216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2025 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2025  LAO/AO transport system ATPase  100 
 
 		 312 aa  606  9.999999999999999e-173  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82524  decreased coverage  0.000989669 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2999  LAO/AO transport system ATPase  85.53 
 
 		 316 aa  498  1e-140  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0586  LAO/AO transport system ATPase  62.54 
 
 		 310 aa  342  5e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.585715  normal  0.982729 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3988  LAO/AO transport system ATPase  58.65 
 
 		 324 aa  328  9e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1674  LAO/AO transport system ATPase  48.34 
 
 		 312 aa  299  5e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1576  ArgK protein  48.05 
 
 		 320 aa  291  9e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000113447  normal  0.451299 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1853  LAO/AO transport system ATPase  48.39 
 
 		 309 aa  288  1e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0389  LAO/AO transport system ATPase  48.08 
 
 		 317 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000146012  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2027  LAO/AO transport system ATPase  47.08 
 
 		 316 aa  279  4e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00170815  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1579  LAO/AO transport system ATPase  46.43 
 
 		 319 aa  278  9e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0358  LAO/AO transport system ATPase  49.03 
 
 		 318 aa  277  2e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2365  LAO/AO transport system ATPase  48.54 
 
 		 318 aa  276  3e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1798  LAO/AO transport system ATPase  51.68 
 
 		 323 aa  275  7e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0943  LAO/AO transport system ATPase  46.35 
 
 		 314 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2160  LAO/AO transport system ATPase  49.25 
 
 		 341 aa  274  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.104519 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2690  LAO/AO transport system ATPase  46.43 
 
 		 314 aa  273  3e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249774  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1549  LAO/AO transport system ATPase  46.43 
 
 		 314 aa  272  4.0000000000000004e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000360873 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5998  LAO/AO transport system ATPase  49.03 
 
 		 307 aa  272  6e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0515982 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2806  LAO/AO transport system ATPase  46.96 
 
 		 326 aa  271  2e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0864794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2209  LAO/AO transport system ATPase  47.75 
 
 		 344 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.249756  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2297  LAO/AO transport system ATPase  47.75 
 
 		 344 aa  269  4e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.413391  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1649  LAO/AO transport system ATPase  48.05 
 
 		 344 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.840992  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0899  LAO/AO transport system ATPase  45 
 
 		 357 aa  267  2e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4359  LAO/AO transport system ATPase  45.56 
 
 		 364 aa  267  2e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.460456  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0456  LAO/AO transport system ATPase  46.2 
 
 		 325 aa  266  2.9999999999999995e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.614853 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1260  LAO/AO transport system ATPase  47.59 
 
 		 319 aa  265  8e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1698  LAO/AO transport system ATPase  49.52 
 
 		 322 aa  262  4.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238616  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2473  LAO/AO transport system ATPase  43.66 
 
 		 375 aa  262  6.999999999999999e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1281  LAO/AO transport system ATPase  47.6 
 
 		 317 aa  261  1e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.417761  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3108  LAO/AO transport system ATPase  48.53 
 
 		 304 aa  260  2e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0453606 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4110  LAO/AO transport system ATPase  49.68 
 
 		 316 aa  259  6e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.162136  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2210  ArgK protein  43.79 
 
 		 330 aa  258  9e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000516978  normal  0.0100138 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1268  LAO/AO transport system ATPase  44.16 
 
 		 312 aa  257  2e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3609  LAO/AO transport system ATPase  50.5 
 
 		 345 aa  257  2e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3990  LAO/AO transport system ATPase  48.99 
 
 		 329 aa  255  8e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2170  LAO/AO transport system ATPase  48.54 
 
 		 341 aa  254  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300615  normal  0.661007 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5020  LAO/AO transport system ATPase  47.6 
 
 		 332 aa  253  4.0000000000000004e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3009  LAO/AO transport system ATPase  48.05 
 
 		 308 aa  252  5.000000000000001e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.072512 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3656  LAO/AO transport system ATPase  45.19 
 
 		 323 aa  252  7e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.959092  normal  0.164513 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0511  LAO/AO transport system ATPase  43.07 
 
 		 378 aa  251  1e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3772  LAO/AO transport system ATPase  47.44 
 
 		 318 aa  251  1e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.339101 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0540  putative transport system kinase  46.52 
 
 		 327 aa  250  3e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.167721  hitchhiker  0.00219183 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2533  LAO/AO transport system ATPase  44.3 
 
 		 316 aa  245  6e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.227946  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2130  LAO/AO transport system ATPase  51.14 
 
 		 327 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4647  LAO/AO transport system ATPase  44.13 
 
 		 325 aa  243  3.9999999999999997e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0480374  normal  0.487392 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0673  LAO/AO transport system ATPase  55.65 
 
 		 340 aa  240  2e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1045  LAO/AO transport system ATPase  45.63 
 
 		 356 aa  237  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.172221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1911  LAO/AO transport system ATPase  41.23 
 
 		 318 aa  237  2e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0463697  normal  0.161513 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1613  LAO/AO transport system ATPase  49.28 
 
 		 312 aa  232  6e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.375817 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1321  LAO/AO transport system ATPase  41.88 
 
 		 312 aa  229  5e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5087  LAO/AO transport system ATPase  44.37 
 
 		 333 aa  228  9e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5042  LAO/AO transport system ATPase  55.1 
 
 		 329 aa  227  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1770  LAO/AO transport system ATPase  36.92 
 
 		 322 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292624  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0080  LAO/AO transport system ATPase  37.59 
 
 		 315 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0512  LAO/AO transport system ATPase  48.33 
 
 		 300 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3103  LAO/AO transport system ATPase  45.14 
 
 		 335 aa  218  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0011081  hitchhiker  0.0000652797 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2397  LAO/AO transport system ATPase  45.17 
 
 		 303 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.73846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3795  LAO/AO transport system ATPase  45.75 
 
 		 290 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3868  LAO/AO transport system ATPase  45.75 
 
 		 290 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3799  LAO/AO transport system ATPase  45.75 
 
 		 290 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.205117  normal  0.899663 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2690  LAO/AO transport system ATPase  43.68 
 
 		 321 aa  211  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0955  LAO/AO transport system ATPase  38.98 
 
 		 305 aa  209  4e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0032483 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2020  LAO/AO transport system ATPase  37.89 
 
 		 339 aa  209  4e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526211 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2056  LAO/AO transport system ATPase  39.03 
 
 		 314 aa  208  1e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4250  LAO/AO transport system ATPase  50.21 
 
 		 322 aa  206  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0581  LAO/AO transport system ATPase  37.16 
 
 		 292 aa  205  7e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.730832  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4301  LAO/AO transport system ATPase  46.92 
 
 		 292 aa  205  9e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.635078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0078  LAO/AO transport system ATPase  40.13 
 
 		 331 aa  205  9e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0801  LAO/AO transport system ATPase  45.77 
 
 		 299 aa  203  3e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0153  LAO/AO transport system ATPase  50.22 
 
 		 296 aa  202  4e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.677625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05690  arginine/ornithine transport system ATPase  42.65 
 
 		 333 aa  201  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3302  LAO/AO transport system ATPase  39.44 
 
 		 374 aa  201  1.9999999999999998e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.107074  normal  0.916816 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5021  LAO/AO transport system ATPase  35.2 
 
 		 363 aa  200  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0197522  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2490  arginine/ornithine transport system ATPase  42 
 
 		 328 aa  199  5e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1360  LAO/AO transport system ATPase  34.94 
 
 		 316 aa  199  7e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000108838  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4005  arginine/ornithine transport system ATPase  40.91 
 
 		 329 aa  194  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2421  LAO/AO transport system ATPase  43.4 
 
 		 343 aa  194  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0342  arginine/ornithine transport system ATPase  42.25 
 
 		 329 aa  193  4e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0298  arginine/ornithine transport system ATPase  42.25 
 
 		 346 aa  193  4e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.206617 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2592  LAO/AO transport system ATPase  44.01 
 
 		 319 aa  193  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2764  arginine/ornithine transport system ATPase  40.25 
 
 		 331 aa  192  5e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0468013  normal  0.748538 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1705  arginine/ornithine transport system ATPase  39.81 
 
 		 346 aa  192  5e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.476262  normal  0.0539762 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09151  arginine/ornithine transport system ATPase  39.08 
 
 		 359 aa  192  6e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.471004  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22160  LAO/AO transport system ATPase  44.22 
 
 		 330 aa  192  6e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.436585 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5546  LAO/AO transport system ATPase  44.23 
 
 		 372 aa  191  9e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2763  arginine/ornithine transport system ATPase  42.97 
 
 		 332 aa  191  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3121  arginine/ornithine transport system ATPase  41.28 
 
 		 325 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3182  arginine/ornithine transport system ATPase  41.28 
 
 		 325 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.968151  normal  0.139966 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1086  arginine/ornithine transport system ATPase  41.67 
 
 		 345 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0374  arginine/ornithine transport system ATPase  42.24 
 
 		 329 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1850  arginine/ornithine transport system ATPase  39.35 
 
 		 342 aa  189  4e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3132  arginine/ornithine transport system ATPase  40.93 
 
 		 325 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1350  arginine/ornithine transport system ATPase  39.13 
 
 		 372 aa  189  5e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0354539  unclonable  0.0000000282575 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3019  arginine/ornithine transport system ATPase  39.68 
 
 		 330 aa  189  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.527055 
 
 
-
 
NC_002950  PG0321  arginine/ornithine transport system ATPase  35.11 
 
 		 343 aa  187  2e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.659399 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2293  arginine/ornithine transport system ATPase  39.92 
 
 		 366 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000757851  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3480  arginine/ornithine transport system ATPase  41.28 
 
 		 328 aa  186  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.46606  normal  0.0872871 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2478  arginine/ornithine transport system ATPase  37.63 
 
 		 333 aa  187  3e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.341293  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1322  arginine/ornithine transport system ATPase  46.28 
 
 		 351 aa  187  3e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.822906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3340  arginine/ornithine transport system ATPase  39.23 
 
 		 331 aa  186  4e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>