94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2353 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2353  thymidylate kinase  100 
 
 		 204 aa  405  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.972554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3961  thymidylate kinase  44.74 
 
 		 237 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.057611  normal  0.564595 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3581  thymidylate kinase  44.44 
 
 		 236 aa  135  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3422  thymidylate kinase  35.23 
 
 		 203 aa  87  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0056  thymidylate kinase  35.05 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0980  thymidylate kinase / thymidylate synthase  31.03 
 
 		 213 aa  74.7  0.0000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.653916  normal  0.0681105 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1841  thymidylate kinase  30.43 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0456  thymidylate kinase  30.93 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  32.87 
 
 		 671 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01491  thymidylate kinase  25.25 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2566  dTMP kinase  28.29 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00171931  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01471  thymidylate kinase  24.24 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.702638  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0132  thymidylate kinase  24.24 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0424228  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1246  dTMP kinase  30.14 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.180167  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1098  thymidylate kinase  30.62 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1673  thymidylate kinase  29.08 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2993  thymidylate kinase  31.84 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.207274 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  27.5 
 
 		 197 aa  52.4  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2643  dTMP kinase  27.27 
 
 		 227 aa  52  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2162  thymidylate kinase  27.66 
 
 		 213 aa  52  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.452008  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1354  thymidylate kinase  27.27 
 
 		 212 aa  51.6  0.000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1350  thymidylate kinase  27.27 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4325  dTMP kinase  31.84 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.187582 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1020  thymidylate kinase  29.39 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.232447  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0636  thymidylate kinase  28.57 
 
 		 228 aa  50.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0156  dTMP kinase  29.51 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0144  dTMP kinase  32.12 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.049684 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  29.41 
 
 		 224 aa  48.1  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0344  thymidylate kinase  25.36 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  30.19 
 
 		 686 aa  47.8  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0362  thymidylate kinase  33.66 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1334  thymidylate kinase  30.39 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.648721  normal  0.0540228 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2120  thymidylate kinase  29.41 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000730162  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01581  thymidylate kinase  23.23 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.978183  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0498  dTMP kinase  30.86 
 
 		 236 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2627  thymidylate kinase  30.85 
 
 		 199 aa  47.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2126  dTMP kinase  32.26 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.454256  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  27.83 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2209  thymidylate kinase  29.53 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2513  Thymidylate kinase-like protein  28.86 
 
 		 230 aa  47.4  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  29.11 
 
 		 688 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  29.19 
 
 		 206 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2216  dTMP kinase  32.26 
 
 		 219 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.170348  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  29.19 
 
 		 206 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  29.19 
 
 		 206 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  25.71 
 
 		 215 aa  45.8  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  30.88 
 
 		 213 aa  46.2  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  27.6 
 
 		 206 aa  45.8  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0683  thymidylate kinase  31.51 
 
 		 216 aa  45.4  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0787  dTMP kinase  28.08 
 
 		 207 aa  45.4  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  24.15 
 
 		 199 aa  45.4  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0637  thymidylate kinase  27.62 
 
 		 205 aa  45.4  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  28.78 
 
 		 212 aa  45.4  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1277  thymidylate kinase  31.22 
 
 		 208 aa  45.4  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.431831 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  28.71 
 
 		 204 aa  45.1  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  26.73 
 
 		 203 aa  45.1  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  25.6 
 
 		 211 aa  45.1  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08213  thymidylate and uridylate kinase (Eurofung)  30.41 
 
 		 223 aa  44.7  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.271873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2080  dTMP kinase  30.19 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.174265  normal  0.0165952 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1496  thymidylate kinase  26.34 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0919131  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02021  thymidylate kinase  26.34 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.409154  normal  0.831835 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3591  thymidylate kinase  29.15 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.389295 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  26.67 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  28.23 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl676  thymidylate kinase  29.15 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1298  thymidylate kinase  27.88 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  32.21 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  28.78 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  28.5 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  31.72 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  28.23 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1253  thymidylate kinase  27.85 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  28.43 
 
 		 225 aa  43.5  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  24.55 
 
 		 217 aa  42.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  29.85 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  28.3 
 
 		 707 aa  42.4  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  30.11 
 
 		 234 aa  42.4  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  27.72 
 
 		 202 aa  42.4  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1477  thymidylate kinase  25.99 
 
 		 213 aa  42.4  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000124035  hitchhiker  0.000000000959374 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2029  thymidylate kinase  25.99 
 
 		 213 aa  42.4  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000357383  hitchhiker  0.00000127305 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  25.98 
 
 		 223 aa  42.4  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  25.98 
 
 		 223 aa  42.4  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01102  hypothetical protein  25.99 
 
 		 213 aa  42  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00374424  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  30 
 
 		 218 aa  42  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  29.55 
 
 		 225 aa  42  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2226  thymidylate kinase  25.99 
 
 		 213 aa  42  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000221684  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2503  thymidylate kinase  25.99 
 
 		 213 aa  42  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00403809  unclonable  0.0000000113108 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1219  thymidylate kinase  25.99 
 
 		 213 aa  42  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000291901  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1220  thymidylate kinase  25.99 
 
 		 213 aa  42  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000082141  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2549  dTMP kinase  25.99 
 
 		 213 aa  42  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000242114  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01094  thymidylate kinase  25.99 
 
 		 213 aa  42  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00390554  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2567  thymidylate kinase  30.22 
 
 		 227 aa  41.6  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0661134  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  26.47 
 
 		 217 aa  41.6  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1721  thymidylate kinase  31.85 
 
 		 218 aa  41.2  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>