More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_46855 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011679  PHATR_46855  predicted protein  100 
 
 
245 aa  505  9.999999999999999e-143  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00892903  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08213  thymidylate and uridylate kinase (Eurofung)  46.54 
 
 
223 aa  199  3.9999999999999996e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.271873  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32539  predicted protein  43.64 
 
 
218 aa  194  2e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.743007  normal  0.343685 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04630  thymidylate kinase, putative  45.45 
 
 
217 aa  188  8e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.124404  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53211  thymidylate kinase  37.56 
 
 
229 aa  136  3.0000000000000003e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.488835  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1707  thymidylate kinase  32.18 
 
 
193 aa  112  7.000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0493685 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  33.64 
 
 
210 aa  88.6  9e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2993  thymidylate kinase  28.17 
 
 
210 aa  77.8  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.207274 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  35.05 
 
 
206 aa  75.5  0.0000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  30.45 
 
 
218 aa  74.3  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3015  thymidylate kinase  24.14 
 
 
225 aa  73.9  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103668  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  32.24 
 
 
243 aa  73.2  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0156  dTMP kinase  26.92 
 
 
196 aa  73.2  0.000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  25.96 
 
 
206 aa  72  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  31.82 
 
 
207 aa  71.6  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2120  thymidylate kinase  32.85 
 
 
202 aa  71.6  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000730162  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0456  thymidylate kinase  27.14 
 
 
197 aa  70.9  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0344  thymidylate kinase  28.43 
 
 
196 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0024  thymidylate kinase  30.61 
 
 
227 aa  70.5  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000063864  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3232  dTMP kinase  30.63 
 
 
226 aa  70.5  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  30.99 
 
 
213 aa  70.1  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0158  thymidylate kinase  29.86 
 
 
220 aa  69.7  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  26.64 
 
 
203 aa  69.7  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  33.02 
 
 
281 aa  69.7  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  30.81 
 
 
205 aa  69.7  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  28.9 
 
 
225 aa  68.6  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2209  thymidylate kinase  30.41 
 
 
236 aa  68.6  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0126  dTMP kinase  30.84 
 
 
208 aa  68.6  0.00000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000990938  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1096  thymidylate kinase  26.85 
 
 
232 aa  67  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1098  thymidylate kinase  29.19 
 
 
205 aa  67.4  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1536  dTMP kinase  30.87 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5864  thymidylate kinase  28.1 
 
 
210 aa  67  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.851432 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  29.03 
 
 
207 aa  66.6  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1026  dTMP kinase  26.98 
 
 
254 aa  66.2  0.0000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0357  thymidylate kinase  25.49 
 
 
198 aa  65.9  0.0000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0636  thymidylate kinase  29.14 
 
 
228 aa  65.9  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1721  thymidylate kinase  32.03 
 
 
218 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1281  thymidylate kinase  24.66 
 
 
207 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.206155 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2107  thymidylate kinase  26.55 
 
 
227 aa  64.7  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0970405  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1250  dTMP kinase  25 
 
 
207 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  33.18 
 
 
662 aa  63.9  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  31.34 
 
 
202 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1461  dTMP kinase  28.57 
 
 
203 aa  63.5  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1673  thymidylate kinase  25.82 
 
 
201 aa  63.5  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  27.18 
 
 
206 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2155  thymidylate kinase  30.73 
 
 
221 aa  63.2  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  29.6 
 
 
233 aa  62.8  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2010  thymidylate kinase  29.2 
 
 
230 aa  62.8  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154294  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  28.44 
 
 
208 aa  62.4  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  28.44 
 
 
703 aa  62.4  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0145  thymidylate kinase  27.23 
 
 
225 aa  62  0.000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00289209 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  27.18 
 
 
206 aa  62  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  27.65 
 
 
206 aa  62  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  29.76 
 
 
197 aa  62  0.000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  28.86 
 
 
197 aa  62  0.000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1350  thymidylate kinase  28.37 
 
 
212 aa  61.6  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  27.91 
 
 
210 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2216  dTMP kinase  32.21 
 
 
219 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.170348  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  28.3 
 
 
901 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3720  dTMP kinase  27.95 
 
 
229 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00484768 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  26.89 
 
 
206 aa  61.6  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0040  dTMP kinase  29.72 
 
 
210 aa  61.2  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2126  dTMP kinase  32.21 
 
 
219 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.454256  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  27.36 
 
 
207 aa  61.2  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1860  thymidylate kinase / thymidylate synthase  27.64 
 
 
215 aa  61.2  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.913356  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  26.34 
 
 
204 aa  60.5  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  27.98 
 
 
218 aa  60.8  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1611  dTMP kinase  32.19 
 
 
217 aa  61.2  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2503  thymidylate kinase  29.61 
 
 
233 aa  60.5  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.33464  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  29.46 
 
 
705 aa  60.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  31.38 
 
 
210 aa  60.8  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  25.37 
 
 
204 aa  60.1  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  28.3 
 
 
214 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0132  thymidylate kinase  27.4 
 
 
212 aa  60.1  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0424228  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0144  dTMP kinase  25.7 
 
 
204 aa  60.1  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.049684 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  30.85 
 
 
226 aa  59.7  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3227  thymidylate kinase  29.15 
 
 
217 aa  59.7  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000111751  normal  0.0445017 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0559  thymidylate kinase  28.85 
 
 
199 aa  59.3  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  26.36 
 
 
225 aa  59.7  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0155  thymidylate kinase  27.7 
 
 
225 aa  59.3  0.00000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  26.76 
 
 
209 aa  59.3  0.00000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0787  dTMP kinase  27.32 
 
 
207 aa  59.3  0.00000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01471  thymidylate kinase  27.52 
 
 
212 aa  58.9  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.702638  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1354  thymidylate kinase  27.31 
 
 
212 aa  58.9  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  26.17 
 
 
234 aa  58.9  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  30.24 
 
 
197 aa  58.9  0.00000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  26.89 
 
 
208 aa  58.5  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  32.56 
 
 
215 aa  58.5  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1625  thymidylate kinase  28.23 
 
 
199 aa  58.5  0.00000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0778  thymidylate kinase  27.49 
 
 
207 aa  58.2  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  27.85 
 
 
707 aa  58.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  26.98 
 
 
210 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0883  dTMP kinase  26.34 
 
 
211 aa  58.2  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  26.73 
 
 
216 aa  58.5  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  28.83 
 
 
214 aa  58.2  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  30.46 
 
 
207 aa  58.5  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  28.29 
 
 
214 aa  58.2  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1510  dTMP kinase  25.78 
 
 
219 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  26.27 
 
 
210 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  28.71 
 
 
205 aa  57.4  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>