210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0801 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0801  LAO/AO transport system ATPase  100 
 
 
299 aa  590  1e-168  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0358  LAO/AO transport system ATPase  59.36 
 
 
318 aa  256  3e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1260  LAO/AO transport system ATPase  54.39 
 
 
319 aa  243  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5998  LAO/AO transport system ATPase  55.36 
 
 
307 aa  239  2.9999999999999997e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0515982 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1698  LAO/AO transport system ATPase  56.12 
 
 
322 aa  239  5e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238616  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1576  ArgK protein  51.37 
 
 
320 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000113447  normal  0.451299 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1579  LAO/AO transport system ATPase  52.89 
 
 
319 aa  228  8e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0389  LAO/AO transport system ATPase  46.59 
 
 
317 aa  228  9e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000146012  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1798  LAO/AO transport system ATPase  55.46 
 
 
323 aa  228  1e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3609  LAO/AO transport system ATPase  53.42 
 
 
345 aa  227  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3990  LAO/AO transport system ATPase  53.42 
 
 
329 aa  227  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0943  LAO/AO transport system ATPase  46.9 
 
 
314 aa  226  4e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2027  LAO/AO transport system ATPase  52.75 
 
 
316 aa  224  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00170815  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3009  LAO/AO transport system ATPase  48.51 
 
 
308 aa  223  3e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.072512 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2806  LAO/AO transport system ATPase  51.24 
 
 
326 aa  221  8e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0864794  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1045  LAO/AO transport system ATPase  53.16 
 
 
356 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.172221  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1853  LAO/AO transport system ATPase  43.03 
 
 
309 aa  219  3e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4110  LAO/AO transport system ATPase  50.18 
 
 
316 aa  218  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.162136  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0540  putative transport system kinase  44.41 
 
 
327 aa  217  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.167721  hitchhiker  0.00219183 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1549  LAO/AO transport system ATPase  46.18 
 
 
314 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000360873 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2690  LAO/AO transport system ATPase  45.82 
 
 
314 aa  216  5e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249774  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2473  LAO/AO transport system ATPase  43.69 
 
 
375 aa  216  5e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3108  LAO/AO transport system ATPase  49.22 
 
 
304 aa  215  5.9999999999999996e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0453606 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2170  LAO/AO transport system ATPase  54.3 
 
 
341 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300615  normal  0.661007 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0899  LAO/AO transport system ATPase  44.48 
 
 
357 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4250  LAO/AO transport system ATPase  58.38 
 
 
322 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3772  LAO/AO transport system ATPase  51.52 
 
 
318 aa  212  4.9999999999999996e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.339101 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1674  LAO/AO transport system ATPase  41.86 
 
 
312 aa  212  7.999999999999999e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4359  LAO/AO transport system ATPase  45.39 
 
 
364 aa  211  1e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.460456  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0456  LAO/AO transport system ATPase  48.89 
 
 
325 aa  211  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.614853 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2209  LAO/AO transport system ATPase  49.79 
 
 
344 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.249756  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2160  LAO/AO transport system ATPase  50 
 
 
341 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.104519 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2025  LAO/AO transport system ATPase  46.33 
 
 
312 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82524  decreased coverage  0.000989669 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2533  LAO/AO transport system ATPase  45.36 
 
 
316 aa  209  3e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.227946  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2297  LAO/AO transport system ATPase  48.97 
 
 
344 aa  209  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.413391  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3795  LAO/AO transport system ATPase  56.34 
 
 
290 aa  208  7e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3868  LAO/AO transport system ATPase  56.34 
 
 
290 aa  208  7e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119113  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3799  LAO/AO transport system ATPase  56.34 
 
 
290 aa  208  7e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.205117  normal  0.899663 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1649  LAO/AO transport system ATPase  49.38 
 
 
344 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.840992  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2999  LAO/AO transport system ATPase  51.17 
 
 
316 aa  207  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1321  LAO/AO transport system ATPase  43.29 
 
 
312 aa  206  4e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2397  LAO/AO transport system ATPase  52.75 
 
 
303 aa  205  8e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.73846  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0511  LAO/AO transport system ATPase  41.64 
 
 
378 aa  202  5e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0586  LAO/AO transport system ATPase  48.26 
 
 
310 aa  201  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.585715  normal  0.982729 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2365  LAO/AO transport system ATPase  49.31 
 
 
318 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1911  LAO/AO transport system ATPase  43.64 
 
 
318 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0463697  normal  0.161513 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1281  LAO/AO transport system ATPase  50 
 
 
317 aa  199  5e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.417761  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3988  LAO/AO transport system ATPase  50.22 
 
 
324 aa  198  7.999999999999999e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1613  LAO/AO transport system ATPase  49.79 
 
 
312 aa  195  6e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.375817 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1780  LAO/AO transport system ATPase  59.89 
 
 
321 aa  195  7e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0512  LAO/AO transport system ATPase  43.21 
 
 
300 aa  194  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1770  LAO/AO transport system ATPase  40.38 
 
 
322 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292624  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3103  LAO/AO transport system ATPase  51.43 
 
 
335 aa  193  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0011081  hitchhiker  0.0000652797 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0673  LAO/AO transport system ATPase  52.22 
 
 
340 aa  193  4e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4647  LAO/AO transport system ATPase  45.31 
 
 
325 aa  192  7e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0480374  normal  0.487392 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4301  LAO/AO transport system ATPase  54.93 
 
 
292 aa  191  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.635078  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3656  LAO/AO transport system ATPase  44.9 
 
 
323 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.959092  normal  0.164513 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5087  LAO/AO transport system ATPase  46.72 
 
 
333 aa  189  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1268  LAO/AO transport system ATPase  35.25 
 
 
312 aa  189  4e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0581  LAO/AO transport system ATPase  41.06 
 
 
292 aa  189  5e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.730832  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5042  LAO/AO transport system ATPase  47.71 
 
 
329 aa  189  5e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13609  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2690  LAO/AO transport system ATPase  43.72 
 
 
321 aa  186  5e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2130  LAO/AO transport system ATPase  47.86 
 
 
327 aa  183  3e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5020  LAO/AO transport system ATPase  43.88 
 
 
332 aa  182  6e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778595  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2210  ArgK protein  43.88 
 
 
330 aa  181  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000516978  normal  0.0100138 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05690  arginine/ornithine transport system ATPase  43.83 
 
 
333 aa  175  9e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0153  LAO/AO transport system ATPase  40 
 
 
296 aa  169  4e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.677625  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2421  LAO/AO transport system ATPase  36.81 
 
 
343 aa  168  9e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22160  LAO/AO transport system ATPase  43.78 
 
 
330 aa  165  1.0000000000000001e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.436585 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1705  arginine/ornithine transport system ATPase  36.64 
 
 
346 aa  164  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.476262  normal  0.0539762 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2764  arginine/ornithine transport system ATPase  42.24 
 
 
331 aa  163  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0468013  normal  0.748538 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3019  arginine/ornithine transport system ATPase  37.28 
 
 
330 aa  163  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.527055 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0080  LAO/AO transport system ATPase  34.43 
 
 
315 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2478  arginine/ornithine transport system ATPase  42.11 
 
 
333 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.341293  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5546  LAO/AO transport system ATPase  39.58 
 
 
372 aa  161  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2033  arginine/ornithine transport system ATPase  37 
 
 
329 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3542  arginine/ornithine transport system ATPase  37.41 
 
 
330 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.749977 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3121  arginine/ornithine transport system ATPase  40.43 
 
 
325 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3182  arginine/ornithine transport system ATPase  40.43 
 
 
325 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.968151  normal  0.139966 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3132  arginine/ornithine transport system ATPase  40.43 
 
 
325 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151852  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3648  arginine/ornithine transport system ATPase  37.42 
 
 
332 aa  159  5e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2763  arginine/ornithine transport system ATPase  39.26 
 
 
332 aa  157  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2056  LAO/AO transport system ATPase  36.93 
 
 
314 aa  158  1e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2490  arginine/ornithine transport system ATPase  42.11 
 
 
328 aa  158  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1360  LAO/AO transport system ATPase  41.33 
 
 
316 aa  156  3e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000108838  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3004  arginine/ornithine transport system ATPase  41.74 
 
 
364 aa  155  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.487769  normal  0.192606 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4372  LAO/AO transport system ATPase  38.68 
 
 
329 aa  155  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0551  ArgK protein  38.42 
 
 
310 aa  154  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1922  arginine/ornithine transport system ATPase  37.96 
 
 
330 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.597439 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5021  LAO/AO transport system ATPase  34.8 
 
 
363 aa  152  4e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0197522  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3302  LAO/AO transport system ATPase  37.1 
 
 
374 aa  152  5.9999999999999996e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.107074  normal  0.916816 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3543  LAO/AO transport system ATPase  39.92 
 
 
328 aa  150  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.569209  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0955  LAO/AO transport system ATPase  39.7 
 
 
305 aa  150  2e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0032483 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0792  arginine/ornithine transport system ATPase  34.4 
 
 
331 aa  150  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3245  arginine/ornithine transport system ATPase  34.4 
 
 
331 aa  150  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2114  arginine/ornithine transport system ATPase  38.91 
 
 
326 aa  149  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00605272 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3485  arginine/ornithine transport system ATPase  38.29 
 
 
347 aa  149  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02749  arginine/ornithine transport system ATPase  34.04 
 
 
331 aa  149  5e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02712  hypothetical protein  34.04 
 
 
331 aa  149  5e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3076  arginine/ornithine transport system ATPase  34.04 
 
 
331 aa  149  5e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>