36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3363 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3363  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  421  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.787828  normal  0.980235 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2395  hypothetical protein  99.02 
 
 		 205 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2593  hypothetical protein  88.67 
 
 		 213 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105185 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2585  hypothetical protein  74.88 
 
 		 205 aa  319  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.633344 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3111  hypothetical protein  70.65 
 
 		 205 aa  307  5e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0135344  normal  0.714259 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  25.81 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  30 
 
 		 213 aa  48.1  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0025  thymidylate kinase  25.66 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  30.13 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  29.91 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  29.22 
 
 		 208 aa  46.2  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  26.8 
 
 		 216 aa  45.8  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0028  thymidylate kinase  24.03 
 
 		 208 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0035  thymidylate kinase  24.03 
 
 		 208 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0029  thymidylate kinase  24.03 
 
 		 208 aa  45.1  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0026  thymidylate kinase  24.03 
 
 		 208 aa  45.1  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0026  thymidylate kinase  24.03 
 
 		 208 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0027  thymidylate kinase  24.03 
 
 		 208 aa  45.1  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0039  thymidylate kinase  24.03 
 
 		 208 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0683  thymidylate kinase  29.05 
 
 		 216 aa  44.7  0.0009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2984  AAA ATPase  26.4 
 
 		 692 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000500749  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03690  thymidylate kinase  30.15 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0193896  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  29.61 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  29.68 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0512  thymidylate kinase  28.08 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  27.21 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0914  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein B  48.98 
 
 		 171 aa  43.1  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5281  thymidylate kinase  23.03 
 
 		 208 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0025  thymidylate kinase  23.03 
 
 		 208 aa  42  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  26.49 
 
 		 202 aa  42  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0035  thymidylate kinase  23.03 
 
 		 208 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0027  dTMP kinase  27.89 
 
 		 215 aa  41.6  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.59116  normal  0.0709229 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  26.67 
 
 		 203 aa  41.6  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  27.18 
 
 		 205 aa  41.6  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  27.82 
 
 		 210 aa  41.6  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4325  dTMP kinase  26.28 
 
 		 217 aa  41.2  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.187582 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>