209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0874 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0874  LAO/AO transport system ATPase  100 
 
 
341 aa  694    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0562176  normal  0.0447783 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1172  LAO/AO transport system ATPase  64.29 
 
 
335 aa  437  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.978419  decreased coverage  0.00325794 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1163  arginine/ornithine transport system ATPase  58.46 
 
 
343 aa  391  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0511506  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1166  arginine/ornithine transport system ATPase  56.85 
 
 
337 aa  382  1e-105  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00541841  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1237  arginine/ornithine transport system ATPase  52.35 
 
 
336 aa  350  3e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0867  arginine/ornithine transport system ATPase  55.03 
 
 
334 aa  347  1e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1293  arginine/ornithine transport system ATPase  49.54 
 
 
337 aa  314  9.999999999999999e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5021  LAO/AO transport system ATPase  48.44 
 
 
363 aa  310  2e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0197522  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1350  arginine/ornithine transport system ATPase  46.75 
 
 
372 aa  295  1e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0354539  unclonable  0.0000000282575 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3873  arginine/ornithine transport system ATPase  46.88 
 
 
380 aa  294  1e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0439716  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0546  arginine/ornithine transport system ATPase  46.56 
 
 
378 aa  291  1e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.563  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09151  arginine/ornithine transport system ATPase  45.71 
 
 
359 aa  285  5.999999999999999e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.471004  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3542  arginine/ornithine transport system ATPase  44.13 
 
 
330 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.749977 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1173  LAO/AO transport system ATPase  47.94 
 
 
329 aa  283  3.0000000000000004e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0321  arginine/ornithine transport system ATPase  45.17 
 
 
343 aa  282  4.0000000000000003e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.659399 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4005  arginine/ornithine transport system ATPase  46.41 
 
 
329 aa  276  2e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2478  arginine/ornithine transport system ATPase  42.59 
 
 
333 aa  277  2e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.341293  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2033  arginine/ornithine transport system ATPase  44.94 
 
 
329 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1922  arginine/ornithine transport system ATPase  43.95 
 
 
330 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.597439 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0298  arginine/ornithine transport system ATPase  43.88 
 
 
346 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.206617 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0342  arginine/ornithine transport system ATPase  44.72 
 
 
329 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3019  arginine/ornithine transport system ATPase  42.32 
 
 
330 aa  271  9e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.527055 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2240  arginine/ornithine transport system ATPase  42.67 
 
 
326 aa  271  1e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0574886  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2764  arginine/ornithine transport system ATPase  42.72 
 
 
331 aa  271  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0468013  normal  0.748538 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3302  LAO/AO transport system ATPase  42.59 
 
 
374 aa  268  8.999999999999999e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.107074  normal  0.916816 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1705  arginine/ornithine transport system ATPase  43.12 
 
 
346 aa  268  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.476262  normal  0.0539762 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2804  arginine/ornithine transport system ATPase  42.18 
 
 
352 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0929254  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2293  arginine/ornithine transport system ATPase  42.32 
 
 
366 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000757851  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0078  LAO/AO transport system ATPase  42.54 
 
 
331 aa  265  5.999999999999999e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0374  arginine/ornithine transport system ATPase  44.55 
 
 
329 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1754  arginine/ornithine transport system ATPase  42.9 
 
 
331 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.151104 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1283  arginine/ornithine transport system ATPase  42.77 
 
 
381 aa  263  2e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0911  arginine/ornithine transport system ATPase  45.18 
 
 
341 aa  263  3e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4372  LAO/AO transport system ATPase  42.72 
 
 
329 aa  263  3e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05690  arginine/ornithine transport system ATPase  41.67 
 
 
333 aa  263  4e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3480  arginine/ornithine transport system ATPase  45.83 
 
 
328 aa  263  4e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.46606  normal  0.0872871 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0387  LAO/AO transport system ATPase  42.77 
 
 
332 aa  263  4e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1086  arginine/ornithine transport system ATPase  46.85 
 
 
345 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3485  arginine/ornithine transport system ATPase  45.97 
 
 
347 aa  261  8e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3400  arginine/ornithine transport system ATPase  43.17 
 
 
343 aa  261  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.559318  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3121  arginine/ornithine transport system ATPase  43.13 
 
 
325 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3182  arginine/ornithine transport system ATPase  43.13 
 
 
325 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.968151  normal  0.139966 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1850  arginine/ornithine transport system ATPase  43.34 
 
 
342 aa  259  3e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3132  arginine/ornithine transport system ATPase  43.13 
 
 
325 aa  260  3e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151852  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02749  arginine/ornithine transport system ATPase  40.19 
 
 
331 aa  258  1e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0775  LAO/AO transport system ATPase  40.19 
 
 
331 aa  258  1e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5546  LAO/AO transport system ATPase  41.57 
 
 
372 aa  258  1e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02712  hypothetical protein  40.19 
 
 
331 aa  258  1e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2490  arginine/ornithine transport system ATPase  43.75 
 
 
328 aa  258  1e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3076  arginine/ornithine transport system ATPase  40.19 
 
 
331 aa  258  1e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3245  arginine/ornithine transport system ATPase  40.19 
 
 
331 aa  257  2e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0792  arginine/ornithine transport system ATPase  40.19 
 
 
331 aa  257  2e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2640  arginine/ornithine transport system ATPase  42.76 
 
 
326 aa  256  3e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1015  arginine/ornithine transport system ATPase  43.49 
 
 
337 aa  256  3e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2020  LAO/AO transport system ATPase  42.51 
 
 
339 aa  256  4e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526211 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3754  arginine/ornithine transport system ATPase  44.14 
 
 
373 aa  256  4e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.402613  normal  0.550126 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4214  arginine/ornithine transport system ATPase  39.88 
 
 
331 aa  255  6e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3054  arginine/ornithine transport system ATPase  40.19 
 
 
331 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1322  arginine/ornithine transport system ATPase  43.69 
 
 
351 aa  255  1.0000000000000001e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.822906  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2421  LAO/AO transport system ATPase  41.49 
 
 
343 aa  254  1.0000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2129  arginine/ornithine transport system ATPase  43.13 
 
 
350 aa  254  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.50019  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11526  arginine/ornithine transport system ATPase  42.11 
 
 
334 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.139624 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2582  arginine/ornithine transport system ATPase  40.59 
 
 
358 aa  253  3e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.575877  hitchhiker  0.000151333 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2041  arginine/ornithine transport system ATPase  42.95 
 
 
321 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.749207  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3340  arginine/ornithine transport system ATPase  39.56 
 
 
331 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2382  arginine/ornithine transport system ATPase  42.9 
 
 
334 aa  252  5.000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3259  LAO/AO transport system ATPase  43.77 
 
 
322 aa  252  6e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00849768  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2512  arginine/ornithine transport system ATPase  43.03 
 
 
340 aa  252  6e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.210765 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3648  arginine/ornithine transport system ATPase  41.4 
 
 
332 aa  252  6e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0280  arginine/ornithine transport system ATPase  41.85 
 
 
382 aa  251  9.000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22160  LAO/AO transport system ATPase  41.25 
 
 
330 aa  251  9.000000000000001e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.436585 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2163  arginine/ornithine transport system ATPase  42.99 
 
 
345 aa  251  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.191923  normal  0.423822 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2114  arginine/ornithine transport system ATPase  46.23 
 
 
326 aa  248  8e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00605272 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2431  arginine/ornithine transport system ATPase  45.37 
 
 
337 aa  248  1e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.698067  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3946  LAO/AO transport system ATPase  42.14 
 
 
337 aa  247  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1945  arginine/ornithine transport system ATPase  39.2 
 
 
332 aa  246  4.9999999999999997e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.522383 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2763  arginine/ornithine transport system ATPase  40.18 
 
 
332 aa  245  6e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2504  LAO/AO transport system ATPase  38.46 
 
 
329 aa  245  6e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000648266  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3004  arginine/ornithine transport system ATPase  41.21 
 
 
364 aa  244  9.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.487769  normal  0.192606 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2695  arginine/ornithine transport system ATPase  42.12 
 
 
351 aa  243  3e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.278272 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6417  LAO/AO transport system ATPase  40.13 
 
 
328 aa  242  7e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3189  arginine/ornithine transport system ATPase  40.57 
 
 
322 aa  240  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  normal  0.363793 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0931  arginine/ornithine transport system ATPase  45.08 
 
 
341 aa  239  6.999999999999999e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0670  arginine/ornithine transport system ATPase  40.81 
 
 
333 aa  237  3e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.160836  normal  0.268873 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3457  arginine/ornithine transport system ATPase  40.72 
 
 
303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2106  LAO/AO transport system ATPase  41.56 
 
 
330 aa  235  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3543  LAO/AO transport system ATPase  42.91 
 
 
328 aa  233  3e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.569209  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1356  LAO/AO transport system ATPase  39.76 
 
 
345 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.229963  normal  0.961808 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3113  arginine/ornithine transport system ATPase  41.36 
 
 
323 aa  229  7e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.455526  hitchhiker  0.00331919 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1919  LAO/AO transport system ATPase  46.75 
 
 
327 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.250647  normal  0.437335 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2015  arginine/ornithine transport system ATPase  42.02 
 
 
323 aa  226  6e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.805467  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0725  arginine/ornithine transport system ATPase  41.54 
 
 
323 aa  225  9e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254962  normal  0.371915 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1853  LAO/AO transport system ATPase  33.95 
 
 
309 aa  192  6e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0456  LAO/AO transport system ATPase  34.46 
 
 
325 aa  181  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.614853 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12878  predicted protein  37.55 
 
 
312 aa  176  5e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0496106  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2025  LAO/AO transport system ATPase  32.42 
 
 
312 aa  174  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82524  decreased coverage  0.000989669 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1576  ArgK protein  32.13 
 
 
320 aa  172  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000113447  normal  0.451299 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2533  LAO/AO transport system ATPase  33.33 
 
 
316 aa  171  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.227946  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1268  LAO/AO transport system ATPase  35.42 
 
 
312 aa  171  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1798  LAO/AO transport system ATPase  35.22 
 
 
323 aa  171  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>