130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2107 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2107  thymidylate kinase  100 
 
 		 227 aa  470  1e-132  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0970405  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0024  thymidylate kinase  56.36 
 
 		 227 aa  259  2e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000063864  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3015  thymidylate kinase  58.33 
 
 		 225 aa  255  3e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103668  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1069  thymidylate kinase  54.26 
 
 		 223 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1096  thymidylate kinase  54.13 
 
 		 232 aa  249  2e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2209  thymidylate kinase  35.24 
 
 		 236 aa  129  4.0000000000000003e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0636  thymidylate kinase  29.83 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30960  thymidylate kinase  31.82 
 
 		 220 aa  85.1  9e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0306  thymidylate kinase  29.89 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5564  thymidylate kinase, putative  28.12 
 
 		 328 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.96144e-41 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4251  thymidylate kinase  32.93 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.993209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4714  thymidylate kinase  33.54 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0438752  normal  0.0737042 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13276  thymidylate kinase  29.38 
 
 		 214 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72345 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6504  thymidylate kinase  29.73 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0480023  normal  0.117092 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1750  thymidylate kinase  32.91 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.126977  normal  0.770397 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46855  predicted protein  26.55 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00892903  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1346  thymidylate kinase  28.74 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1364  thymidylate kinase  28.74 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1380  thymidylate kinase  29.38 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.497022 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3639  thymidylate kinase  28.81 
 
 		 211 aa  62  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.907428  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1707  thymidylate kinase  26.7 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0493685 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08213  thymidylate and uridylate kinase (Eurofung)  30.07 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.271873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  26.74 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1721  thymidylate kinase  26.83 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04630  thymidylate kinase, putative  24.52 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.124404  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6311  thymidylate kinase  29.94 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  22.87 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1075  thymidylate kinase  28.98 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  27.61 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0144  dTMP kinase  24.86 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.049684 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2567  thymidylate kinase  31.58 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0661134  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2642  thymidylate kinase  32.24 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  27.64 
 
 		 199 aa  54.7  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2126  dTMP kinase  26.42 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.454256  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4325  dTMP kinase  25.47 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.187582 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  27.92 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2216  dTMP kinase  26.42 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.170348  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  25 
 
 		 236 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1020  thymidylate kinase  28.48 
 
 		 205 aa  53.1  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.232447  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  24.56 
 
 		 207 aa  52.8  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0512  thymidylate kinase  32.11 
 
 		 208 aa  52.4  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  24.46 
 
 		 225 aa  52  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  26.74 
 
 		 686 aa  52  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2155  thymidylate kinase  23.96 
 
 		 221 aa  52  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  26.35 
 
 		 707 aa  51.6  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1788  thymidylate kinase  28.86 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000115787  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0158  thymidylate kinase  26.71 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2036  thymidylate kinase  26.58 
 
 		 196 aa  50.8  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.54882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  26.95 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  26.14 
 
 		 243 aa  49.7  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  26.63 
 
 		 688 aa  50.1  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  24.18 
 
 		 225 aa  49.7  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4954  thymidylate kinase  23.53 
 
 		 707 aa  49.3  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  26.11 
 
 		 244 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  23.91 
 
 		 226 aa  49.3  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  24.84 
 
 		 225 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1026  dTMP kinase  23.45 
 
 		 254 aa  49.3  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  24.06 
 
 		 208 aa  49.3  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1496  thymidylate kinase  23.68 
 
 		 211 aa  48.9  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0919131  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  25.86 
 
 		 703 aa  48.9  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0498  dTMP kinase  25.63 
 
 		 236 aa  48.5  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53211  thymidylate kinase  31.86 
 
 		 229 aa  48.5  0.00009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.488835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0922  dTMP kinase  25.83 
 
 		 207 aa  48.5  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  25.29 
 
 		 686 aa  48.1  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  24.38 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01471  thymidylate kinase  24.52 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.702638  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0503  thymidylate kinase  28.28 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0516  thymidylate kinase  28.28 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.136123  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1673  thymidylate kinase  25.53 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02021  thymidylate kinase  23.25 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.409154  normal  0.831835 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26491  thymidylate kinase  23.08 
 
 		 216 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0156  dTMP kinase  25.15 
 
 		 196 aa  47.8  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  25.33 
 
 		 662 aa  47.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  25.44 
 
 		 233 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0300  dTMP kinase  21.99 
 
 		 205 aa  47.8  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.188613 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0456  thymidylate kinase  23.45 
 
 		 197 aa  46.6  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5614  thymidylate kinase  28.57 
 
 		 572 aa  46.6  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  22.79 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  22.91 
 
 		 224 aa  47  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  25.85 
 
 		 214 aa  46.6  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  23.96 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  25.83 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  24.09 
 
 		 216 aa  46.6  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1884  dTMP kinase  29.01 
 
 		 206 aa  46.2  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  25.56 
 
 		 244 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  25.83 
 
 		 232 aa  46.2  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0132  thymidylate kinase  25.48 
 
 		 212 aa  45.8  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0424228  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  27.43 
 
 		 215 aa  45.8  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1194  dTMP kinase  24.34 
 
 		 205 aa  45.8  0.0006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2566  dTMP kinase  27.92 
 
 		 228 aa  45.8  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00171931  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  25.84 
 
 		 197 aa  45.4  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  25 
 
 		 901 aa  45.8  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1841  thymidylate kinase  28.22 
 
 		 189 aa  45.4  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03690  thymidylate kinase  25 
 
 		 219 aa  45.4  0.0007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0193896  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  21.76 
 
 		 281 aa  45.4  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  28.95 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  24.36 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0386  thymidylate kinase  25.75 
 
 		 222 aa  45.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203543  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  25.14 
 
 		 671 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  23.71 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>