224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3019 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3019  arginine/ornithine transport system ATPase  100 
 
 		 330 aa  665    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.527055 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1922  arginine/ornithine transport system ATPase  80.24 
 
 		 330 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.597439 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3542  arginine/ornithine transport system ATPase  82.91 
 
 		 330 aa  535  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.749977 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2033  arginine/ornithine transport system ATPase  80.38 
 
 		 329 aa  521  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1754  arginine/ornithine transport system ATPase  77.04 
 
 		 331 aa  518  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.151104 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2240  arginine/ornithine transport system ATPase  77.22 
 
 		 326 aa  492  9.999999999999999e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0574886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2640  arginine/ornithine transport system ATPase  79.43 
 
 		 326 aa  492  9.999999999999999e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0298  arginine/ornithine transport system ATPase  67.39 
 
 		 346 aa  426  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.206617 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0342  arginine/ornithine transport system ATPase  66.56 
 
 		 329 aa  424  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2490  arginine/ornithine transport system ATPase  69.13 
 
 		 328 aa  422  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0374  arginine/ornithine transport system ATPase  67.85 
 
 		 329 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3480  arginine/ornithine transport system ATPase  67.19 
 
 		 328 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.46606  normal  0.0872871 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1086  arginine/ornithine transport system ATPase  70.67 
 
 		 345 aa  403  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2114  arginine/ornithine transport system ATPase  70.33 
 
 		 326 aa  386  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00605272 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2478  arginine/ornithine transport system ATPase  59.13 
 
 		 333 aa  378  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.341293  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2764  arginine/ornithine transport system ATPase  58.33 
 
 		 331 aa  368  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0468013  normal  0.748538 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3648  arginine/ornithine transport system ATPase  57.86 
 
 		 332 aa  367  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1705  arginine/ornithine transport system ATPase  56.04 
 
 		 346 aa  364  1e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.476262  normal  0.0539762 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3121  arginine/ornithine transport system ATPase  56.43 
 
 		 325 aa  362  4e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3182  arginine/ornithine transport system ATPase  56.43 
 
 		 325 aa  362  4e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.968151  normal  0.139966 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3132  arginine/ornithine transport system ATPase  56.43 
 
 		 325 aa  362  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2421  LAO/AO transport system ATPase  57.79 
 
 		 343 aa  361  8e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6417  LAO/AO transport system ATPase  59.18 
 
 		 328 aa  360  2e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11526  arginine/ornithine transport system ATPase  58.1 
 
 		 334 aa  359  3e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.139624 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2763  arginine/ornithine transport system ATPase  57.28 
 
 		 332 aa  355  7.999999999999999e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2106  LAO/AO transport system ATPase  57.96 
 
 		 330 aa  353  2.9999999999999997e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3189  arginine/ornithine transport system ATPase  60.39 
 
 		 322 aa  352  4e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  normal  0.363793 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4005  arginine/ornithine transport system ATPase  54.72 
 
 		 329 aa  352  5.9999999999999994e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3485  arginine/ornithine transport system ATPase  58.47 
 
 		 347 aa  351  8e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05690  arginine/ornithine transport system ATPase  58.03 
 
 		 333 aa  351  1e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1945  arginine/ornithine transport system ATPase  59.35 
 
 		 332 aa  348  6e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.522383 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1350  arginine/ornithine transport system ATPase  56.13 
 
 		 372 aa  347  2e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0354539  unclonable  0.0000000282575 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2504  LAO/AO transport system ATPase  56.74 
 
 		 329 aa  346  3e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000648266  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3004  arginine/ornithine transport system ATPase  57.19 
 
 		 364 aa  346  4e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.487769  normal  0.192606 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1173  LAO/AO transport system ATPase  54.34 
 
 		 329 aa  345  5e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3873  arginine/ornithine transport system ATPase  54.88 
 
 		 380 aa  344  2e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0439716  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0078  LAO/AO transport system ATPase  56.77 
 
 		 331 aa  341  1e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22160  LAO/AO transport system ATPase  54.75 
 
 		 330 aa  338  5e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.436585 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4372  LAO/AO transport system ATPase  55.97 
 
 		 329 aa  338  9e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0546  arginine/ornithine transport system ATPase  56.17 
 
 		 378 aa  337  9.999999999999999e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5021  LAO/AO transport system ATPase  50.94 
 
 		 363 aa  335  5.999999999999999e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0197522  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1283  arginine/ornithine transport system ATPase  53.27 
 
 		 381 aa  335  9e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09151  arginine/ornithine transport system ATPase  52.17 
 
 		 359 aa  329  4e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.471004  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5546  LAO/AO transport system ATPase  55.45 
 
 		 372 aa  328  7e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3302  LAO/AO transport system ATPase  54.13 
 
 		 374 aa  328  1.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.107074  normal  0.916816 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2804  arginine/ornithine transport system ATPase  52.87 
 
 		 352 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0929254  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0321  arginine/ornithine transport system ATPase  50.32 
 
 		 343 aa  325  8.000000000000001e-88  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.659399 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1850  arginine/ornithine transport system ATPase  54.66 
 
 		 342 aa  323  3e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1015  arginine/ornithine transport system ATPase  53.29 
 
 		 337 aa  322  7e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2382  arginine/ornithine transport system ATPase  51.75 
 
 		 334 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2041  arginine/ornithine transport system ATPase  54.22 
 
 		 321 aa  317  2e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.749207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0911  arginine/ornithine transport system ATPase  50.93 
 
 		 341 aa  316  3e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2163  arginine/ornithine transport system ATPase  52.37 
 
 		 345 aa  315  8e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.191923  normal  0.423822 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3543  LAO/AO transport system ATPase  53.53 
 
 		 328 aa  315  8e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.569209  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3259  LAO/AO transport system ATPase  50.95 
 
 		 322 aa  315  8e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00849768  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0280  arginine/ornithine transport system ATPase  52.27 
 
 		 382 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2512  arginine/ornithine transport system ATPase  54.31 
 
 		 340 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210765 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3054  arginine/ornithine transport system ATPase  50 
 
 		 331 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02749  arginine/ornithine transport system ATPase  49.68 
 
 		 331 aa  312  4.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0775  LAO/AO transport system ATPase  49.68 
 
 		 331 aa  312  4.999999999999999e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3076  arginine/ornithine transport system ATPase  49.68 
 
 		 331 aa  312  4.999999999999999e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02712  hypothetical protein  49.68 
 
 		 331 aa  312  4.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2695  arginine/ornithine transport system ATPase  52.62 
 
 		 351 aa  312  5.999999999999999e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.278272 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0792  arginine/ornithine transport system ATPase  49.36 
 
 		 331 aa  311  1e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3245  arginine/ornithine transport system ATPase  49.36 
 
 		 331 aa  311  1e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4214  arginine/ornithine transport system ATPase  49.36 
 
 		 331 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1322  arginine/ornithine transport system ATPase  55.08 
 
 		 351 aa  309  4e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.822906  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2293  arginine/ornithine transport system ATPase  49.84 
 
 		 366 aa  308  5.9999999999999995e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000757851  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3754  arginine/ornithine transport system ATPase  52.4 
 
 		 373 aa  308  1.0000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.402613  normal  0.550126 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1919  LAO/AO transport system ATPase  54.9 
 
 		 327 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.250647  normal  0.437335 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1237  arginine/ornithine transport system ATPase  48.73 
 
 		 336 aa  306  2.0000000000000002e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2020  LAO/AO transport system ATPase  46.77 
 
 		 339 aa  307  2.0000000000000002e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526211 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3340  arginine/ornithine transport system ATPase  48.72 
 
 		 331 aa  306  3e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3400  arginine/ornithine transport system ATPase  49.84 
 
 		 343 aa  305  6e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.559318  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2129  arginine/ornithine transport system ATPase  51.78 
 
 		 350 aa  305  1.0000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.50019  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2582  arginine/ornithine transport system ATPase  52.01 
 
 		 358 aa  302  4.0000000000000003e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.575877  hitchhiker  0.000151333 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0387  LAO/AO transport system ATPase  50.16 
 
 		 332 aa  302  6.000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0867  arginine/ornithine transport system ATPase  47.68 
 
 		 334 aa  301  8.000000000000001e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0931  arginine/ornithine transport system ATPase  52.53 
 
 		 341 aa  291  1e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1163  arginine/ornithine transport system ATPase  46.13 
 
 		 343 aa  290  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0511506  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1172  LAO/AO transport system ATPase  45.09 
 
 		 335 aa  289  4e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.978419  decreased coverage  0.00325794 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1166  arginine/ornithine transport system ATPase  45.2 
 
 		 337 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00541841  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3946  LAO/AO transport system ATPase  49.03 
 
 		 337 aa  288  1e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2431  arginine/ornithine transport system ATPase  52.02 
 
 		 337 aa  286  4e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.698067  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2015  arginine/ornithine transport system ATPase  52.6 
 
 		 323 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.805467  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0725  arginine/ornithine transport system ATPase  52.6 
 
 		 323 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254962  normal  0.371915 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3457  arginine/ornithine transport system ATPase  50.49 
 
 		 303 aa  282  5.000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1356  LAO/AO transport system ATPase  52.46 
 
 		 345 aa  281  8.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.229963  normal  0.961808 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0670  arginine/ornithine transport system ATPase  50.63 
 
 		 333 aa  279  5e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.160836  normal  0.268873 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1293  arginine/ornithine transport system ATPase  47.56 
 
 		 337 aa  277  2e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3113  arginine/ornithine transport system ATPase  50.77 
 
 		 323 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.455526  hitchhiker  0.00331919 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0874  LAO/AO transport system ATPase  42.32 
 
 		 341 aa  271  8.000000000000001e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0562176  normal  0.0447783 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12878  predicted protein  41.22 
 
 		 312 aa  244  9.999999999999999e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0496106  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0358  LAO/AO transport system ATPase  42.68 
 
 		 318 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4647  LAO/AO transport system ATPase  40.81 
 
 		 325 aa  200  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0480374  normal  0.487392 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1798  LAO/AO transport system ATPase  39.52 
 
 		 323 aa  189  4e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2533  LAO/AO transport system ATPase  39.93 
 
 		 316 aa  189  5e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.227946  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3609  LAO/AO transport system ATPase  40.57 
 
 		 345 aa  189  5.999999999999999e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2025  LAO/AO transport system ATPase  39.68 
 
 		 312 aa  189  5.999999999999999e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82524  decreased coverage  0.000989669 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1045  LAO/AO transport system ATPase  41.76 
 
 		 356 aa  189  5.999999999999999e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.172221  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>