  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2863  ABC transporter related  36.94 
 
 
518 aa  292  1e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.18747  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4746  ABC sugar transporter, ATPase subunit  38.33 
 
 
537 aa  291  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16753  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  38.05 
 
 
503 aa  292  1e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2474  D-xylose ABC transporter, ATP-binding protein  38.04 
 
 
515 aa  291  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1063  ABC transporter related  36.38 
 
 
517 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627623  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1543  ABC transporter related  36.38 
 
 
517 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0849155  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  34.75 
 
 
496 aa  290  3e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1551  sugar ABC transporter ATP-binding protein  37.95 
 
 
511 aa  291  3e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.048612  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1519  ABC transporter related  36.19 
 
 
517 aa  291  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0747025  normal  0.022294 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1523  ABC transporter related  38.03 
 
 
537 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.686144  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2885  xylose transporter ATP-binding subunit  34.18 
 
 
518 aa  290  4e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.700201  normal  0.945677 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0372  ABC transporter related  36.43 
 
 
509 aa  290  4e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1504  ABC transporter related  38.03 
 
 
537 aa  290  4e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.170489  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2326  ABC transporter related protein  36.08 
 
 
501 aa  290  4e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  35.58 
 
 
494 aa  290  6e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  35.19 
 
 
494 aa  290  6e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1920  ABC transporter-like  38.74 
 
 
517 aa  290  6e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4850  ABC transporter related  35.99 
 
 
503 aa  290  6e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616228  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0154  xylose transporter ATP-binding subunit  35.74 
 
 
513 aa  290  6e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  35.43 
 
 
513 aa  289  7e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1586  ABC transporter related  37.28 
 
 
513 aa  289  8e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.192443  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2315  ABC transporter related  34.29 
 
 
503 aa  289  8e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0829639  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  35.4 
 
 
504 aa  289  9e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>