208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1798 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1798  LAO/AO transport system ATPase  100 
 
 
323 aa  623  1e-177  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1260  LAO/AO transport system ATPase  72.29 
 
 
319 aa  430  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1698  LAO/AO transport system ATPase  70.51 
 
 
322 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238616  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4110  LAO/AO transport system ATPase  72.52 
 
 
316 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.162136  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3990  LAO/AO transport system ATPase  66.46 
 
 
329 aa  376  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3609  LAO/AO transport system ATPase  64.89 
 
 
345 aa  374  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5998  LAO/AO transport system ATPase  63.96 
 
 
307 aa  362  4e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0515982 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0358  LAO/AO transport system ATPase  63.55 
 
 
318 aa  362  6e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1045  LAO/AO transport system ATPase  63.16 
 
 
356 aa  360  3e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.172221  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2170  LAO/AO transport system ATPase  62.7 
 
 
341 aa  342  2.9999999999999997e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300615  normal  0.661007 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2365  LAO/AO transport system ATPase  50.16 
 
 
318 aa  296  4e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0943  LAO/AO transport system ATPase  53.07 
 
 
314 aa  293  2e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2025  LAO/AO transport system ATPase  51.68 
 
 
312 aa  282  5.000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82524  decreased coverage  0.000989669 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0389  LAO/AO transport system ATPase  48.34 
 
 
317 aa  279  4e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000146012  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1674  LAO/AO transport system ATPase  48.68 
 
 
312 aa  278  7e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1853  LAO/AO transport system ATPase  46.71 
 
 
309 aa  275  6e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2027  LAO/AO transport system ATPase  45.75 
 
 
316 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00170815  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2999  LAO/AO transport system ATPase  52.13 
 
 
316 aa  272  7e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1549  LAO/AO transport system ATPase  47.06 
 
 
314 aa  270  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000360873 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1579  LAO/AO transport system ATPase  48.1 
 
 
319 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1576  ArgK protein  46.41 
 
 
320 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000113447  normal  0.451299 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2690  LAO/AO transport system ATPase  46.73 
 
 
314 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249774  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2160  LAO/AO transport system ATPase  48.97 
 
 
341 aa  268  8e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.104519 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0456  LAO/AO transport system ATPase  47.08 
 
 
325 aa  268  1e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.614853 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2297  LAO/AO transport system ATPase  46.38 
 
 
344 aa  267  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.413391  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1281  LAO/AO transport system ATPase  48.08 
 
 
317 aa  267  2e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.417761  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2806  LAO/AO transport system ATPase  46.33 
 
 
326 aa  266  2.9999999999999995e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0864794  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2209  LAO/AO transport system ATPase  46.36 
 
 
344 aa  265  8e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.249756  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4647  LAO/AO transport system ATPase  48.37 
 
 
325 aa  264  2e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0480374  normal  0.487392 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1649  LAO/AO transport system ATPase  46.38 
 
 
344 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.840992  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3108  LAO/AO transport system ATPase  48.52 
 
 
304 aa  262  4.999999999999999e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0453606 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0899  LAO/AO transport system ATPase  45.09 
 
 
357 aa  262  6e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2533  LAO/AO transport system ATPase  47.73 
 
 
316 aa  261  1e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.227946  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0673  LAO/AO transport system ATPase  51.46 
 
 
340 aa  259  3e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3795  LAO/AO transport system ATPase  52.79 
 
 
290 aa  259  4e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3868  LAO/AO transport system ATPase  52.79 
 
 
290 aa  259  4e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119113  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3799  LAO/AO transport system ATPase  52.79 
 
 
290 aa  259  4e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.205117  normal  0.899663 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1268  LAO/AO transport system ATPase  49.6 
 
 
312 aa  259  5.0000000000000005e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3009  LAO/AO transport system ATPase  48.55 
 
 
308 aa  258  8e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.072512 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2397  LAO/AO transport system ATPase  52.7 
 
 
303 aa  258  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.73846  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2473  LAO/AO transport system ATPase  43.35 
 
 
375 aa  256  3e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4359  LAO/AO transport system ATPase  44.06 
 
 
364 aa  253  2.0000000000000002e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.460456  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3103  LAO/AO transport system ATPase  51.07 
 
 
335 aa  253  3e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0011081  hitchhiker  0.0000652797 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1321  LAO/AO transport system ATPase  42.43 
 
 
312 aa  252  7e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2690  LAO/AO transport system ATPase  46.62 
 
 
321 aa  250  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4250  LAO/AO transport system ATPase  51.8 
 
 
322 aa  250  3e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1911  LAO/AO transport system ATPase  43.51 
 
 
318 aa  249  5e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0463697  normal  0.161513 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3988  LAO/AO transport system ATPase  54.84 
 
 
324 aa  249  6e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0511  LAO/AO transport system ATPase  43.82 
 
 
378 aa  246  3e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1770  LAO/AO transport system ATPase  43.41 
 
 
322 aa  246  4e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292624  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0586  LAO/AO transport system ATPase  49.68 
 
 
310 aa  245  6.999999999999999e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.585715  normal  0.982729 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0540  putative transport system kinase  46.43 
 
 
327 aa  241  1e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.167721  hitchhiker  0.00219183 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3772  LAO/AO transport system ATPase  45.86 
 
 
318 aa  238  1e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.339101 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0581  LAO/AO transport system ATPase  40.94 
 
 
292 aa  238  1e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.730832  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0512  LAO/AO transport system ATPase  50 
 
 
300 aa  236  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3656  LAO/AO transport system ATPase  44.44 
 
 
323 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.959092  normal  0.164513 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4301  LAO/AO transport system ATPase  53.06 
 
 
292 aa  231  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.635078  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1613  LAO/AO transport system ATPase  47.18 
 
 
312 aa  231  2e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.375817 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2130  LAO/AO transport system ATPase  44.51 
 
 
327 aa  230  2e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5020  LAO/AO transport system ATPase  45.51 
 
 
332 aa  229  4e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778595  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0801  LAO/AO transport system ATPase  55.4 
 
 
299 aa  222  7e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5087  LAO/AO transport system ATPase  45.51 
 
 
333 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5042  LAO/AO transport system ATPase  53.78 
 
 
329 aa  216  4e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13609  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2210  ArgK protein  42.39 
 
 
330 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000516978  normal  0.0100138 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0298  arginine/ornithine transport system ATPase  42.68 
 
 
346 aa  209  5e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.206617 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0342  arginine/ornithine transport system ATPase  42.68 
 
 
329 aa  207  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4372  LAO/AO transport system ATPase  42.95 
 
 
329 aa  207  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0374  arginine/ornithine transport system ATPase  42.62 
 
 
329 aa  206  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2056  LAO/AO transport system ATPase  39.58 
 
 
314 aa  206  4e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1780  LAO/AO transport system ATPase  56.71 
 
 
321 aa  206  5e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0080  LAO/AO transport system ATPase  38.46 
 
 
315 aa  205  1e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05690  arginine/ornithine transport system ATPase  44.36 
 
 
333 aa  204  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4005  arginine/ornithine transport system ATPase  39.34 
 
 
329 aa  200  3e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1705  arginine/ornithine transport system ATPase  41.95 
 
 
346 aa  199  5e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.476262  normal  0.0539762 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3543  LAO/AO transport system ATPase  45.48 
 
 
328 aa  199  6e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.569209  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11526  arginine/ornithine transport system ATPase  40.43 
 
 
334 aa  199  6e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.139624 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5546  LAO/AO transport system ATPase  46.07 
 
 
372 aa  199  6e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0153  LAO/AO transport system ATPase  46.84 
 
 
296 aa  198  7.999999999999999e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.677625  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1360  LAO/AO transport system ATPase  34.81 
 
 
316 aa  198  9e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000108838  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3019  arginine/ornithine transport system ATPase  39.82 
 
 
330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.527055 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3485  arginine/ornithine transport system ATPase  39.94 
 
 
347 aa  194  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2764  arginine/ornithine transport system ATPase  45.53 
 
 
331 aa  194  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0468013  normal  0.748538 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0551  ArgK protein  39.85 
 
 
310 aa  193  3e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3132  arginine/ornithine transport system ATPase  43.97 
 
 
325 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151852  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3121  arginine/ornithine transport system ATPase  43.97 
 
 
325 aa  193  4e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3182  arginine/ornithine transport system ATPase  43.97 
 
 
325 aa  193  4e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.968151  normal  0.139966 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2763  arginine/ornithine transport system ATPase  39.34 
 
 
332 aa  192  8e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3480  arginine/ornithine transport system ATPase  40.78 
 
 
328 aa  192  9e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.46606  normal  0.0872871 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0387  LAO/AO transport system ATPase  40.71 
 
 
332 aa  191  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2478  arginine/ornithine transport system ATPase  41.73 
 
 
333 aa  191  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.341293  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1945  arginine/ornithine transport system ATPase  40 
 
 
332 aa  191  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.522383 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3542  arginine/ornithine transport system ATPase  38.24 
 
 
330 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.749977 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1850  arginine/ornithine transport system ATPase  40.18 
 
 
342 aa  189  4e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22160  LAO/AO transport system ATPase  42.58 
 
 
330 aa  188  1e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.436585 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1754  arginine/ornithine transport system ATPase  37.72 
 
 
331 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.151104 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1086  arginine/ornithine transport system ATPase  43.24 
 
 
345 aa  188  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2490  arginine/ornithine transport system ATPase  42.22 
 
 
328 aa  188  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2240  arginine/ornithine transport system ATPase  38.61 
 
 
326 aa  187  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0574886  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3004  arginine/ornithine transport system ATPase  40.85 
 
 
364 aa  187  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.487769  normal  0.192606 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2421  LAO/AO transport system ATPase  41.57 
 
 
343 aa  187  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>