223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3988 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3988  LAO/AO transport system ATPase  100 
 
 
324 aa  652    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2025  LAO/AO transport system ATPase  58.65 
 
 
312 aa  361  9e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82524  decreased coverage  0.000989669 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2999  LAO/AO transport system ATPase  61.2 
 
 
316 aa  357  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1853  LAO/AO transport system ATPase  48.08 
 
 
309 aa  315  7e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0586  LAO/AO transport system ATPase  54.22 
 
 
310 aa  302  6.000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.585715  normal  0.982729 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1576  ArgK protein  46.77 
 
 
320 aa  292  7e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000113447  normal  0.451299 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0943  LAO/AO transport system ATPase  48.06 
 
 
314 aa  291  1e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1260  LAO/AO transport system ATPase  50.96 
 
 
319 aa  287  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0389  LAO/AO transport system ATPase  47.6 
 
 
317 aa  286  4e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000146012  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2160  LAO/AO transport system ATPase  50.31 
 
 
341 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.104519 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2806  LAO/AO transport system ATPase  47.04 
 
 
326 aa  281  2e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0864794  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1649  LAO/AO transport system ATPase  48.49 
 
 
344 aa  279  5e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.840992  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2297  LAO/AO transport system ATPase  48.77 
 
 
344 aa  277  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.413391  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2209  LAO/AO transport system ATPase  48.77 
 
 
344 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.249756  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1549  LAO/AO transport system ATPase  48.22 
 
 
314 aa  278  1e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000360873 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1674  LAO/AO transport system ATPase  46.65 
 
 
312 aa  278  1e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2690  LAO/AO transport system ATPase  47.9 
 
 
314 aa  277  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249774  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0358  LAO/AO transport system ATPase  49.19 
 
 
318 aa  276  5e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1579  LAO/AO transport system ATPase  45.89 
 
 
319 aa  275  9e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2027  LAO/AO transport system ATPase  46.47 
 
 
316 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00170815  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2365  LAO/AO transport system ATPase  47.27 
 
 
318 aa  269  5e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3609  LAO/AO transport system ATPase  50.97 
 
 
345 aa  268  5.9999999999999995e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3990  LAO/AO transport system ATPase  50.32 
 
 
329 aa  268  1e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1281  LAO/AO transport system ATPase  45.86 
 
 
317 aa  267  2e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.417761  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2170  LAO/AO transport system ATPase  50 
 
 
341 aa  265  7e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300615  normal  0.661007 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0511  LAO/AO transport system ATPase  43.6 
 
 
378 aa  264  1e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5998  LAO/AO transport system ATPase  48.21 
 
 
307 aa  263  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0515982 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1798  LAO/AO transport system ATPase  50.49 
 
 
323 aa  262  4.999999999999999e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2130  LAO/AO transport system ATPase  50.67 
 
 
327 aa  262  4.999999999999999e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0540  putative transport system kinase  48.39 
 
 
327 aa  261  2e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.167721  hitchhiker  0.00219183 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5020  LAO/AO transport system ATPase  48.88 
 
 
332 aa  259  4e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778595  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1698  LAO/AO transport system ATPase  48.26 
 
 
322 aa  259  6e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238616  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2473  LAO/AO transport system ATPase  42.15 
 
 
375 aa  259  6e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1268  LAO/AO transport system ATPase  45.21 
 
 
312 aa  258  1e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0456  LAO/AO transport system ATPase  43.08 
 
 
325 aa  258  1e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.614853 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4110  LAO/AO transport system ATPase  55.38 
 
 
316 aa  257  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.162136  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1911  LAO/AO transport system ATPase  43.87 
 
 
318 aa  257  2e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0463697  normal  0.161513 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3656  LAO/AO transport system ATPase  45.31 
 
 
323 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.959092  normal  0.164513 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4359  LAO/AO transport system ATPase  43.32 
 
 
364 aa  253  3e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.460456  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0899  LAO/AO transport system ATPase  42.9 
 
 
357 aa  252  6e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1770  LAO/AO transport system ATPase  41.85 
 
 
322 aa  250  2e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292624  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1045  LAO/AO transport system ATPase  47.08 
 
 
356 aa  245  9e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.172221  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5087  LAO/AO transport system ATPase  46.28 
 
 
333 aa  244  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3772  LAO/AO transport system ATPase  47.04 
 
 
318 aa  242  5e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.339101 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4647  LAO/AO transport system ATPase  46.98 
 
 
325 aa  241  1e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0480374  normal  0.487392 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3009  LAO/AO transport system ATPase  49.82 
 
 
308 aa  236  3e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.072512 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3103  LAO/AO transport system ATPase  46.75 
 
 
335 aa  236  4e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0011081  hitchhiker  0.0000652797 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3108  LAO/AO transport system ATPase  45.48 
 
 
304 aa  235  7e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0453606 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2533  LAO/AO transport system ATPase  41.94 
 
 
316 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.227946  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2210  ArgK protein  40.58 
 
 
330 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000516978  normal  0.0100138 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0673  LAO/AO transport system ATPase  51.84 
 
 
340 aa  229  6e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0080  LAO/AO transport system ATPase  40.45 
 
 
315 aa  222  8e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5042  LAO/AO transport system ATPase  53.31 
 
 
329 aa  221  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13609  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2690  LAO/AO transport system ATPase  44.57 
 
 
321 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0581  LAO/AO transport system ATPase  42.16 
 
 
292 aa  211  2e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.730832  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0955  LAO/AO transport system ATPase  37.58 
 
 
305 aa  208  1e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0032483 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1613  LAO/AO transport system ATPase  47.08 
 
 
312 aa  207  2e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.375817 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0512  LAO/AO transport system ATPase  41.73 
 
 
300 aa  207  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1321  LAO/AO transport system ATPase  39.86 
 
 
312 aa  207  2e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4250  LAO/AO transport system ATPase  43.12 
 
 
322 aa  205  7e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0801  LAO/AO transport system ATPase  50.22 
 
 
299 aa  204  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1780  LAO/AO transport system ATPase  53.19 
 
 
321 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3795  LAO/AO transport system ATPase  44.26 
 
 
290 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3868  LAO/AO transport system ATPase  44.26 
 
 
290 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119113  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3799  LAO/AO transport system ATPase  44.26 
 
 
290 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.205117  normal  0.899663 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2056  LAO/AO transport system ATPase  37.07 
 
 
314 aa  199  3.9999999999999996e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1360  LAO/AO transport system ATPase  36.93 
 
 
316 aa  196  4.0000000000000005e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000108838  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0153  LAO/AO transport system ATPase  47.64 
 
 
296 aa  196  5.000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.677625  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4372  LAO/AO transport system ATPase  39.06 
 
 
329 aa  194  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0551  ArgK protein  35.85 
 
 
310 aa  192  7e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3019  arginine/ornithine transport system ATPase  39.49 
 
 
330 aa  192  8e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.527055 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4005  arginine/ornithine transport system ATPase  40.14 
 
 
329 aa  191  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4301  LAO/AO transport system ATPase  48.36 
 
 
292 aa  191  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.635078  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2397  LAO/AO transport system ATPase  48.68 
 
 
303 aa  190  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.73846  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5546  LAO/AO transport system ATPase  40.26 
 
 
372 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3542  arginine/ornithine transport system ATPase  36.42 
 
 
330 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.749977 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3648  arginine/ornithine transport system ATPase  39.56 
 
 
332 aa  188  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2478  arginine/ornithine transport system ATPase  40.67 
 
 
333 aa  187  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.341293  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5021  LAO/AO transport system ATPase  34.6 
 
 
363 aa  187  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0197522  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2763  arginine/ornithine transport system ATPase  39.48 
 
 
332 aa  186  5e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3121  arginine/ornithine transport system ATPase  37.74 
 
 
325 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3182  arginine/ornithine transport system ATPase  37.74 
 
 
325 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.968151  normal  0.139966 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2764  arginine/ornithine transport system ATPase  38.11 
 
 
331 aa  186  5e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0468013  normal  0.748538 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11526  arginine/ornithine transport system ATPase  38.1 
 
 
334 aa  186  5e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.139624 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2804  arginine/ornithine transport system ATPase  37.3 
 
 
352 aa  186  6e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0929254  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3132  arginine/ornithine transport system ATPase  37.74 
 
 
325 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151852  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2033  arginine/ornithine transport system ATPase  36.69 
 
 
329 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05690  arginine/ornithine transport system ATPase  37.5 
 
 
333 aa  183  3e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1237  arginine/ornithine transport system ATPase  37.18 
 
 
336 aa  182  6e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3302  LAO/AO transport system ATPase  39.39 
 
 
374 aa  182  6e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.107074  normal  0.916816 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1350  arginine/ornithine transport system ATPase  38.85 
 
 
372 aa  182  7e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0354539  unclonable  0.0000000282575 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1754  arginine/ornithine transport system ATPase  36.76 
 
 
331 aa  182  7e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.151104 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1922  arginine/ornithine transport system ATPase  36.36 
 
 
330 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.597439 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1850  arginine/ornithine transport system ATPase  38.28 
 
 
342 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2490  arginine/ornithine transport system ATPase  39.02 
 
 
328 aa  180  4e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2020  LAO/AO transport system ATPase  34.47 
 
 
339 aa  178  9e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526211 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1945  arginine/ornithine transport system ATPase  37.74 
 
 
332 aa  178  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.522383 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1172  LAO/AO transport system ATPase  33.23 
 
 
335 aa  177  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.978419  decreased coverage  0.00325794 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1919  LAO/AO transport system ATPase  38.44 
 
 
327 aa  178  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.250647  normal  0.437335 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3873  arginine/ornithine transport system ATPase  39.01 
 
 
380 aa  177  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0439716  normal  0.14687 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>