74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3961 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3961  thymidylate kinase  100 
 
 		 237 aa  461  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.057611  normal  0.564595 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3581  thymidylate kinase  85.71 
 
 		 236 aa  333  2e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2353  thymidylate kinase  44.74 
 
 		 204 aa  136  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.972554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3422  thymidylate kinase  39.79 
 
 		 203 aa  96.7  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0056  thymidylate kinase  37.75 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1253  thymidylate kinase  30.14 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1841  thymidylate kinase  26.98 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0126  thymidylate kinase  31.16 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0156  dTMP kinase  27.27 
 
 		 196 aa  57  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2993  thymidylate kinase  34.1 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.207274 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0683  thymidylate kinase  29.86 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1026  dTMP kinase  31.44 
 
 		 254 aa  54.7  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  26.24 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2144  dTMP kinase  32.31 
 
 		 199 aa  54.3  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2120  thymidylate kinase  32.34 
 
 		 202 aa  53.5  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000730162  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1673  thymidylate kinase  27.23 
 
 		 201 aa  52.4  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  28.11 
 
 		 216 aa  52  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  29.38 
 
 		 214 aa  52  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0144  dTMP kinase  28.5 
 
 		 204 aa  51.6  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.049684 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  31.92 
 
 		 225 aa  51.6  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1638  thymidylate kinase  26.07 
 
 		 219 aa  50.4  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1092  thymidylate kinase  26.9 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.733791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  24.52 
 
 		 206 aa  49.7  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  26.73 
 
 		 207 aa  49.3  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0547  thymidylate kinase  24.75 
 
 		 199 aa  49.3  0.00005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1098  thymidylate kinase  23.94 
 
 		 205 aa  49.3  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  26.47 
 
 		 219 aa  48.9  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  24.29 
 
 		 197 aa  49.3  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02510  Thymidylate kinase  33.93 
 
 		 189 aa  48.9  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  26.7 
 
 		 206 aa  48.5  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2796  Thymidylate kinase-like protein  30.11 
 
 		 603 aa  48.9  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  27.11 
 
 		 222 aa  48.1  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0456  thymidylate kinase  25.71 
 
 		 197 aa  48.1  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  27.09 
 
 		 205 aa  48.1  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  26.7 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  30.58 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0145  thymidylate kinase  27.36 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289209 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  28.91 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0980  thymidylate kinase / thymidylate synthase  27.62 
 
 		 213 aa  46.2  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.653916  normal  0.0681105 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0922  dTMP kinase  28.43 
 
 		 207 aa  46.6  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1788  thymidylate kinase  26.24 
 
 		 203 aa  46.2  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000115787  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  28.36 
 
 		 202 aa  46.2  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1020  thymidylate kinase  27.92 
 
 		 205 aa  46.2  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.232447  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1726  thymidylate kinase  31.38 
 
 		 217 aa  46.2  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  28.1 
 
 		 206 aa  45.4  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0512  thymidylate kinase  27.8 
 
 		 208 aa  45.4  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  27.5 
 
 		 212 aa  45.4  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1354  thymidylate kinase  21.26 
 
 		 212 aa  45.4  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1334  thymidylate kinase  27.42 
 
 		 198 aa  45.4  0.0008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.648721  normal  0.0540228 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  25.47 
 
 		 203 aa  45.4  0.0009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3591  thymidylate kinase  30.14 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.389295 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1654  thymidylate kinase  30.85 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.969892  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  31.07 
 
 		 686 aa  43.9  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  28.36 
 
 		 207 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  27.59 
 
 		 197 aa  44.3  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  29.28 
 
 		 206 aa  43.5  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0787  dTMP kinase  23.3 
 
 		 207 aa  43.5  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  27.96 
 
 		 217 aa  43.1  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  29.35 
 
 		 211 aa  43.5  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3232  dTMP kinase  29.8 
 
 		 226 aa  43.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  29.15 
 
 		 218 aa  43.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  28.04 
 
 		 216 aa  43.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0240  thymidylate kinase  27.7 
 
 		 224 aa  42.7  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.644878  normal  0.218016 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1350  thymidylate kinase  20.29 
 
 		 212 aa  42.7  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1194  dTMP kinase  25.48 
 
 		 205 aa  42.7  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2063  thymidylate kinase  30.15 
 
 		 209 aa  42.7  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.615627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  26.32 
 
 		 199 aa  42.7  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1510  dTMP kinase  25.52 
 
 		 219 aa  42.4  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08213  thymidylate and uridylate kinase (Eurofung)  24.26 
 
 		 223 aa  42.4  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.271873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0006  dTMP kinase  27.45 
 
 		 215 aa  42  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00242626  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2629  thymidylate kinase  27.5 
 
 		 206 aa  42  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  32.84 
 
 		 207 aa  42  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  21.66 
 
 		 217 aa  41.6  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0229  thymidylate kinase  25.45 
 
 		 202 aa  41.6  0.01  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0139482  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>