More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1998 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2455  ribose ABC transporter ATP-binding protein  73.47 
 
 		 524 aa  744    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.785166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3235  ABC transporter related  74.66 
 
 		 517 aa  748    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3491  ABC transporter related  74.46 
 
 		 517 aa  747    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2368  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  72.34 
 
 		 517 aa  736    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.696414  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2152  ABC transporter  72.15 
 
 		 517 aa  741    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3345  ribose transport protein RbsA  73.68 
 
 		 510 aa  732    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121309  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2020  ABC transporter, ATP-binding protein  74.52 
 
 		 548 aa  719    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.48203  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1920  ABC transporter-like  75.29 
 
 		 517 aa  751    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4746  ABC sugar transporter, ATPase subunit  79.6 
 
 		 537 aa  753    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16753  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4158  ABC transporter related  79.24 
 
 		 537 aa  801    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.605809 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2474  D-xylose ABC transporter, ATP-binding protein  75.2 
 
 		 515 aa  730    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1998  ABC ribose transporter, fused ATPase subunits  100 
 
 		 532 aa  1051    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0790932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0574  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  79.81 
 
 		 536 aa  805    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1957  ABC transporter related  73.29 
 
 		 517 aa  734    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45423  normal  0.0285383 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1127  ABC transporter related  81.06 
 
 		 537 aa  759    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.071444  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1504  ABC transporter related  78.18 
 
 		 537 aa  741    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.170489  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1523  ABC transporter related  78.99 
 
 		 537 aa  748    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.686144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39330  ribose transporter  74.07 
 
 		 510 aa  711    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.683009  normal  0.485398 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2262  ABC transporter related  95.49 
 
 		 532 aa  1009    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1607  ABC transporter related  81.06 
 
 		 537 aa  759    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.111484  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1584  ABC transporter related  81.06 
 
 		 537 aa  761    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.133672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1236  ABC transporter related  87.5 
 
 		 520 aa  872    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154748  normal  0.642442 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1855  putative ribose ABC transporter, ATP-binding protein  74.52 
 
 		 523 aa  719    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1868  putative ribose ABC transporter, ATP-binding protein  74.52 
 
 		 523 aa  719    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1630  ABC transporter related  78.97 
 
 		 534 aa  768    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0881  ABC transporter related  59.77 
 
 		 526 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.218523  normal  0.474832 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0946  ABC transporter related  60.23 
 
 		 526 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0516195  normal  0.0273292 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1016  ABC transporter ATP-binding protein  61.31 
 
 		 523 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.339278 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4197  ABC transporter-related protein  56.29 
 
 		 521 aa  527  1e-148  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4637  ABC transporter related  55.82 
 
 		 539 aa  525  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2132  ABC transporter related  51.82 
 
 		 555 aa  514  1e-144  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  50.1 
 
 		 516 aa  429  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  48.31 
 
 		 514 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  48.24 
 
 		 514 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  44.36 
 
 		 513 aa  415  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  48.24 
 
 		 514 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  47.01 
 
 		 515 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  46.61 
 
 		 520 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  47.02 
 
 		 517 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  43.06 
 
 		 501 aa  403  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  46.79 
 
 		 495 aa  404  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3125  ABC transporter related  46.06 
 
 		 495 aa  403  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  46.05 
 
 		 514 aa  400  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  44.87 
 
 		 497 aa  397  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  43.14 
 
 		 497 aa  395  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2474  ABC transporter related  43.53 
 
 		 513 aa  394  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4335  ABC transporter related  44.53 
 
 		 511 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.975481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  43.14 
 
 		 524 aa  390  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.75 
 
 		 512 aa  388  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3088  ABC transporter related  42.13 
 
 		 512 aa  387  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0116674  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  43.81 
 
 		 514 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2524  ABC transporter related  43.35 
 
 		 505 aa  385  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  42.77 
 
 		 494 aa  385  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  44.33 
 
 		 513 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4598  ABC transporter related  43.7 
 
 		 506 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0392025 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  41 
 
 		 494 aa  382  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41 
 
 		 494 aa  382  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.8 
 
 		 494 aa  379  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  39.8 
 
 		 496 aa  381  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41 
 
 		 494 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2492  ABC transporter related protein  41 
 
 		 498 aa  380  1e-104  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  43.8 
 
 		 512 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  43.98 
 
 		 513 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  43.8 
 
 		 512 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41 
 
 		 494 aa  382  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  42.71 
 
 		 499 aa  375  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  40.12 
 
 		 494 aa  375  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3279  ABC transporter related  41.94 
 
 		 505 aa  379  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.2 
 
 		 494 aa  377  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.6 
 
 		 492 aa  377  1e-103  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3104  ABC transporter related protein  43.53 
 
 		 511 aa  375  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  40.6 
 
 		 496 aa  378  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  40.64 
 
 		 501 aa  376  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  43.23 
 
 		 504 aa  375  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  41.92 
 
 		 503 aa  376  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  42.71 
 
 		 499 aa  375  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  40.24 
 
 		 496 aa  378  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1134  ABC transporter related  40.12 
 
 		 506 aa  372  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000497905  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2398  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.77 
 
 		 509 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.64453  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2372  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.47 
 
 		 507 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179136  normal  0.245048 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01050  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  44.34 
 
 		 540 aa  373  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.2 
 
 		 494 aa  374  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.4 
 
 		 494 aa  375  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  44.2 
 
 		 512 aa  371  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1338  ABC transporter, ATP-binding protein  40.96 
 
 		 497 aa  369  1e-101  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.375231 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  44.82 
 
 		 499 aa  369  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  40 
 
 		 492 aa  372  1e-101  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  43.43 
 
 		 861 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3601  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.6 
 
 		 508 aa  372  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611963  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2639  L-arabinose ABC transporter, ATP-binding protein  42.28 
 
 		 507 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0558785  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4600  ABC transporter related  43.31 
 
 		 513 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.911905 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  43.4 
 
 		 508 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0667  ribose ABC transporter ATP-binding protein  41.67 
 
 		 461 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09550  ABC transporter related  40.87 
 
 		 500 aa  366  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.58805  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  42.26 
 
 		 495 aa  367  1e-100  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  42.35 
 
 		 511 aa  367  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1964  ABC transporter related  43.11 
 
 		 513 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.962291 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2246  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.18 
 
 		 511 aa  366  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000548441 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  42.62 
 
 		 506 aa  365  1e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  43.33 
 
 		 508 aa  364  2e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>