213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3754 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3754  arginine/ornithine transport system ATPase  100 
 
 		 373 aa  753    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.402613  normal  0.550126 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1850  arginine/ornithine transport system ATPase  87.28 
 
 		 342 aa  604  9.999999999999999e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2041  arginine/ornithine transport system ATPase  88.33 
 
 		 321 aa  571  1.0000000000000001e-162  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.749207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2804  arginine/ornithine transport system ATPase  79.75 
 
 		 352 aa  535  1e-151  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0929254  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2512  arginine/ornithine transport system ATPase  78.79 
 
 		 340 aa  509  1e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210765 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2382  arginine/ornithine transport system ATPase  74.55 
 
 		 334 aa  486  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2163  arginine/ornithine transport system ATPase  73.21 
 
 		 345 aa  483  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.191923  normal  0.423822 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2129  arginine/ornithine transport system ATPase  79.05 
 
 		 350 aa  484  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.50019  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1015  arginine/ornithine transport system ATPase  73.19 
 
 		 337 aa  477  1e-133  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3400  arginine/ornithine transport system ATPase  70.8 
 
 		 343 aa  470  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.559318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2695  arginine/ornithine transport system ATPase  72.67 
 
 		 351 aa  456  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.278272 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0911  arginine/ornithine transport system ATPase  69.52 
 
 		 341 aa  447  1.0000000000000001e-124  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0931  arginine/ornithine transport system ATPase  70.59 
 
 		 341 aa  433  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3485  arginine/ornithine transport system ATPase  62.62 
 
 		 347 aa  388  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4005  arginine/ornithine transport system ATPase  62.46 
 
 		 329 aa  377  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5546  LAO/AO transport system ATPase  53.59 
 
 		 372 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1322  arginine/ornithine transport system ATPase  54.55 
 
 		 351 aa  326  3e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.822906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0387  LAO/AO transport system ATPase  52.41 
 
 		 332 aa  320  3e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1350  arginine/ornithine transport system ATPase  51.61 
 
 		 372 aa  318  1e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0354539  unclonable  0.0000000282575 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3259  LAO/AO transport system ATPase  52.92 
 
 		 322 aa  317  2e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00849768  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3873  arginine/ornithine transport system ATPase  51.95 
 
 		 380 aa  316  4e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0439716  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1705  arginine/ornithine transport system ATPase  54.09 
 
 		 346 aa  315  6e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.476262  normal  0.0539762 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2478  arginine/ornithine transport system ATPase  50.74 
 
 		 333 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.341293  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0546  arginine/ornithine transport system ATPase  51.05 
 
 		 378 aa  312  6.999999999999999e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4372  LAO/AO transport system ATPase  52.13 
 
 		 329 aa  310  2e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0078  LAO/AO transport system ATPase  51.06 
 
 		 331 aa  308  6.999999999999999e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3121  arginine/ornithine transport system ATPase  50.3 
 
 		 325 aa  309  6.999999999999999e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3182  arginine/ornithine transport system ATPase  50.3 
 
 		 325 aa  309  6.999999999999999e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.968151  normal  0.139966 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3132  arginine/ornithine transport system ATPase  50.3 
 
 		 325 aa  308  6.999999999999999e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3542  arginine/ornithine transport system ATPase  52.06 
 
 		 330 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.749977 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3019  arginine/ornithine transport system ATPase  52.73 
 
 		 330 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.527055 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1922  arginine/ornithine transport system ATPase  51.75 
 
 		 330 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.597439 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2490  arginine/ornithine transport system ATPase  53.02 
 
 		 328 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2293  arginine/ornithine transport system ATPase  47.89 
 
 		 366 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000757851  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2640  arginine/ornithine transport system ATPase  53.09 
 
 		 326 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3004  arginine/ornithine transport system ATPase  49.72 
 
 		 364 aa  301  1e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.487769  normal  0.192606 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6417  LAO/AO transport system ATPase  51.65 
 
 		 328 aa  301  1e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1754  arginine/ornithine transport system ATPase  54.28 
 
 		 331 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.151104 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2764  arginine/ornithine transport system ATPase  50.47 
 
 		 331 aa  298  8e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0468013  normal  0.748538 
 
 
-
 
NC_002950  PG0321  arginine/ornithine transport system ATPase  46.55 
 
 		 343 aa  298  9e-80  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.659399 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1086  arginine/ornithine transport system ATPase  53.05 
 
 		 345 aa  298  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1945  arginine/ornithine transport system ATPase  51.99 
 
 		 332 aa  298  1e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.522383 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05690  arginine/ornithine transport system ATPase  50.3 
 
 		 333 aa  298  1e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2033  arginine/ornithine transport system ATPase  51.94 
 
 		 329 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2763  arginine/ornithine transport system ATPase  50.3 
 
 		 332 aa  297  2e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0374  arginine/ornithine transport system ATPase  50.94 
 
 		 329 aa  296  5e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2421  LAO/AO transport system ATPase  49.84 
 
 		 343 aa  296  5e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0298  arginine/ornithine transport system ATPase  50.94 
 
 		 346 aa  295  8e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.206617 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2240  arginine/ornithine transport system ATPase  50.48 
 
 		 326 aa  294  1e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0574886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2114  arginine/ornithine transport system ATPase  55.27 
 
 		 326 aa  294  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00605272 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0342  arginine/ornithine transport system ATPase  50.94 
 
 		 329 aa  294  2e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5021  LAO/AO transport system ATPase  45.73 
 
 		 363 aa  293  2e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0197522  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3648  arginine/ornithine transport system ATPase  49.84 
 
 		 332 aa  293  3e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11526  arginine/ornithine transport system ATPase  48.5 
 
 		 334 aa  293  3e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.139624 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22160  LAO/AO transport system ATPase  48.96 
 
 		 330 aa  292  8e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.436585 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1173  LAO/AO transport system ATPase  46.71 
 
 		 329 aa  290  3e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09151  arginine/ornithine transport system ATPase  46.09 
 
 		 359 aa  290  3e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.471004  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3302  LAO/AO transport system ATPase  49.09 
 
 		 374 aa  289  6e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.107074  normal  0.916816 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2504  LAO/AO transport system ATPase  50.76 
 
 		 329 aa  289  7e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000648266  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2020  LAO/AO transport system ATPase  46.11 
 
 		 339 aa  287  2e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526211 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3480  arginine/ornithine transport system ATPase  49.53 
 
 		 328 aa  286  5e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.46606  normal  0.0872871 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1283  arginine/ornithine transport system ATPase  48.17 
 
 		 381 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0280  arginine/ornithine transport system ATPase  46.2 
 
 		 382 aa  281  1e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2106  LAO/AO transport system ATPase  49.1 
 
 		 330 aa  281  2e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2582  arginine/ornithine transport system ATPase  47.49 
 
 		 358 aa  280  3e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.575877  hitchhiker  0.000151333 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3189  arginine/ornithine transport system ATPase  49.85 
 
 		 322 aa  279  5e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  normal  0.363793 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02749  arginine/ornithine transport system ATPase  52.22 
 
 		 331 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0775  LAO/AO transport system ATPase  52.22 
 
 		 331 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02712  hypothetical protein  52.22 
 
 		 331 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3076  arginine/ornithine transport system ATPase  52.22 
 
 		 331 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0792  arginine/ornithine transport system ATPase  52.22 
 
 		 331 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3245  arginine/ornithine transport system ATPase  52.22 
 
 		 331 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4214  arginine/ornithine transport system ATPase  52.63 
 
 		 331 aa  272  7e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3543  LAO/AO transport system ATPase  48.78 
 
 		 328 aa  272  8.000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.569209  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3340  arginine/ornithine transport system ATPase  51.85 
 
 		 331 aa  271  1e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3054  arginine/ornithine transport system ATPase  51.85 
 
 		 331 aa  270  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3946  LAO/AO transport system ATPase  45.32 
 
 		 337 aa  268  1e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0670  arginine/ornithine transport system ATPase  48.48 
 
 		 333 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.160836  normal  0.268873 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1356  LAO/AO transport system ATPase  48.12 
 
 		 345 aa  266  4e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.229963  normal  0.961808 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1172  LAO/AO transport system ATPase  44.48 
 
 		 335 aa  265  7e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.978419  decreased coverage  0.00325794 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1919  LAO/AO transport system ATPase  49.7 
 
 		 327 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.250647  normal  0.437335 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1237  arginine/ornithine transport system ATPase  42.55 
 
 		 336 aa  261  2e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3457  arginine/ornithine transport system ATPase  47.88 
 
 		 303 aa  258  9e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1163  arginine/ornithine transport system ATPase  43.64 
 
 		 343 aa  258  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0511506  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0874  LAO/AO transport system ATPase  43.5 
 
 		 341 aa  257  3e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0562176  normal  0.0447783 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2431  arginine/ornithine transport system ATPase  46.97 
 
 		 337 aa  251  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.698067  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3113  arginine/ornithine transport system ATPase  47.13 
 
 		 323 aa  249  5e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.455526  hitchhiker  0.00331919 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2015  arginine/ornithine transport system ATPase  49.04 
 
 		 323 aa  248  9e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.805467  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1166  arginine/ornithine transport system ATPase  42.46 
 
 		 337 aa  248  1e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00541841  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0725  arginine/ornithine transport system ATPase  49.04 
 
 		 323 aa  248  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254962  normal  0.371915 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0867  arginine/ornithine transport system ATPase  42.12 
 
 		 334 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1293  arginine/ornithine transport system ATPase  42.3 
 
 		 337 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12878  predicted protein  37.38 
 
 		 312 aa  207  2e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0496106  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1268  LAO/AO transport system ATPase  35.91 
 
 		 312 aa  181  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0456  LAO/AO transport system ATPase  34.8 
 
 		 325 aa  177  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.614853 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1798  LAO/AO transport system ATPase  38.34 
 
 		 323 aa  176  8e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2025  LAO/AO transport system ATPase  38.46 
 
 		 312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82524  decreased coverage  0.000989669 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1045  LAO/AO transport system ATPase  38.43 
 
 		 356 aa  173  5.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.172221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1260  LAO/AO transport system ATPase  38.38 
 
 		 319 aa  170  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0358  LAO/AO transport system ATPase  38.52 
 
 		 318 aa  169  7e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>