94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4714 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4714  thymidylate kinase  100 
 
 		 209 aa  409  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0438752  normal  0.0737042 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1750  thymidylate kinase  87.5 
 
 		 211 aa  338  4e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.126977  normal  0.770397 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1346  thymidylate kinase  75.98 
 
 		 210 aa  280  8.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1380  thymidylate kinase  75.98 
 
 		 229 aa  280  1e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.497022 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1364  thymidylate kinase  75.49 
 
 		 229 aa  278  5e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13276  thymidylate kinase  68.12 
 
 		 214 aa  263  1e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72345 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30960  thymidylate kinase  60.1 
 
 		 220 aa  228  7e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3639  thymidylate kinase  62.63 
 
 		 211 aa  209  2e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.907428  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4251  thymidylate kinase  54.95 
 
 		 213 aa  201  7e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.993209  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1075  thymidylate kinase  60.29 
 
 		 213 aa  189  2.9999999999999997e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6311  thymidylate kinase  55 
 
 		 210 aa  182  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0306  thymidylate kinase  48.98 
 
 		 212 aa  162  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6504  thymidylate kinase  46.45 
 
 		 241 aa  160  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0480023  normal  0.117092 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2209  thymidylate kinase  34.34 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0636  thymidylate kinase  34.04 
 
 		 228 aa  89  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0024  thymidylate kinase  28.57 
 
 		 227 aa  89  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000063864  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1069  thymidylate kinase  28.57 
 
 		 223 aa  88.6  6e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1096  thymidylate kinase  30.07 
 
 		 232 aa  80.5  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3015  thymidylate kinase  28.65 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103668  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2107  thymidylate kinase  31.61 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0970405  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5564  thymidylate kinase, putative  23.53 
 
 		 328 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.96144e-41 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1707  thymidylate kinase  24.52 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0493685 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1841  thymidylate kinase  29.14 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08213  thymidylate and uridylate kinase (Eurofung)  30.39 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.271873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1884  dTMP kinase  31.78 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  31.91 
 
 		 206 aa  52  0.000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  29.49 
 
 		 216 aa  52  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  29.17 
 
 		 217 aa  52  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  31.58 
 
 		 232 aa  52  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  30 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  30 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  31.6 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1026  dTMP kinase  28.71 
 
 		 254 aa  50.1  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1726  thymidylate kinase  31.32 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1005  dTMP kinase  29.87 
 
 		 226 aa  49.3  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0344  thymidylate kinase  25.47 
 
 		 196 aa  48.9  0.00005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0445  thymidylate kinase  26.34 
 
 		 211 aa  48.5  0.00008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  30.48 
 
 		 202 aa  47.4  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1654  thymidylate kinase  30.77 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.969892  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46855  predicted protein  26.17 
 
 		 245 aa  47.8  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00892903  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2036  thymidylate kinase  28.39 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.54882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0158  thymidylate kinase  31.77 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2629  thymidylate kinase  32.05 
 
 		 206 aa  46.6  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53211  thymidylate kinase  36.79 
 
 		 229 aa  47  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.488835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  30.63 
 
 		 686 aa  46.6  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  28.57 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5864  thymidylate kinase  31.89 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.851432 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  26.09 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0144  dTMP kinase  31.25 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.049684 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0725  dTMP kinase  26.16 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  28.24 
 
 		 226 aa  46.2  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  22.99 
 
 		 211 aa  45.8  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3388  thymidylate kinase  28.89 
 
 		 228 aa  45.8  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.159825  normal  0.0629111 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0456  thymidylate kinase  27.81 
 
 		 197 aa  45.4  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  28.95 
 
 		 207 aa  45.4  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  35.45 
 
 		 214 aa  45.4  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  35.85 
 
 		 234 aa  45.1  0.0007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  27.56 
 
 		 208 aa  45.1  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1673  thymidylate kinase  26.89 
 
 		 201 aa  44.7  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  28.24 
 
 		 236 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1246  dTMP kinase  26.79 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.180167  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2155  thymidylate kinase  29.78 
 
 		 221 aa  44.3  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  33.33 
 
 		 703 aa  44.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  34.42 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  24.27 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  28.24 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  27.65 
 
 		 234 aa  44.3  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1719  thymidylate kinase  27.84 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.138629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1098  thymidylate kinase  26.2 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  37.93 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1251  thymidylate kinase  25.32 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.824012  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  26.01 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2010  thymidylate kinase  31.35 
 
 		 230 aa  43.1  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154294  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0300  dTMP kinase  25.95 
 
 		 205 aa  43.1  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.188613 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0156  dTMP kinase  28.27 
 
 		 196 aa  43.1  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  28.82 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  28.99 
 
 		 197 aa  42.7  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  32.47 
 
 		 705 aa  42.7  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0039  thymidylate kinase  23.98 
 
 		 208 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  28.07 
 
 		 233 aa  42.7  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3204  thymidylate kinase  25.13 
 
 		 225 aa  42.4  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00156948  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  29.63 
 
 		 225 aa  42.4  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1411  thymidylate kinase  32.24 
 
 		 198 aa  42.4  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0670165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1298  thymidylate kinase  30.67 
 
 		 199 aa  42.4  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  32.54 
 
 		 215 aa  42  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1638  thymidylate kinase  28.21 
 
 		 219 aa  42  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  30.7 
 
 		 210 aa  42  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0028  thymidylate kinase  23.98 
 
 		 208 aa  42  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  33.05 
 
 		 223 aa  42  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1948  thymidylate kinase  29.85 
 
 		 260 aa  42  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.98603 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0787  dTMP kinase  25.24 
 
 		 207 aa  41.6  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3493  thymidylate kinase  28.5 
 
 		 212 aa  41.6  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000071243  normal  0.0320777 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  26.89 
 
 		 214 aa  41.6  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1691  thymidylate kinase  28.5 
 
 		 212 aa  41.2  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0210927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>