228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4301 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4301  LAO/AO transport system ATPase  100 
 
 		 292 aa  552  1e-156  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.635078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3795  LAO/AO transport system ATPase  76.06 
 
 		 290 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3868  LAO/AO transport system ATPase  76.06 
 
 		 290 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3799  LAO/AO transport system ATPase  76.06 
 
 		 290 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.205117  normal  0.899663 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2397  LAO/AO transport system ATPase  74.48 
 
 		 303 aa  380  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.73846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4250  LAO/AO transport system ATPase  72.28 
 
 		 322 aa  367  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1260  LAO/AO transport system ATPase  51.28 
 
 		 319 aa  261  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4110  LAO/AO transport system ATPase  55.27 
 
 		 316 aa  261  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.162136  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1698  LAO/AO transport system ATPase  51.62 
 
 		 322 aa  256  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238616  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2170  LAO/AO transport system ATPase  52.4 
 
 		 341 aa  255  7e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300615  normal  0.661007 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0358  LAO/AO transport system ATPase  50.67 
 
 		 318 aa  251  1e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1798  LAO/AO transport system ATPase  53.97 
 
 		 323 aa  249  4e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1045  LAO/AO transport system ATPase  50.16 
 
 		 356 aa  248  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.172221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5998  LAO/AO transport system ATPase  51.48 
 
 		 307 aa  245  6.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0515982 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3990  LAO/AO transport system ATPase  52.32 
 
 		 329 aa  243  3e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3609  LAO/AO transport system ATPase  51.66 
 
 		 345 aa  243  3e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0673  LAO/AO transport system ATPase  55.87 
 
 		 340 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3103  LAO/AO transport system ATPase  49.37 
 
 		 335 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0011081  hitchhiker  0.0000652797 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0512  LAO/AO transport system ATPase  44.86 
 
 		 300 aa  228  6e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0586  LAO/AO transport system ATPase  46.1 
 
 		 310 aa  228  9e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.585715  normal  0.982729 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1576  ArgK protein  43.23 
 
 		 320 aa  226  3e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000113447  normal  0.451299 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3108  LAO/AO transport system ATPase  46.67 
 
 		 304 aa  226  3e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0453606 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3009  LAO/AO transport system ATPase  47.4 
 
 		 308 aa  224  1e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.072512 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2025  LAO/AO transport system ATPase  47.83 
 
 		 312 aa  223  4e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82524  decreased coverage  0.000989669 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2027  LAO/AO transport system ATPase  41.47 
 
 		 316 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00170815  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1549  LAO/AO transport system ATPase  41.81 
 
 		 314 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000360873 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2690  LAO/AO transport system ATPase  41.81 
 
 		 314 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249774  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1579  LAO/AO transport system ATPase  43.14 
 
 		 319 aa  216  4e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3772  LAO/AO transport system ATPase  46.08 
 
 		 318 aa  215  5e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.339101 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1780  LAO/AO transport system ATPase  57.83 
 
 		 321 aa  215  5.9999999999999996e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1281  LAO/AO transport system ATPase  43.46 
 
 		 317 aa  215  9e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.417761  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2365  LAO/AO transport system ATPase  42.76 
 
 		 318 aa  214  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0943  LAO/AO transport system ATPase  43.19 
 
 		 314 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0389  LAO/AO transport system ATPase  42.81 
 
 		 317 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000146012  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2690  LAO/AO transport system ATPase  48.05 
 
 		 321 aa  212  5.999999999999999e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2999  LAO/AO transport system ATPase  46.65 
 
 		 316 aa  212  5.999999999999999e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4359  LAO/AO transport system ATPase  40.96 
 
 		 364 aa  210  2e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.460456  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1853  LAO/AO transport system ATPase  41.84 
 
 		 309 aa  210  3e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0153  LAO/AO transport system ATPase  49.37 
 
 		 296 aa  206  3e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.677625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0801  LAO/AO transport system ATPase  56.85 
 
 		 299 aa  206  5e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0456  LAO/AO transport system ATPase  38.49 
 
 		 325 aa  204  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.614853 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0540  putative transport system kinase  44.7 
 
 		 327 aa  204  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.167721  hitchhiker  0.00219183 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0511  LAO/AO transport system ATPase  40.55 
 
 		 378 aa  203  2e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1613  LAO/AO transport system ATPase  50.86 
 
 		 312 aa  202  4e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.375817 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0899  LAO/AO transport system ATPase  39.39 
 
 		 357 aa  202  7e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2160  LAO/AO transport system ATPase  47.86 
 
 		 341 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.104519 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2473  LAO/AO transport system ATPase  37.76 
 
 		 375 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2806  LAO/AO transport system ATPase  40.46 
 
 		 326 aa  199  3e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0864794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1674  LAO/AO transport system ATPase  41.22 
 
 		 312 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2209  LAO/AO transport system ATPase  47.13 
 
 		 344 aa  198  7e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.249756  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1911  LAO/AO transport system ATPase  40.86 
 
 		 318 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0463697  normal  0.161513 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2297  LAO/AO transport system ATPase  46.74 
 
 		 344 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.413391  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1268  LAO/AO transport system ATPase  40.89 
 
 		 312 aa  196  4.0000000000000005e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1649  LAO/AO transport system ATPase  47.13 
 
 		 344 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.840992  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5042  LAO/AO transport system ATPase  53.88 
 
 		 329 aa  194  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2210  ArgK protein  41.25 
 
 		 330 aa  194  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000516978  normal  0.0100138 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1321  LAO/AO transport system ATPase  38.52 
 
 		 312 aa  193  3e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1770  LAO/AO transport system ATPase  40.52 
 
 		 322 aa  193  4e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292624  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3988  LAO/AO transport system ATPase  46.09 
 
 		 324 aa  191  8e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2130  LAO/AO transport system ATPase  51.05 
 
 		 327 aa  190  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2533  LAO/AO transport system ATPase  43.21 
 
 		 316 aa  188  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.227946  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3656  LAO/AO transport system ATPase  40.73 
 
 		 323 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.959092  normal  0.164513 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4647  LAO/AO transport system ATPase  40.6 
 
 		 325 aa  185  7e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0480374  normal  0.487392 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5020  LAO/AO transport system ATPase  41.2 
 
 		 332 aa  182  6e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778595  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0080  LAO/AO transport system ATPase  36.86 
 
 		 315 aa  176  4e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0551  ArgK protein  31.6 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0581  LAO/AO transport system ATPase  35.71 
 
 		 292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.730832  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1360  LAO/AO transport system ATPase  33.78 
 
 		 316 aa  168  1e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000108838  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2592  LAO/AO transport system ATPase  43.94 
 
 		 319 aa  167  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5087  LAO/AO transport system ATPase  40 
 
 		 333 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2944  ArgK protein  48 
 
 		 319 aa  163  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.162227  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2056  LAO/AO transport system ATPase  37.04 
 
 		 314 aa  156  4e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3485  arginine/ornithine transport system ATPase  39.15 
 
 		 347 aa  155  9e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1922  arginine/ornithine transport system ATPase  38.04 
 
 		 330 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.597439 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1919  LAO/AO transport system ATPase  38.72 
 
 		 327 aa  152  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.250647  normal  0.437335 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2033  arginine/ornithine transport system ATPase  41.08 
 
 		 329 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3019  arginine/ornithine transport system ATPase  37.13 
 
 		 330 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.527055 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1705  arginine/ornithine transport system ATPase  39.16 
 
 		 346 aa  152  7e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.476262  normal  0.0539762 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2764  arginine/ornithine transport system ATPase  37.95 
 
 		 331 aa  152  7e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0468013  normal  0.748538 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3648  arginine/ornithine transport system ATPase  39.86 
 
 		 332 aa  152  8e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1850  arginine/ornithine transport system ATPase  39.71 
 
 		 342 aa  150  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2041  arginine/ornithine transport system ATPase  39.71 
 
 		 321 aa  150  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.749207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3542  arginine/ornithine transport system ATPase  36.73 
 
 		 330 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.749977 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1754  arginine/ornithine transport system ATPase  37.68 
 
 		 331 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.151104 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0955  LAO/AO transport system ATPase  41.45 
 
 		 305 aa  150  3e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0032483 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3132  arginine/ornithine transport system ATPase  37.38 
 
 		 325 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2490  arginine/ornithine transport system ATPase  39.85 
 
 		 328 aa  150  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3189  arginine/ornithine transport system ATPase  41.35 
 
 		 322 aa  149  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  normal  0.363793 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3121  arginine/ornithine transport system ATPase  37.13 
 
 		 325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3182  arginine/ornithine transport system ATPase  37.13 
 
 		 325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.968151  normal  0.139966 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4005  arginine/ornithine transport system ATPase  37 
 
 		 329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3480  arginine/ornithine transport system ATPase  48.52 
 
 		 328 aa  147  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.46606  normal  0.0872871 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0387  LAO/AO transport system ATPase  37.81 
 
 		 332 aa  147  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4372  LAO/AO transport system ATPase  41.13 
 
 		 329 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4194  ArgK protein  47.58 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0374  arginine/ornithine transport system ATPase  42.4 
 
 		 329 aa  143  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2431  arginine/ornithine transport system ATPase  38.55 
 
 		 337 aa  143  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.698067  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2114  arginine/ornithine transport system ATPase  40.5 
 
 		 326 aa  142  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00605272 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2478  arginine/ornithine transport system ATPase  38.74 
 
 		 333 aa  142  6e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.341293  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22160  LAO/AO transport system ATPase  39.03 
 
 		 330 aa  141  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.436585 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>