86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2585 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2585  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  417  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.633344 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3363  hypothetical protein  74.88 
 
 		 205 aa  319  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.787828  normal  0.980235 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2395  hypothetical protein  74.88 
 
 		 205 aa  319  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3111  hypothetical protein  71.71 
 
 		 205 aa  317  6e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0135344  normal  0.714259 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2593  hypothetical protein  72.91 
 
 		 213 aa  307  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105185 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  29.52 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  28.34 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  28.76 
 
 		 208 aa  53.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  28.33 
 
 		 210 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  26.42 
 
 		 209 aa  52.4  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0126  dTMP kinase  29.91 
 
 		 208 aa  51.6  0.000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000990938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  27.27 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  28.33 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  28.89 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  29.93 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  27.68 
 
 		 207 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1145  thymidylate kinase  27.59 
 
 		 244 aa  49.7  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.446337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  30 
 
 		 232 aa  49.3  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  31.08 
 
 		 226 aa  49.3  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03690  thymidylate kinase  31.85 
 
 		 219 aa  49.3  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0193896  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  28.66 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  26.63 
 
 		 210 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  23.76 
 
 		 206 aa  48.9  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0120  thymidylate kinase  23.6 
 
 		 203 aa  48.9  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0503  thymidylate kinase  23.56 
 
 		 205 aa  48.5  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  26.44 
 
 		 210 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0516  thymidylate kinase  23.56 
 
 		 205 aa  48.5  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.136123  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  28.48 
 
 		 210 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  28.48 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16190  thymidylate kinase  26.59 
 
 		 234 aa  46.6  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000139363 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  22.12 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  27.33 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  22.99 
 
 		 209 aa  46.2  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  27.08 
 
 		 216 aa  45.8  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  24.42 
 
 		 210 aa  45.8  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0512  thymidylate kinase  24.86 
 
 		 208 aa  45.8  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  28.66 
 
 		 219 aa  45.4  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  29.03 
 
 		 210 aa  45.4  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1167  thymidylate kinase-like protein  23.3 
 
 		 217 aa  45.4  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1654  thymidylate kinase  26.79 
 
 		 217 aa  45.4  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.969892  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  28.67 
 
 		 688 aa  45.1  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  25.45 
 
 		 197 aa  45.1  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0145  thymidylate kinase  28.43 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289209 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1092  thymidylate kinase  25.83 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.733791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2858  thymidylate kinase  28.97 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0155  thymidylate kinase  28.43 
 
 		 225 aa  43.9  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0027  dTMP kinase  26.98 
 
 		 215 aa  43.9  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.59116  normal  0.0709229 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  27.88 
 
 		 217 aa  44.3  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3227  thymidylate kinase  28.97 
 
 		 217 aa  44.3  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000111751  normal  0.0445017 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  25.69 
 
 		 223 aa  44.7  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1726  thymidylate kinase  26.79 
 
 		 217 aa  44.3  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  24.18 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  25.81 
 
 		 216 aa  43.5  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  26.14 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0025  thymidylate kinase  22.76 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0914  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein B  33.66 
 
 		 171 aa  43.9  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09210  thymidylate kinase  30.28 
 
 		 295 aa  43.1  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0808366 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4325  dTMP kinase  25.29 
 
 		 217 aa  43.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.187582 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1128  thymidylate kinase  21.77 
 
 		 209 aa  43.1  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000377122  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1878  dTMP kinase  29.41 
 
 		 226 aa  42.4  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.04271 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2255  thymidylate kinase  26.06 
 
 		 215 aa  42.7  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3204  thymidylate kinase  25.56 
 
 		 225 aa  42.7  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00156948  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3232  dTMP kinase  27.15 
 
 		 226 aa  42.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  23.23 
 
 		 213 aa  42.7  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1026  dTMP kinase  28.12 
 
 		 254 aa  42.4  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2155  thymidylate kinase  27.11 
 
 		 221 aa  42.4  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  28.57 
 
 		 226 aa  42.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  23.76 
 
 		 211 aa  42.4  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  28.39 
 
 		 208 aa  42.4  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  27.1 
 
 		 206 aa  42  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  26.55 
 
 		 214 aa  42  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0877  dTMP kinase  28.83 
 
 		 221 aa  42  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  29.25 
 
 		 206 aa  41.6  0.007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  28 
 
 		 686 aa  41.6  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5281  thymidylate kinase  22.37 
 
 		 208 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0025  thymidylate kinase  23.03 
 
 		 208 aa  41.6  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  27.27 
 
 		 218 aa  41.6  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0035  thymidylate kinase  23.03 
 
 		 208 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1611  dTMP kinase  24 
 
 		 217 aa  41.2  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  25.83 
 
 		 206 aa  41.6  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0027  thymidylate kinase  23.03 
 
 		 208 aa  41.2  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0026  thymidylate kinase  23.03 
 
 		 208 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0026  thymidylate kinase  23.03 
 
 		 208 aa  41.2  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0029  thymidylate kinase  23.03 
 
 		 208 aa  41.2  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0028  thymidylate kinase  23.03 
 
 		 208 aa  41.6  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0039  thymidylate kinase  23.03 
 
 		 208 aa  41.2  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>