223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2695 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2695  arginine/ornithine transport system ATPase  100 
 
 		 351 aa  702    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.278272 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1015  arginine/ornithine transport system ATPase  76.18 
 
 		 337 aa  504  1e-141  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2804  arginine/ornithine transport system ATPase  73.94 
 
 		 352 aa  489  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0929254  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1850  arginine/ornithine transport system ATPase  74.46 
 
 		 342 aa  476  1e-133  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3754  arginine/ornithine transport system ATPase  73.7 
 
 		 373 aa  470  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.402613  normal  0.550126 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2512  arginine/ornithine transport system ATPase  74.1 
 
 		 340 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210765 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2041  arginine/ornithine transport system ATPase  74.29 
 
 		 321 aa  464  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.749207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2163  arginine/ornithine transport system ATPase  69.16 
 
 		 345 aa  456  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.191923  normal  0.423822 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2129  arginine/ornithine transport system ATPase  72.81 
 
 		 350 aa  457  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.50019  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2382  arginine/ornithine transport system ATPase  72.22 
 
 		 334 aa  457  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0911  arginine/ornithine transport system ATPase  65.49 
 
 		 341 aa  442  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0931  arginine/ornithine transport system ATPase  67.26 
 
 		 341 aa  433  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3400  arginine/ornithine transport system ATPase  66.47 
 
 		 343 aa  430  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.559318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3485  arginine/ornithine transport system ATPase  62.31 
 
 		 347 aa  390  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4005  arginine/ornithine transport system ATPase  58.18 
 
 		 329 aa  377  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0387  LAO/AO transport system ATPase  55.52 
 
 		 332 aa  338  5.9999999999999996e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1322  arginine/ornithine transport system ATPase  55.52 
 
 		 351 aa  331  1e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.822906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1705  arginine/ornithine transport system ATPase  53.7 
 
 		 346 aa  327  2.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.476262  normal  0.0539762 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3019  arginine/ornithine transport system ATPase  52.62 
 
 		 330 aa  322  6e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.527055 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2478  arginine/ornithine transport system ATPase  52.17 
 
 		 333 aa  322  7e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.341293  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3259  LAO/AO transport system ATPase  53.61 
 
 		 322 aa  322  7e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00849768  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2490  arginine/ornithine transport system ATPase  56.35 
 
 		 328 aa  320  3e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5546  LAO/AO transport system ATPase  53.25 
 
 		 372 aa  316  3e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1922  arginine/ornithine transport system ATPase  51.08 
 
 		 330 aa  316  4e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.597439 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3873  arginine/ornithine transport system ATPase  53.29 
 
 		 380 aa  315  9e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0439716  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3121  arginine/ornithine transport system ATPase  52.01 
 
 		 325 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3182  arginine/ornithine transport system ATPase  52.01 
 
 		 325 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.968151  normal  0.139966 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3132  arginine/ornithine transport system ATPase  52.01 
 
 		 325 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2640  arginine/ornithine transport system ATPase  53.18 
 
 		 326 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1350  arginine/ornithine transport system ATPase  52.66 
 
 		 372 aa  312  5.999999999999999e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0354539  unclonable  0.0000000282575 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3542  arginine/ornithine transport system ATPase  50.46 
 
 		 330 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.749977 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2033  arginine/ornithine transport system ATPase  50.15 
 
 		 329 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1754  arginine/ornithine transport system ATPase  50.77 
 
 		 331 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.151104 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0546  arginine/ornithine transport system ATPase  51.55 
 
 		 378 aa  310  2.9999999999999997e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3648  arginine/ornithine transport system ATPase  49.29 
 
 		 332 aa  305  6e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2764  arginine/ornithine transport system ATPase  50.45 
 
 		 331 aa  305  7e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0468013  normal  0.748538 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4372  LAO/AO transport system ATPase  52.47 
 
 		 329 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0298  arginine/ornithine transport system ATPase  52.82 
 
 		 346 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.206617 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2293  arginine/ornithine transport system ATPase  48.62 
 
 		 366 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000757851  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0342  arginine/ornithine transport system ATPase  52.82 
 
 		 329 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0374  arginine/ornithine transport system ATPase  52.01 
 
 		 329 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0078  LAO/AO transport system ATPase  50.78 
 
 		 331 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6417  LAO/AO transport system ATPase  53.25 
 
 		 328 aa  303  4.0000000000000003e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2763  arginine/ornithine transport system ATPase  50 
 
 		 332 aa  300  2e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1086  arginine/ornithine transport system ATPase  52.12 
 
 		 345 aa  300  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2240  arginine/ornithine transport system ATPase  50 
 
 		 326 aa  300  3e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0574886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11526  arginine/ornithine transport system ATPase  48.97 
 
 		 334 aa  298  7e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.139624 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2421  LAO/AO transport system ATPase  49.85 
 
 		 343 aa  298  7e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2106  LAO/AO transport system ATPase  53.07 
 
 		 330 aa  296  4e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5021  LAO/AO transport system ATPase  45.51 
 
 		 363 aa  296  4e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0197522  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05690  arginine/ornithine transport system ATPase  51.72 
 
 		 333 aa  295  8e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0280  arginine/ornithine transport system ATPase  48.45 
 
 		 382 aa  295  9e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3302  LAO/AO transport system ATPase  50.46 
 
 		 374 aa  295  1e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.107074  normal  0.916816 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1173  LAO/AO transport system ATPase  48.77 
 
 		 329 aa  293  3e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0321  arginine/ornithine transport system ATPase  46.37 
 
 		 343 aa  291  2e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.659399 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3480  arginine/ornithine transport system ATPase  51.85 
 
 		 328 aa  290  2e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.46606  normal  0.0872871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3189  arginine/ornithine transport system ATPase  52.05 
 
 		 322 aa  290  3e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  normal  0.363793 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2114  arginine/ornithine transport system ATPase  54.76 
 
 		 326 aa  290  3e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00605272 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2504  LAO/AO transport system ATPase  50.63 
 
 		 329 aa  288  9e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000648266  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3004  arginine/ornithine transport system ATPase  50.77 
 
 		 364 aa  286  5e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.487769  normal  0.192606 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1945  arginine/ornithine transport system ATPase  50.93 
 
 		 332 aa  286  5e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.522383 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09151  arginine/ornithine transport system ATPase  47.17 
 
 		 359 aa  285  9e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.471004  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1283  arginine/ornithine transport system ATPase  49.22 
 
 		 381 aa  282  5.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2582  arginine/ornithine transport system ATPase  48.3 
 
 		 358 aa  278  8e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.575877  hitchhiker  0.000151333 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2020  LAO/AO transport system ATPase  46.48 
 
 		 339 aa  278  1e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526211 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3054  arginine/ornithine transport system ATPase  48.24 
 
 		 331 aa  276  3e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02749  arginine/ornithine transport system ATPase  48.24 
 
 		 331 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0775  LAO/AO transport system ATPase  48.24 
 
 		 331 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02712  hypothetical protein  48.24 
 
 		 331 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3076  arginine/ornithine transport system ATPase  48.24 
 
 		 331 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3245  arginine/ornithine transport system ATPase  48.24 
 
 		 331 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22160  LAO/AO transport system ATPase  50.67 
 
 		 330 aa  273  2.0000000000000002e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.436585 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0792  arginine/ornithine transport system ATPase  48.24 
 
 		 331 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4214  arginine/ornithine transport system ATPase  48.54 
 
 		 331 aa  273  3e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1919  LAO/AO transport system ATPase  51.53 
 
 		 327 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.250647  normal  0.437335 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3340  arginine/ornithine transport system ATPase  47.6 
 
 		 331 aa  271  1e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3946  LAO/AO transport system ATPase  47.08 
 
 		 337 aa  266  4e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1237  arginine/ornithine transport system ATPase  42.17 
 
 		 336 aa  263  3e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0670  arginine/ornithine transport system ATPase  51.38 
 
 		 333 aa  263  4e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.160836  normal  0.268873 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1163  arginine/ornithine transport system ATPase  43.12 
 
 		 343 aa  260  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0511506  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3457  arginine/ornithine transport system ATPase  48.4 
 
 		 303 aa  260  3e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3543  LAO/AO transport system ATPase  47.5 
 
 		 328 aa  259  4e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.569209  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1356  LAO/AO transport system ATPase  50 
 
 		 345 aa  257  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.229963  normal  0.961808 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2431  arginine/ornithine transport system ATPase  47.98 
 
 		 337 aa  254  2.0000000000000002e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.698067  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1172  LAO/AO transport system ATPase  42.3 
 
 		 335 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.978419  decreased coverage  0.00325794 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3113  arginine/ornithine transport system ATPase  47.02 
 
 		 323 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.455526  hitchhiker  0.00331919 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0874  LAO/AO transport system ATPase  42.12 
 
 		 341 aa  251  1e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0562176  normal  0.0447783 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1166  arginine/ornithine transport system ATPase  42.59 
 
 		 337 aa  251  1e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00541841  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0867  arginine/ornithine transport system ATPase  41.56 
 
 		 334 aa  244  9.999999999999999e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1293  arginine/ornithine transport system ATPase  43.9 
 
 		 337 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2015  arginine/ornithine transport system ATPase  47.02 
 
 		 323 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.805467  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0725  arginine/ornithine transport system ATPase  50.53 
 
 		 323 aa  238  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254962  normal  0.371915 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12878  predicted protein  37.25 
 
 		 312 aa  207  2e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0496106  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1268  LAO/AO transport system ATPase  35.22 
 
 		 312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1045  LAO/AO transport system ATPase  40.07 
 
 		 356 aa  181  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.172221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2025  LAO/AO transport system ATPase  37.41 
 
 		 312 aa  176  6e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82524  decreased coverage  0.000989669 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0943  LAO/AO transport system ATPase  36.79 
 
 		 314 aa  175  9e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3990  LAO/AO transport system ATPase  41.13 
 
 		 329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3609  LAO/AO transport system ATPase  40.75 
 
 		 345 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1260  LAO/AO transport system ATPase  38.95 
 
 		 319 aa  173  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>