209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3609 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3609  LAO/AO transport system ATPase  100 
 
 		 345 aa  668    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3990  LAO/AO transport system ATPase  95.48 
 
 		 329 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1260  LAO/AO transport system ATPase  66.24 
 
 		 319 aa  404  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1798  LAO/AO transport system ATPase  64.89 
 
 		 323 aa  387  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4110  LAO/AO transport system ATPase  67.2 
 
 		 316 aa  382  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.162136  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1698  LAO/AO transport system ATPase  65.71 
 
 		 322 aa  381  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238616  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5998  LAO/AO transport system ATPase  68.93 
 
 		 307 aa  380  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0515982 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0358  LAO/AO transport system ATPase  60.63 
 
 		 318 aa  356  2.9999999999999997e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2170  LAO/AO transport system ATPase  60.26 
 
 		 341 aa  338  9e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300615  normal  0.661007 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1045  LAO/AO transport system ATPase  60.53 
 
 		 356 aa  338  9.999999999999999e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.172221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0943  LAO/AO transport system ATPase  49.68 
 
 		 314 aa  280  2e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1576  ArgK protein  45.34 
 
 		 320 aa  278  1e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000113447  normal  0.451299 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0673  LAO/AO transport system ATPase  51.53 
 
 		 340 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1853  LAO/AO transport system ATPase  44.69 
 
 		 309 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2160  LAO/AO transport system ATPase  49.55 
 
 		 341 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.104519 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3108  LAO/AO transport system ATPase  50.82 
 
 		 304 aa  271  2e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0453606 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2025  LAO/AO transport system ATPase  50.5 
 
 		 312 aa  269  5e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82524  decreased coverage  0.000989669 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2027  LAO/AO transport system ATPase  43.71 
 
 		 316 aa  267  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00170815  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1579  LAO/AO transport system ATPase  45.08 
 
 		 319 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3988  LAO/AO transport system ATPase  50.97 
 
 		 324 aa  265  7e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3103  LAO/AO transport system ATPase  53.31 
 
 		 335 aa  264  1e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0011081  hitchhiker  0.0000652797 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0389  LAO/AO transport system ATPase  45.17 
 
 		 317 aa  265  1e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000146012  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2297  LAO/AO transport system ATPase  45.79 
 
 		 344 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.413391  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2209  LAO/AO transport system ATPase  45.76 
 
 		 344 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.249756  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1268  LAO/AO transport system ATPase  42.04 
 
 		 312 aa  259  5.0000000000000005e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2999  LAO/AO transport system ATPase  48.89 
 
 		 316 aa  258  1e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1674  LAO/AO transport system ATPase  45.81 
 
 		 312 aa  256  4e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3795  LAO/AO transport system ATPase  49.68 
 
 		 290 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3868  LAO/AO transport system ATPase  49.68 
 
 		 290 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3009  LAO/AO transport system ATPase  49.68 
 
 		 308 aa  256  4e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.072512 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3799  LAO/AO transport system ATPase  49.68 
 
 		 290 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.205117  normal  0.899663 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1649  LAO/AO transport system ATPase  45.22 
 
 		 344 aa  256  6e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.840992  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2690  LAO/AO transport system ATPase  44.69 
 
 		 314 aa  255  7e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249774  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1549  LAO/AO transport system ATPase  44.69 
 
 		 314 aa  255  7e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000360873 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0456  LAO/AO transport system ATPase  45.36 
 
 		 325 aa  254  1.0000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.614853 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3772  LAO/AO transport system ATPase  45.96 
 
 		 318 aa  252  7e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.339101 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2365  LAO/AO transport system ATPase  44.48 
 
 		 318 aa  250  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4647  LAO/AO transport system ATPase  48.39 
 
 		 325 aa  251  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0480374  normal  0.487392 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0899  LAO/AO transport system ATPase  43.27 
 
 		 357 aa  249  6e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0586  LAO/AO transport system ATPase  49.18 
 
 		 310 aa  248  1e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.585715  normal  0.982729 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1281  LAO/AO transport system ATPase  44.81 
 
 		 317 aa  246  3e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.417761  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1613  LAO/AO transport system ATPase  52.16 
 
 		 312 aa  245  9.999999999999999e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.375817 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2533  LAO/AO transport system ATPase  43.55 
 
 		 316 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.227946  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2806  LAO/AO transport system ATPase  43.41 
 
 		 326 aa  239  5e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0864794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4250  LAO/AO transport system ATPase  48.06 
 
 		 322 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2397  LAO/AO transport system ATPase  48.63 
 
 		 303 aa  238  1e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.73846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2473  LAO/AO transport system ATPase  39.94 
 
 		 375 aa  236  3e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2690  LAO/AO transport system ATPase  45.8 
 
 		 321 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0540  putative transport system kinase  46.96 
 
 		 327 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.167721  hitchhiker  0.00219183 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5020  LAO/AO transport system ATPase  46.47 
 
 		 332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4359  LAO/AO transport system ATPase  40.57 
 
 		 364 aa  232  6e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.460456  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1911  LAO/AO transport system ATPase  40.32 
 
 		 318 aa  231  1e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0463697  normal  0.161513 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5087  LAO/AO transport system ATPase  45.67 
 
 		 333 aa  228  9e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0511  LAO/AO transport system ATPase  41.67 
 
 		 378 aa  228  1e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4301  LAO/AO transport system ATPase  51.36 
 
 		 292 aa  226  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.635078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1770  LAO/AO transport system ATPase  38.91 
 
 		 322 aa  225  7e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292624  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2130  LAO/AO transport system ATPase  43.51 
 
 		 327 aa  225  9e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1321  LAO/AO transport system ATPase  40.21 
 
 		 312 aa  225  1e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0801  LAO/AO transport system ATPase  53.78 
 
 		 299 aa  224  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3656  LAO/AO transport system ATPase  43.95 
 
 		 323 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.959092  normal  0.164513 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2210  ArgK protein  39.44 
 
 		 330 aa  219  7e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000516978  normal  0.0100138 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1780  LAO/AO transport system ATPase  57.45 
 
 		 321 aa  216  4e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0581  LAO/AO transport system ATPase  37.25 
 
 		 292 aa  216  4e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.730832  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5042  LAO/AO transport system ATPase  46.96 
 
 		 329 aa  215  9e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2056  LAO/AO transport system ATPase  40.23 
 
 		 314 aa  215  9.999999999999999e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0512  LAO/AO transport system ATPase  44.72 
 
 		 300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0080  LAO/AO transport system ATPase  40.88 
 
 		 315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2764  arginine/ornithine transport system ATPase  41.79 
 
 		 331 aa  204  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0468013  normal  0.748538 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3648  arginine/ornithine transport system ATPase  43.21 
 
 		 332 aa  204  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4372  LAO/AO transport system ATPase  42.4 
 
 		 329 aa  199  5e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1705  arginine/ornithine transport system ATPase  41.74 
 
 		 346 aa  198  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.476262  normal  0.0539762 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11526  arginine/ornithine transport system ATPase  42.21 
 
 		 334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.139624 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3121  arginine/ornithine transport system ATPase  42.03 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3182  arginine/ornithine transport system ATPase  42.03 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.968151  normal  0.139966 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3132  arginine/ornithine transport system ATPase  42.03 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3019  arginine/ornithine transport system ATPase  40.5 
 
 		 330 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.527055 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1945  arginine/ornithine transport system ATPase  41.16 
 
 		 332 aa  193  5e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.522383 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3542  arginine/ornithine transport system ATPase  38.91 
 
 		 330 aa  192  7e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.749977 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0153  LAO/AO transport system ATPase  42.59 
 
 		 296 aa  192  9e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.677625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05690  arginine/ornithine transport system ATPase  42.36 
 
 		 333 aa  192  9e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0374  arginine/ornithine transport system ATPase  44.69 
 
 		 329 aa  191  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0298  arginine/ornithine transport system ATPase  44.69 
 
 		 346 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.206617 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0342  arginine/ornithine transport system ATPase  44.69 
 
 		 329 aa  189  5e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2033  arginine/ornithine transport system ATPase  40.37 
 
 		 329 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2106  LAO/AO transport system ATPase  42.99 
 
 		 330 aa  187  3e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0955  LAO/AO transport system ATPase  35.06 
 
 		 305 aa  187  3e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0032483 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3480  arginine/ornithine transport system ATPase  43.8 
 
 		 328 aa  186  5e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.46606  normal  0.0872871 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2490  arginine/ornithine transport system ATPase  44.73 
 
 		 328 aa  186  6e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2114  arginine/ornithine transport system ATPase  42.7 
 
 		 326 aa  186  7e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00605272 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2421  LAO/AO transport system ATPase  40.79 
 
 		 343 aa  185  8e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2582  arginine/ornithine transport system ATPase  40.35 
 
 		 358 aa  185  9e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.575877  hitchhiker  0.000151333 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5546  LAO/AO transport system ATPase  39.05 
 
 		 372 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1922  arginine/ornithine transport system ATPase  39.47 
 
 		 330 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.597439 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2592  LAO/AO transport system ATPase  42.07 
 
 		 319 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2763  arginine/ornithine transport system ATPase  39.58 
 
 		 332 aa  184  3e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3004  arginine/ornithine transport system ATPase  43.65 
 
 		 364 aa  183  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.487769  normal  0.192606 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1086  arginine/ornithine transport system ATPase  45.28 
 
 		 345 aa  183  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22160  LAO/AO transport system ATPase  42.54 
 
 		 330 aa  182  5.0000000000000004e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.436585 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3543  LAO/AO transport system ATPase  48.67 
 
 		 328 aa  182  6e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.569209  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1360  LAO/AO transport system ATPase  33.01 
 
 		 316 aa  182  7e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000108838  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>