27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3422 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3422  thymidylate kinase  100 
 
 
203 aa  400  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0056  thymidylate kinase  56.28 
 
 
206 aa  187  8e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3961  thymidylate kinase  39.79 
 
 
237 aa  96.7  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.057611  normal  0.564595 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2353  thymidylate kinase  35.23 
 
 
204 aa  87  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.972554  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3581  thymidylate kinase  36.06 
 
 
236 aa  85.9  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0156  dTMP kinase  26.04 
 
 
196 aa  55.1  0.0000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0128  dTMP kinase  25.71 
 
 
200 aa  53.1  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000012015  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0126  thymidylate kinase  24.35 
 
 
193 aa  53.1  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1026  dTMP kinase  27.92 
 
 
254 aa  52  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1841  thymidylate kinase  23.16 
 
 
189 aa  50.4  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1726  thymidylate kinase  28.07 
 
 
217 aa  50.4  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0357  thymidylate kinase  24.53 
 
 
198 aa  50.1  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0456  thymidylate kinase  25.12 
 
 
197 aa  48.5  0.00007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0144  dTMP kinase  25.49 
 
 
204 aa  47.8  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.049684 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1654  thymidylate kinase  26.9 
 
 
217 aa  47.8  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.969892  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02510  Thymidylate kinase  32.99 
 
 
189 aa  46.6  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1167  thymidylate kinase-like protein  27.12 
 
 
217 aa  45.8  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  27.11 
 
 
703 aa  45.8  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1194  dTMP kinase  26.53 
 
 
205 aa  45.4  0.0006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  31.07 
 
 
197 aa  44.7  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2513  Thymidylate kinase-like protein  25.34 
 
 
230 aa  44.7  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0024  thymidylate kinase  23.87 
 
 
227 aa  43.1  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000063864  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1020  thymidylate kinase  26.7 
 
 
205 aa  42.4  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.232447  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0512  thymidylate kinase  25.59 
 
 
208 aa  42  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  27.35 
 
 
705 aa  42  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2796  Thymidylate kinase-like protein  29.15 
 
 
603 aa  42  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2144  dTMP kinase  53.85 
 
 
199 aa  41.6  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>