235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0512 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0512  LAO/AO transport system ATPase  100 
 
 
300 aa  609  1e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0153  LAO/AO transport system ATPase  53.06 
 
 
296 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.677625  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5998  LAO/AO transport system ATPase  50.42 
 
 
307 aa  243  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0515982 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0943  LAO/AO transport system ATPase  50.41 
 
 
314 aa  240  2e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1798  LAO/AO transport system ATPase  50 
 
 
323 aa  236  4e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3108  LAO/AO transport system ATPase  47.96 
 
 
304 aa  233  2.0000000000000002e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0453606 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3009  LAO/AO transport system ATPase  47.88 
 
 
308 aa  231  9e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.072512 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0586  LAO/AO transport system ATPase  49.42 
 
 
310 aa  229  4e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.585715  normal  0.982729 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1260  LAO/AO transport system ATPase  48.76 
 
 
319 aa  228  8e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0358  LAO/AO transport system ATPase  46.75 
 
 
318 aa  228  9e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2365  LAO/AO transport system ATPase  42.31 
 
 
318 aa  226  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1281  LAO/AO transport system ATPase  43.19 
 
 
317 aa  226  3e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.417761  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4647  LAO/AO transport system ATPase  45.56 
 
 
325 aa  225  7e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0480374  normal  0.487392 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1613  LAO/AO transport system ATPase  42.86 
 
 
312 aa  223  3e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.375817 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3795  LAO/AO transport system ATPase  49.8 
 
 
290 aa  222  6e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3868  LAO/AO transport system ATPase  49.8 
 
 
290 aa  222  6e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119113  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3799  LAO/AO transport system ATPase  49.8 
 
 
290 aa  222  6e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.205117  normal  0.899663 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4110  LAO/AO transport system ATPase  38.96 
 
 
316 aa  221  9.999999999999999e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.162136  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3103  LAO/AO transport system ATPase  47.06 
 
 
335 aa  221  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0011081  hitchhiker  0.0000652797 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2397  LAO/AO transport system ATPase  50.22 
 
 
303 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.73846  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4301  LAO/AO transport system ATPase  45.45 
 
 
292 aa  220  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.635078  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2999  LAO/AO transport system ATPase  49.17 
 
 
316 aa  219  3e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0899  LAO/AO transport system ATPase  44.64 
 
 
357 aa  219  3.9999999999999997e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2027  LAO/AO transport system ATPase  45.35 
 
 
316 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00170815  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2025  LAO/AO transport system ATPase  48.33 
 
 
312 aa  219  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82524  decreased coverage  0.000989669 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1853  LAO/AO transport system ATPase  47.37 
 
 
309 aa  219  5e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4359  LAO/AO transport system ATPase  41.94 
 
 
364 aa  219  5e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.460456  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2806  LAO/AO transport system ATPase  45.56 
 
 
326 aa  219  5e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0864794  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3990  LAO/AO transport system ATPase  44.72 
 
 
329 aa  215  9e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1698  LAO/AO transport system ATPase  44.92 
 
 
322 aa  215  9e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238616  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3609  LAO/AO transport system ATPase  44.72 
 
 
345 aa  214  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0389  LAO/AO transport system ATPase  46.09 
 
 
317 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000146012  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1321  LAO/AO transport system ATPase  46.56 
 
 
312 aa  213  2.9999999999999995e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4250  LAO/AO transport system ATPase  46.89 
 
 
322 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2160  LAO/AO transport system ATPase  41.79 
 
 
341 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.104519 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2473  LAO/AO transport system ATPase  41.5 
 
 
375 aa  213  3.9999999999999995e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2170  LAO/AO transport system ATPase  46.34 
 
 
341 aa  211  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300615  normal  0.661007 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0456  LAO/AO transport system ATPase  46.4 
 
 
325 aa  209  4e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.614853 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2690  LAO/AO transport system ATPase  40.62 
 
 
314 aa  209  4e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249774  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2297  LAO/AO transport system ATPase  40.51 
 
 
344 aa  209  5e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.413391  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1549  LAO/AO transport system ATPase  40.62 
 
 
314 aa  209  6e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000360873 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1576  ArgK protein  44.08 
 
 
320 aa  208  9e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000113447  normal  0.451299 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1268  LAO/AO transport system ATPase  43.35 
 
 
312 aa  207  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0673  LAO/AO transport system ATPase  44.94 
 
 
340 aa  208  1e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1911  LAO/AO transport system ATPase  46.15 
 
 
318 aa  208  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0463697  normal  0.161513 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1579  LAO/AO transport system ATPase  38.85 
 
 
319 aa  207  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5042  LAO/AO transport system ATPase  48.57 
 
 
329 aa  207  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13609  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2690  LAO/AO transport system ATPase  45.38 
 
 
321 aa  206  5e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1649  LAO/AO transport system ATPase  39.42 
 
 
344 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.840992  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2209  LAO/AO transport system ATPase  40.07 
 
 
344 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.249756  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1045  LAO/AO transport system ATPase  45.63 
 
 
356 aa  204  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.172221  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3772  LAO/AO transport system ATPase  39.2 
 
 
318 aa  203  3e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.339101 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2533  LAO/AO transport system ATPase  43.87 
 
 
316 aa  202  6e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.227946  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3988  LAO/AO transport system ATPase  43.57 
 
 
324 aa  201  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0540  putative transport system kinase  44.9 
 
 
327 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.167721  hitchhiker  0.00219183 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1770  LAO/AO transport system ATPase  45.02 
 
 
322 aa  198  9e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292624  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0511  LAO/AO transport system ATPase  40.94 
 
 
378 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3656  LAO/AO transport system ATPase  40.86 
 
 
323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.959092  normal  0.164513 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0581  LAO/AO transport system ATPase  44.9 
 
 
292 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.730832  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0801  LAO/AO transport system ATPase  47.03 
 
 
299 aa  194  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2210  ArgK protein  41.6 
 
 
330 aa  193  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000516978  normal  0.0100138 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1674  LAO/AO transport system ATPase  38.67 
 
 
312 aa  193  4e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2130  LAO/AO transport system ATPase  44 
 
 
327 aa  191  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5020  LAO/AO transport system ATPase  42.21 
 
 
332 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778595  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0551  ArgK protein  41.45 
 
 
310 aa  186  5e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2056  LAO/AO transport system ATPase  33.87 
 
 
314 aa  182  5.0000000000000004e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4372  LAO/AO transport system ATPase  38.49 
 
 
329 aa  178  8e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4005  arginine/ornithine transport system ATPase  38.14 
 
 
329 aa  177  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1322  arginine/ornithine transport system ATPase  37.67 
 
 
351 aa  177  2e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.822906  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0374  arginine/ornithine transport system ATPase  40.43 
 
 
329 aa  176  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5087  LAO/AO transport system ATPase  42.45 
 
 
333 aa  176  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2490  arginine/ornithine transport system ATPase  38.38 
 
 
328 aa  176  5e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1780  LAO/AO transport system ATPase  47.73 
 
 
321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0298  arginine/ornithine transport system ATPase  39.07 
 
 
346 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.206617 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1350  arginine/ornithine transport system ATPase  38.83 
 
 
372 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0354539  unclonable  0.0000000282575 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0080  LAO/AO transport system ATPase  35.4 
 
 
315 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0342  arginine/ornithine transport system ATPase  38.99 
 
 
329 aa  171  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1360  LAO/AO transport system ATPase  35.95 
 
 
316 aa  170  3e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000108838  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2592  LAO/AO transport system ATPase  39.31 
 
 
319 aa  168  8e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3480  arginine/ornithine transport system ATPase  39.72 
 
 
328 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.46606  normal  0.0872871 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05690  arginine/ornithine transport system ATPase  37.94 
 
 
333 aa  167  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3542  arginine/ornithine transport system ATPase  39.92 
 
 
330 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.749977 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2033  arginine/ornithine transport system ATPase  40.16 
 
 
329 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1922  arginine/ornithine transport system ATPase  39.92 
 
 
330 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.597439 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1086  arginine/ornithine transport system ATPase  38.21 
 
 
345 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1166  arginine/ornithine transport system ATPase  38.06 
 
 
337 aa  167  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00541841  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3485  arginine/ornithine transport system ATPase  37.59 
 
 
347 aa  167  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2944  ArgK protein  45.66 
 
 
319 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.162227  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5021  LAO/AO transport system ATPase  39.45 
 
 
363 aa  166  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0197522  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1919  LAO/AO transport system ATPase  33.67 
 
 
327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.250647  normal  0.437335 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1754  arginine/ornithine transport system ATPase  37.15 
 
 
331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.151104 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3019  arginine/ornithine transport system ATPase  34.32 
 
 
330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.527055 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2114  arginine/ornithine transport system ATPase  37.86 
 
 
326 aa  163  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00605272 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2640  arginine/ornithine transport system ATPase  38.79 
 
 
326 aa  162  6e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5546  LAO/AO transport system ATPase  37.3 
 
 
372 aa  162  8.000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3004  arginine/ornithine transport system ATPase  37.05 
 
 
364 aa  162  9e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.487769  normal  0.192606 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3121  arginine/ornithine transport system ATPase  37.65 
 
 
325 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3182  arginine/ornithine transport system ATPase  37.65 
 
 
325 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.968151  normal  0.139966 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2764  arginine/ornithine transport system ATPase  38.13 
 
 
331 aa  161  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0468013  normal  0.748538 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3189  arginine/ornithine transport system ATPase  37.65 
 
 
322 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  normal  0.363793 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>