212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4110 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4110  LAO/AO transport system ATPase  100 
 
 
316 aa  607  9.999999999999999e-173  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.162136  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1798  LAO/AO transport system ATPase  72.52 
 
 
323 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1260  LAO/AO transport system ATPase  68.17 
 
 
319 aa  404  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1698  LAO/AO transport system ATPase  68.04 
 
 
322 aa  389  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238616  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1045  LAO/AO transport system ATPase  65.9 
 
 
356 aa  374  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.172221  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3609  LAO/AO transport system ATPase  67.2 
 
 
345 aa  368  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3990  LAO/AO transport system ATPase  66.88 
 
 
329 aa  368  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0358  LAO/AO transport system ATPase  61.9 
 
 
318 aa  358  6e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2170  LAO/AO transport system ATPase  64.1 
 
 
341 aa  355  5e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300615  normal  0.661007 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5998  LAO/AO transport system ATPase  62.54 
 
 
307 aa  346  3e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0515982 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2365  LAO/AO transport system ATPase  48.85 
 
 
318 aa  283  3.0000000000000004e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0943  LAO/AO transport system ATPase  49.52 
 
 
314 aa  276  4e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0456  LAO/AO transport system ATPase  49.01 
 
 
325 aa  276  5e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.614853 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1579  LAO/AO transport system ATPase  48.2 
 
 
319 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0389  LAO/AO transport system ATPase  46.95 
 
 
317 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000146012  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3795  LAO/AO transport system ATPase  53.85 
 
 
290 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3868  LAO/AO transport system ATPase  53.85 
 
 
290 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119113  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3799  LAO/AO transport system ATPase  53.85 
 
 
290 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.205117  normal  0.899663 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1674  LAO/AO transport system ATPase  48.04 
 
 
312 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0673  LAO/AO transport system ATPase  53.97 
 
 
340 aa  268  5.9999999999999995e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3103  LAO/AO transport system ATPase  54.37 
 
 
335 aa  267  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0011081  hitchhiker  0.0000652797 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1576  ArgK protein  45.51 
 
 
320 aa  266  4e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000113447  normal  0.451299 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2027  LAO/AO transport system ATPase  45.45 
 
 
316 aa  266  4e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00170815  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2025  LAO/AO transport system ATPase  49.68 
 
 
312 aa  266  4e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82524  decreased coverage  0.000989669 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1549  LAO/AO transport system ATPase  52.67 
 
 
314 aa  264  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000360873 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2690  LAO/AO transport system ATPase  52.29 
 
 
314 aa  263  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249774  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2473  LAO/AO transport system ATPase  43.03 
 
 
375 aa  261  1e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2806  LAO/AO transport system ATPase  46.73 
 
 
326 aa  261  2e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0864794  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4647  LAO/AO transport system ATPase  49.68 
 
 
325 aa  260  3e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0480374  normal  0.487392 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0586  LAO/AO transport system ATPase  50.16 
 
 
310 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.585715  normal  0.982729 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3772  LAO/AO transport system ATPase  46.42 
 
 
318 aa  259  6e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.339101 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1853  LAO/AO transport system ATPase  43.65 
 
 
309 aa  257  2e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4250  LAO/AO transport system ATPase  53.04 
 
 
322 aa  257  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0899  LAO/AO transport system ATPase  44.68 
 
 
357 aa  256  4e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2160  LAO/AO transport system ATPase  48.02 
 
 
341 aa  256  5e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.104519 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2999  LAO/AO transport system ATPase  51.28 
 
 
316 aa  255  7e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1649  LAO/AO transport system ATPase  51.62 
 
 
344 aa  253  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.840992  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3108  LAO/AO transport system ATPase  47.73 
 
 
304 aa  253  4.0000000000000004e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0453606 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2297  LAO/AO transport system ATPase  50.54 
 
 
344 aa  252  6e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.413391  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3988  LAO/AO transport system ATPase  55.38 
 
 
324 aa  252  7e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2209  LAO/AO transport system ATPase  51.87 
 
 
344 aa  251  8.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.249756  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1268  LAO/AO transport system ATPase  42.95 
 
 
312 aa  251  1e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4359  LAO/AO transport system ATPase  43.4 
 
 
364 aa  247  2e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.460456  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4301  LAO/AO transport system ATPase  55.23 
 
 
292 aa  246  4e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.635078  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1281  LAO/AO transport system ATPase  52.44 
 
 
317 aa  246  4e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.417761  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2690  LAO/AO transport system ATPase  49.05 
 
 
321 aa  245  6e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2397  LAO/AO transport system ATPase  51.86 
 
 
303 aa  245  6.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.73846  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0511  LAO/AO transport system ATPase  43.43 
 
 
378 aa  241  1e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2533  LAO/AO transport system ATPase  49.61 
 
 
316 aa  238  9e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.227946  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1613  LAO/AO transport system ATPase  51.93 
 
 
312 aa  238  1e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.375817 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3009  LAO/AO transport system ATPase  45.37 
 
 
308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.072512 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2130  LAO/AO transport system ATPase  46.77 
 
 
327 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1770  LAO/AO transport system ATPase  41.8 
 
 
322 aa  229  4e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292624  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5020  LAO/AO transport system ATPase  45.78 
 
 
332 aa  229  4e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778595  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3656  LAO/AO transport system ATPase  43.31 
 
 
323 aa  229  7e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.959092  normal  0.164513 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0540  putative transport system kinase  45 
 
 
327 aa  226  4e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.167721  hitchhiker  0.00219183 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1911  LAO/AO transport system ATPase  41.06 
 
 
318 aa  223  3e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0463697  normal  0.161513 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0512  LAO/AO transport system ATPase  38.96 
 
 
300 aa  222  6e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2210  ArgK protein  42.26 
 
 
330 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000516978  normal  0.0100138 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0801  LAO/AO transport system ATPase  56.28 
 
 
299 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5087  LAO/AO transport system ATPase  51.23 
 
 
333 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1321  LAO/AO transport system ATPase  42.07 
 
 
312 aa  212  4.9999999999999996e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0581  LAO/AO transport system ATPase  39.53 
 
 
292 aa  212  7.999999999999999e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.730832  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1780  LAO/AO transport system ATPase  55.65 
 
 
321 aa  209  4e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5042  LAO/AO transport system ATPase  52.72 
 
 
329 aa  209  7e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13609  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2056  LAO/AO transport system ATPase  38.23 
 
 
314 aa  203  3e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0080  LAO/AO transport system ATPase  36.49 
 
 
315 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2421  LAO/AO transport system ATPase  44.98 
 
 
343 aa  189  5e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0153  LAO/AO transport system ATPase  45.9 
 
 
296 aa  188  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.677625  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1086  arginine/ornithine transport system ATPase  42.26 
 
 
345 aa  185  8e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0955  LAO/AO transport system ATPase  34.77 
 
 
305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0032483 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4372  LAO/AO transport system ATPase  41.18 
 
 
329 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2764  arginine/ornithine transport system ATPase  46.07 
 
 
331 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0468013  normal  0.748538 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2033  arginine/ornithine transport system ATPase  43.02 
 
 
329 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1360  LAO/AO transport system ATPase  39.43 
 
 
316 aa  182  5.0000000000000004e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000108838  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3019  arginine/ornithine transport system ATPase  45.17 
 
 
330 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.527055 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0551  ArgK protein  37.9 
 
 
310 aa  182  6e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2240  arginine/ornithine transport system ATPase  44.24 
 
 
326 aa  182  9.000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0574886  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3132  arginine/ornithine transport system ATPase  44.19 
 
 
325 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151852  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2504  LAO/AO transport system ATPase  41.41 
 
 
329 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000648266  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3121  arginine/ornithine transport system ATPase  44.19 
 
 
325 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3182  arginine/ornithine transport system ATPase  44.19 
 
 
325 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.968151  normal  0.139966 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3480  arginine/ornithine transport system ATPase  41.81 
 
 
328 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.46606  normal  0.0872871 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1705  arginine/ornithine transport system ATPase  40.71 
 
 
346 aa  180  2.9999999999999997e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.476262  normal  0.0539762 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3648  arginine/ornithine transport system ATPase  45.9 
 
 
332 aa  179  7e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3542  arginine/ornithine transport system ATPase  41.33 
 
 
330 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.749977 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2640  arginine/ornithine transport system ATPase  41.16 
 
 
326 aa  178  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6417  LAO/AO transport system ATPase  45.91 
 
 
328 aa  178  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3543  LAO/AO transport system ATPase  46.15 
 
 
328 aa  177  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.569209  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3485  arginine/ornithine transport system ATPase  38.41 
 
 
347 aa  177  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2490  arginine/ornithine transport system ATPase  47.01 
 
 
328 aa  177  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1922  arginine/ornithine transport system ATPase  42.86 
 
 
330 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.597439 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05690  arginine/ornithine transport system ATPase  43.12 
 
 
333 aa  176  4e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4005  arginine/ornithine transport system ATPase  38.16 
 
 
329 aa  175  7e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1754  arginine/ornithine transport system ATPase  42.16 
 
 
331 aa  175  8e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.151104 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0374  arginine/ornithine transport system ATPase  41.1 
 
 
329 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5546  LAO/AO transport system ATPase  39.45 
 
 
372 aa  175  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22160  LAO/AO transport system ATPase  43.98 
 
 
330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.436585 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1350  arginine/ornithine transport system ATPase  41.11 
 
 
372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0354539  unclonable  0.0000000282575 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11526  arginine/ornithine transport system ATPase  40.19 
 
 
334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.139624 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>