192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6504 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6504  thymidylate kinase  100 
 
 		 241 aa  472  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0480023  normal  0.117092 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0306  thymidylate kinase  66.51 
 
 		 212 aa  261  6.999999999999999e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30960  thymidylate kinase  46.94 
 
 		 220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13276  thymidylate kinase  47.45 
 
 		 214 aa  160  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72345 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1346  thymidylate kinase  48.72 
 
 		 210 aa  159  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1380  thymidylate kinase  48.21 
 
 		 229 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.497022 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1364  thymidylate kinase  48.21 
 
 		 229 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4251  thymidylate kinase  46.5 
 
 		 213 aa  157  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.993209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1750  thymidylate kinase  49.5 
 
 		 211 aa  150  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.126977  normal  0.770397 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4714  thymidylate kinase  46.45 
 
 		 209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0438752  normal  0.0737042 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3639  thymidylate kinase  47.45 
 
 		 211 aa  145  5e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.907428  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6311  thymidylate kinase  47.67 
 
 		 210 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1075  thymidylate kinase  47.14 
 
 		 213 aa  135  7.000000000000001e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5564  thymidylate kinase, putative  30.65 
 
 		 328 aa  105  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.96144e-41 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2209  thymidylate kinase  34.85 
 
 		 236 aa  99  6e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0636  thymidylate kinase  32.86 
 
 		 228 aa  90.5  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1069  thymidylate kinase  28.29 
 
 		 223 aa  87  3e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0024  thymidylate kinase  29.27 
 
 		 227 aa  77.8  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000063864  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2107  thymidylate kinase  29.27 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0970405  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1096  thymidylate kinase  29.01 
 
 		 232 aa  74.3  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1707  thymidylate kinase  28.43 
 
 		 193 aa  73.6  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0493685 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3015  thymidylate kinase  27.17 
 
 		 225 aa  72  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103668  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0144  dTMP kinase  34.92 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.049684 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  42.07 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  36.79 
 
 		 206 aa  67  0.0000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  38.76 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  35.67 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  34.02 
 
 		 226 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1841  thymidylate kinase  29.57 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  33.01 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0126  thymidylate kinase  31.58 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08213  thymidylate and uridylate kinase (Eurofung)  28.43 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.271873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  33.83 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  31.28 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  37.5 
 
 		 688 aa  58.2  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1194  dTMP kinase  30.32 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  35.78 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0357  thymidylate kinase  27.39 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  32.28 
 
 		 217 aa  57  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0156  dTMP kinase  30.73 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  32.02 
 
 		 236 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1654  thymidylate kinase  30.21 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.969892  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  34.82 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  28.06 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1726  thymidylate kinase  30.21 
 
 		 217 aa  55.1  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  27.75 
 
 		 213 aa  55.1  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4325  dTMP kinase  34.66 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.187582 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2036  thymidylate kinase  29.79 
 
 		 196 aa  54.3  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.54882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  28.77 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  37.33 
 
 		 671 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  36.99 
 
 		 224 aa  53.1  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  30.82 
 
 		 216 aa  53.9  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  32.45 
 
 		 217 aa  53.5  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5864  thymidylate kinase  31.94 
 
 		 210 aa  53.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.851432 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0725  dTMP kinase  25.29 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1508  dTMP kinase  32.82 
 
 		 240 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  33.62 
 
 		 707 aa  52.8  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  32.11 
 
 		 703 aa  52.4  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1660  thymidylate kinase  31.41 
 
 		 206 aa  52.4  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0638751  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2993  thymidylate kinase  35.54 
 
 		 210 aa  52.4  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.207274 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  29.84 
 
 		 197 aa  52.4  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0300  dTMP kinase  26.32 
 
 		 205 aa  52.4  0.000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.188613 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3110  dTMP kinase  32.54 
 
 		 209 aa  52.4  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2545  normal  0.244995 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  32.34 
 
 		 901 aa  52  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  35.53 
 
 		 662 aa  52  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  30.84 
 
 		 221 aa  51.6  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2144  dTMP kinase  29.17 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  33.5 
 
 		 210 aa  51.6  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2216  dTMP kinase  36.92 
 
 		 219 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.170348  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  28.95 
 
 		 214 aa  50.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0456  thymidylate kinase  25.93 
 
 		 197 aa  50.8  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  26.04 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2120  thymidylate kinase  28.14 
 
 		 202 aa  50.4  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000730162  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  31.87 
 
 		 730 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2126  dTMP kinase  36.92 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.454256  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3114  thymidylate kinase  32.11 
 
 		 230 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0311212  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46855  predicted protein  28.67 
 
 		 245 aa  50.1  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00892903  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04630  thymidylate kinase, putative  27.92 
 
 		 217 aa  49.7  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.124404  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  32.24 
 
 		 686 aa  49.7  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32539  predicted protein  33.33 
 
 		 218 aa  50.1  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.743007  normal  0.343685 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  32.95 
 
 		 210 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  30.48 
 
 		 213 aa  49.3  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2629  thymidylate kinase  29.86 
 
 		 206 aa  49.3  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  30.11 
 
 		 206 aa  49.3  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  29.84 
 
 		 234 aa  49.3  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  29.33 
 
 		 197 aa  49.3  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  30.11 
 
 		 206 aa  49.3  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  29.17 
 
 		 214 aa  48.9  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  31.43 
 
 		 217 aa  48.9  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1098  thymidylate kinase  29.59 
 
 		 205 aa  48.5  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0637  thymidylate kinase  31.33 
 
 		 205 aa  48.9  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  31.61 
 
 		 208 aa  48.5  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  33.52 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1884  dTMP kinase  30.97 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  32.54 
 
 		 210 aa  48.5  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  32.99 
 
 		 226 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  33.7 
 
 		 217 aa  48.1  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03690  thymidylate kinase  36.99 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0193896  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0344  thymidylate kinase  24.48 
 
 		 196 aa  48.1  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  33.88 
 
 		 207 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>