211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3103 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3103  LAO/AO transport system ATPase  100 
 
 
335 aa  627  1e-179  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0011081  hitchhiker  0.0000652797 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1698  LAO/AO transport system ATPase  51.57 
 
 
322 aa  276  4e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238616  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5998  LAO/AO transport system ATPase  51.54 
 
 
307 aa  275  8e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0515982 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4110  LAO/AO transport system ATPase  54.37 
 
 
316 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.162136  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1260  LAO/AO transport system ATPase  50.48 
 
 
319 aa  266  5e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3990  LAO/AO transport system ATPase  54.14 
 
 
329 aa  265  7e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2170  LAO/AO transport system ATPase  52.81 
 
 
341 aa  265  8e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300615  normal  0.661007 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3609  LAO/AO transport system ATPase  53.31 
 
 
345 aa  263  4e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1798  LAO/AO transport system ATPase  51.07 
 
 
323 aa  261  1e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1045  LAO/AO transport system ATPase  52.09 
 
 
356 aa  260  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.172221  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0358  LAO/AO transport system ATPase  50.31 
 
 
318 aa  258  1e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0673  LAO/AO transport system ATPase  54.18 
 
 
340 aa  246  3e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0943  LAO/AO transport system ATPase  45.43 
 
 
314 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2397  LAO/AO transport system ATPase  52.19 
 
 
303 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.73846  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1674  LAO/AO transport system ATPase  42.68 
 
 
312 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3795  LAO/AO transport system ATPase  50.78 
 
 
290 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3868  LAO/AO transport system ATPase  50.78 
 
 
290 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119113  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4250  LAO/AO transport system ATPase  49.84 
 
 
322 aa  238  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3799  LAO/AO transport system ATPase  50.78 
 
 
290 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.205117  normal  0.899663 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3009  LAO/AO transport system ATPase  47.9 
 
 
308 aa  238  1e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.072512 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0586  LAO/AO transport system ATPase  47.94 
 
 
310 aa  238  2e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.585715  normal  0.982729 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3108  LAO/AO transport system ATPase  46.71 
 
 
304 aa  236  3e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0453606 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2160  LAO/AO transport system ATPase  47.71 
 
 
341 aa  232  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.104519 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1576  ArgK protein  45.77 
 
 
320 aa  231  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000113447  normal  0.451299 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2027  LAO/AO transport system ATPase  41.72 
 
 
316 aa  231  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00170815  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3988  LAO/AO transport system ATPase  54.33 
 
 
324 aa  231  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1549  LAO/AO transport system ATPase  43.27 
 
 
314 aa  229  4e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000360873 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0389  LAO/AO transport system ATPase  41.8 
 
 
317 aa  229  4e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000146012  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2690  LAO/AO transport system ATPase  42.95 
 
 
314 aa  228  8e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249774  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4301  LAO/AO transport system ATPase  49.2 
 
 
292 aa  228  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.635078  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0512  LAO/AO transport system ATPase  42.39 
 
 
300 aa  226  4e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5020  LAO/AO transport system ATPase  45.43 
 
 
332 aa  226  4e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778595  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2025  LAO/AO transport system ATPase  44.89 
 
 
312 aa  225  7e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82524  decreased coverage  0.000989669 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3772  LAO/AO transport system ATPase  44.13 
 
 
318 aa  225  8e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.339101 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4647  LAO/AO transport system ATPase  46.1 
 
 
325 aa  224  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0480374  normal  0.487392 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1579  LAO/AO transport system ATPase  45.59 
 
 
319 aa  224  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2806  LAO/AO transport system ATPase  46.86 
 
 
326 aa  223  4.9999999999999996e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0864794  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2209  LAO/AO transport system ATPase  47.78 
 
 
344 aa  222  6e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.249756  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2999  LAO/AO transport system ATPase  45.82 
 
 
316 aa  222  6e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2297  LAO/AO transport system ATPase  47.78 
 
 
344 aa  222  8e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.413391  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1281  LAO/AO transport system ATPase  43.35 
 
 
317 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.417761  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1853  LAO/AO transport system ATPase  42.11 
 
 
309 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2365  LAO/AO transport system ATPase  41.23 
 
 
318 aa  219  5e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1649  LAO/AO transport system ATPase  47.41 
 
 
344 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.840992  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1268  LAO/AO transport system ATPase  39.16 
 
 
312 aa  216  2.9999999999999998e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0899  LAO/AO transport system ATPase  41.64 
 
 
357 aa  217  2.9999999999999998e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1613  LAO/AO transport system ATPase  51.59 
 
 
312 aa  214  1.9999999999999998e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.375817 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3656  LAO/AO transport system ATPase  41.18 
 
 
323 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.959092  normal  0.164513 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2690  LAO/AO transport system ATPase  44.96 
 
 
321 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1770  LAO/AO transport system ATPase  37.54 
 
 
322 aa  212  7e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292624  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1321  LAO/AO transport system ATPase  38.68 
 
 
312 aa  212  9e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5042  LAO/AO transport system ATPase  54.36 
 
 
329 aa  211  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13609  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2533  LAO/AO transport system ATPase  43.27 
 
 
316 aa  210  3e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.227946  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2473  LAO/AO transport system ATPase  40 
 
 
375 aa  209  4e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1911  LAO/AO transport system ATPase  37.54 
 
 
318 aa  208  9e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0463697  normal  0.161513 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0456  LAO/AO transport system ATPase  44.92 
 
 
325 aa  208  9e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.614853 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4359  LAO/AO transport system ATPase  54.29 
 
 
364 aa  208  1e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.460456  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0511  LAO/AO transport system ATPase  43.35 
 
 
378 aa  207  3e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0540  putative transport system kinase  42.77 
 
 
327 aa  204  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.167721  hitchhiker  0.00219183 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2210  ArgK protein  41.01 
 
 
330 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000516978  normal  0.0100138 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2130  LAO/AO transport system ATPase  48.52 
 
 
327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0153  LAO/AO transport system ATPase  45.22 
 
 
296 aa  195  9e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.677625  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0801  LAO/AO transport system ATPase  51.43 
 
 
299 aa  194  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1780  LAO/AO transport system ATPase  51.72 
 
 
321 aa  191  1e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0581  LAO/AO transport system ATPase  35.71 
 
 
292 aa  191  2e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.730832  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5087  LAO/AO transport system ATPase  47.93 
 
 
333 aa  189  5.999999999999999e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0080  LAO/AO transport system ATPase  36.36 
 
 
315 aa  186  4e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0551  ArgK protein  41.92 
 
 
310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2592  LAO/AO transport system ATPase  45.94 
 
 
319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3132  arginine/ornithine transport system ATPase  40.12 
 
 
325 aa  172  5e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151852  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3121  arginine/ornithine transport system ATPase  40.12 
 
 
325 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3182  arginine/ornithine transport system ATPase  40.12 
 
 
325 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.968151  normal  0.139966 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2056  LAO/AO transport system ATPase  34.97 
 
 
314 aa  171  1e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1945  arginine/ornithine transport system ATPase  40.38 
 
 
332 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.522383 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2763  arginine/ornithine transport system ATPase  40 
 
 
332 aa  170  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1360  LAO/AO transport system ATPase  36.5 
 
 
316 aa  170  4e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000108838  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2431  arginine/ornithine transport system ATPase  49.51 
 
 
337 aa  170  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.698067  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3480  arginine/ornithine transport system ATPase  40.92 
 
 
328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.46606  normal  0.0872871 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4372  LAO/AO transport system ATPase  43.55 
 
 
329 aa  166  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2764  arginine/ornithine transport system ATPase  39.81 
 
 
331 aa  166  5e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0468013  normal  0.748538 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2944  ArgK protein  46.32 
 
 
319 aa  165  8e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.162227  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2490  arginine/ornithine transport system ATPase  48.5 
 
 
328 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3004  arginine/ornithine transport system ATPase  39.29 
 
 
364 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.487769  normal  0.192606 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2504  LAO/AO transport system ATPase  39.02 
 
 
329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000648266  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1015  arginine/ornithine transport system ATPase  40.25 
 
 
337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3648  arginine/ornithine transport system ATPase  39.38 
 
 
332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1705  arginine/ornithine transport system ATPase  39.33 
 
 
346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.476262  normal  0.0539762 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5021  LAO/AO transport system ATPase  34.26 
 
 
363 aa  163  4.0000000000000004e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0197522  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1237  arginine/ornithine transport system ATPase  35.8 
 
 
336 aa  162  7e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2033  arginine/ornithine transport system ATPase  38.87 
 
 
329 aa  162  9e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6417  LAO/AO transport system ATPase  43.25 
 
 
328 aa  162  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3543  LAO/AO transport system ATPase  39.26 
 
 
328 aa  162  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.569209  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05690  arginine/ornithine transport system ATPase  40.13 
 
 
333 aa  161  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3485  arginine/ornithine transport system ATPase  38.92 
 
 
347 aa  160  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1086  arginine/ornithine transport system ATPase  44.27 
 
 
345 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1356  LAO/AO transport system ATPase  45.19 
 
 
345 aa  160  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.229963  normal  0.961808 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2114  arginine/ornithine transport system ATPase  42.76 
 
 
326 aa  159  7e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00605272 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3542  arginine/ornithine transport system ATPase  38.7 
 
 
330 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.749977 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2163  arginine/ornithine transport system ATPase  38.82 
 
 
345 aa  159  8e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.191923  normal  0.423822 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3189  arginine/ornithine transport system ATPase  38.15 
 
 
322 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  normal  0.363793 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>