21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1167 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1167  thymidylate kinase-like protein  100 
 
 		 217 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2642  thymidylate kinase  28.71 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0156  dTMP kinase  31.03 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2567  thymidylate kinase  27.27 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0661134  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0144  dTMP kinase  23.7 
 
 		 204 aa  53.5  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.049684 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1194  dTMP kinase  23.7 
 
 		 205 aa  49.3  0.00005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0962  thymidylate kinase  27.23 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0126  thymidylate kinase  23.39 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1841  thymidylate kinase  23.27 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2566  dTMP kinase  26.67 
 
 		 228 aa  46.2  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00171931  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3422  thymidylate kinase  27.12 
 
 		 203 aa  45.8  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2585  hypothetical protein  23.3 
 
 		 205 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.633344 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1726  thymidylate kinase  24.28 
 
 		 217 aa  45.4  0.0006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2643  dTMP kinase  27.43 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0300  dTMP kinase  23.04 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.188613 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1654  thymidylate kinase  24.28 
 
 		 217 aa  44.3  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.969892  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2503  thymidylate kinase-like  25 
 
 		 436 aa  43.5  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1707  thymidylate kinase  23.08 
 
 		 193 aa  43.1  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0493685 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04630  thymidylate kinase, putative  25.74 
 
 		 217 aa  42.4  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.124404  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  26.9 
 
 		 215 aa  42.4  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1788  thymidylate kinase  27.16 
 
 		 203 aa  42  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000115787  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>