45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3581 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3581  thymidylate kinase  100 
 
 		 236 aa  463  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3961  thymidylate kinase  84.58 
 
 		 237 aa  333  2e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.057611  normal  0.564595 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2353  thymidylate kinase  44.21 
 
 		 204 aa  135  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.972554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3422  thymidylate kinase  36.1 
 
 		 203 aa  85.9  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0056  thymidylate kinase  34.43 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1253  thymidylate kinase  27.94 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  24.63 
 
 		 206 aa  52.8  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0156  dTMP kinase  26.34 
 
 		 196 aa  52.4  0.000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  23.92 
 
 		 206 aa  52  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  29.27 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  25.6 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  25.26 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1092  thymidylate kinase  24.88 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.733791  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1354  thymidylate kinase  21.74 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  28.16 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0144  dTMP kinase  28.57 
 
 		 204 aa  48.5  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.049684 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1350  thymidylate kinase  20.29 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0683  thymidylate kinase  28.96 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1026  dTMP kinase  29.95 
 
 		 254 aa  47.4  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0126  thymidylate kinase  29.1 
 
 		 193 aa  47  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2120  thymidylate kinase  30.96 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000730162  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  23.2 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1673  thymidylate kinase  23.86 
 
 		 201 aa  47  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01491  thymidylate kinase  23.81 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0344  thymidylate kinase  25.85 
 
 		 196 aa  46.2  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1638  thymidylate kinase  23.81 
 
 		 219 aa  46.2  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0229  thymidylate kinase  25.16 
 
 		 202 aa  46.2  0.0005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0139482  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1098  thymidylate kinase  21.15 
 
 		 205 aa  46.2  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1020  thymidylate kinase  29.65 
 
 		 205 aa  45.4  0.0007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.232447  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2993  thymidylate kinase  33.52 
 
 		 210 aa  45.4  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.207274 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  28.99 
 
 		 202 aa  45.4  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0980  thymidylate kinase / thymidylate synthase  25.85 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.653916  normal  0.0681105 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0006  dTMP kinase  27.83 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00242626  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0456  thymidylate kinase  24.17 
 
 		 197 aa  44.7  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  28.57 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01471  thymidylate kinase  25.59 
 
 		 212 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.702638  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2796  Thymidylate kinase-like protein  29.46 
 
 		 603 aa  43.9  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2144  dTMP kinase  32.24 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  28.04 
 
 		 222 aa  43.1  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  22.33 
 
 		 217 aa  42.4  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5092  thymidylate kinase-like  26.03 
 
 		 230 aa  42.4  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0780  thymidylate kinase  22.7 
 
 		 202 aa  42.4  0.006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0922  dTMP kinase  26.7 
 
 		 207 aa  42  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0787  dTMP kinase  23.11 
 
 		 207 aa  42  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  30.73 
 
 		 213 aa  42  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>