209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2365 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2365  LAO/AO transport system ATPase  100 
 
 
318 aa  635    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1549  LAO/AO transport system ATPase  52.41 
 
 
314 aa  309  4e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000360873 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2690  LAO/AO transport system ATPase  52.09 
 
 
314 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249774  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1853  LAO/AO transport system ATPase  49.83 
 
 
309 aa  298  7e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0943  LAO/AO transport system ATPase  50.49 
 
 
314 aa  298  8e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0389  LAO/AO transport system ATPase  49.51 
 
 
317 aa  296  3e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000146012  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0456  LAO/AO transport system ATPase  48.38 
 
 
325 aa  295  7e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.614853 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1798  LAO/AO transport system ATPase  50.16 
 
 
323 aa  290  3e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2027  LAO/AO transport system ATPase  48.53 
 
 
316 aa  289  3e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00170815  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1576  ArgK protein  48.86 
 
 
320 aa  288  8e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000113447  normal  0.451299 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1579  LAO/AO transport system ATPase  49.2 
 
 
319 aa  285  5.999999999999999e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2999  LAO/AO transport system ATPase  50.67 
 
 
316 aa  283  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2160  LAO/AO transport system ATPase  46.53 
 
 
341 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.104519 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2209  LAO/AO transport system ATPase  45.99 
 
 
344 aa  280  3e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.249756  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2806  LAO/AO transport system ATPase  46.01 
 
 
326 aa  278  1e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0864794  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4110  LAO/AO transport system ATPase  48.52 
 
 
316 aa  276  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.162136  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2297  LAO/AO transport system ATPase  45.83 
 
 
344 aa  276  3e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.413391  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2025  LAO/AO transport system ATPase  48.54 
 
 
312 aa  276  3e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82524  decreased coverage  0.000989669 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1281  LAO/AO transport system ATPase  47.59 
 
 
317 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.417761  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0586  LAO/AO transport system ATPase  48.51 
 
 
310 aa  271  1e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.585715  normal  0.982729 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1649  LAO/AO transport system ATPase  45.21 
 
 
344 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.840992  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1260  LAO/AO transport system ATPase  45.71 
 
 
319 aa  270  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1698  LAO/AO transport system ATPase  47.15 
 
 
322 aa  268  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238616  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0358  LAO/AO transport system ATPase  46.79 
 
 
318 aa  266  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1674  LAO/AO transport system ATPase  52.09 
 
 
312 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2473  LAO/AO transport system ATPase  42.11 
 
 
375 aa  264  1e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4647  LAO/AO transport system ATPase  43.13 
 
 
325 aa  261  1e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0480374  normal  0.487392 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4359  LAO/AO transport system ATPase  40.52 
 
 
364 aa  259  3e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.460456  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0899  LAO/AO transport system ATPase  41.25 
 
 
357 aa  258  1e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3772  LAO/AO transport system ATPase  45.89 
 
 
318 aa  256  3e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.339101 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5998  LAO/AO transport system ATPase  45.37 
 
 
307 aa  255  5e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0515982 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1911  LAO/AO transport system ATPase  41.35 
 
 
318 aa  255  6e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0463697  normal  0.161513 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3988  LAO/AO transport system ATPase  54.69 
 
 
324 aa  255  7e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1268  LAO/AO transport system ATPase  44.91 
 
 
312 aa  254  9e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0511  LAO/AO transport system ATPase  41.16 
 
 
378 aa  253  4.0000000000000004e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3108  LAO/AO transport system ATPase  52.65 
 
 
304 aa  251  1e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0453606 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2170  LAO/AO transport system ATPase  53.09 
 
 
341 aa  249  3e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300615  normal  0.661007 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2690  LAO/AO transport system ATPase  45.11 
 
 
321 aa  247  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3990  LAO/AO transport system ATPase  48.29 
 
 
329 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2533  LAO/AO transport system ATPase  46.45 
 
 
316 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.227946  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3609  LAO/AO transport system ATPase  50 
 
 
345 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1770  LAO/AO transport system ATPase  41.14 
 
 
322 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292624  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1045  LAO/AO transport system ATPase  44.52 
 
 
356 aa  241  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.172221  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5020  LAO/AO transport system ATPase  43.13 
 
 
332 aa  236  4e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778595  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2130  LAO/AO transport system ATPase  52.02 
 
 
327 aa  235  7e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3009  LAO/AO transport system ATPase  46.92 
 
 
308 aa  235  7e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.072512 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2210  ArgK protein  40.38 
 
 
330 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000516978  normal  0.0100138 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1613  LAO/AO transport system ATPase  47.76 
 
 
312 aa  233  3e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.375817 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0540  putative transport system kinase  41.27 
 
 
327 aa  232  5e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.167721  hitchhiker  0.00219183 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5042  LAO/AO transport system ATPase  53.16 
 
 
329 aa  229  5e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13609  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0512  LAO/AO transport system ATPase  42.31 
 
 
300 aa  226  3e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1321  LAO/AO transport system ATPase  48.4 
 
 
312 aa  224  1e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0673  LAO/AO transport system ATPase  51.44 
 
 
340 aa  224  2e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3656  LAO/AO transport system ATPase  41.72 
 
 
323 aa  221  9e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.959092  normal  0.164513 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0153  LAO/AO transport system ATPase  46.67 
 
 
296 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.677625  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0581  LAO/AO transport system ATPase  47.52 
 
 
292 aa  216  4e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.730832  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3103  LAO/AO transport system ATPase  47.15 
 
 
335 aa  211  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0011081  hitchhiker  0.0000652797 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3795  LAO/AO transport system ATPase  42.14 
 
 
290 aa  210  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3868  LAO/AO transport system ATPase  42.14 
 
 
290 aa  210  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119113  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3799  LAO/AO transport system ATPase  42.14 
 
 
290 aa  210  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.205117  normal  0.899663 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4250  LAO/AO transport system ATPase  43.77 
 
 
322 aa  207  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4301  LAO/AO transport system ATPase  43.92 
 
 
292 aa  205  9e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.635078  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1780  LAO/AO transport system ATPase  53.45 
 
 
321 aa  204  2e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0801  LAO/AO transport system ATPase  49.54 
 
 
299 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2397  LAO/AO transport system ATPase  42.75 
 
 
303 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.73846  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5546  LAO/AO transport system ATPase  39.93 
 
 
372 aa  200  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1360  LAO/AO transport system ATPase  36.89 
 
 
316 aa  199  3.9999999999999996e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000108838  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0080  LAO/AO transport system ATPase  38.32 
 
 
315 aa  198  9e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5087  LAO/AO transport system ATPase  39.03 
 
 
333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2056  LAO/AO transport system ATPase  39.42 
 
 
314 aa  196  4.0000000000000005e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2478  arginine/ornithine transport system ATPase  37.89 
 
 
333 aa  191  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.341293  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05690  arginine/ornithine transport system ATPase  37.41 
 
 
333 aa  189  4e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2764  arginine/ornithine transport system ATPase  38.83 
 
 
331 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0468013  normal  0.748538 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3121  arginine/ornithine transport system ATPase  38.67 
 
 
325 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3182  arginine/ornithine transport system ATPase  38.67 
 
 
325 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.968151  normal  0.139966 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3132  arginine/ornithine transport system ATPase  38.67 
 
 
325 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151852  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2763  arginine/ornithine transport system ATPase  36.93 
 
 
332 aa  187  3e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2490  arginine/ornithine transport system ATPase  38.93 
 
 
328 aa  186  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3019  arginine/ornithine transport system ATPase  36.01 
 
 
330 aa  185  9e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.527055 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2240  arginine/ornithine transport system ATPase  37.64 
 
 
326 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0574886  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0955  LAO/AO transport system ATPase  34.35 
 
 
305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0032483 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2033  arginine/ornithine transport system ATPase  39.64 
 
 
329 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4372  LAO/AO transport system ATPase  38.72 
 
 
329 aa  182  8.000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4005  arginine/ornithine transport system ATPase  36.49 
 
 
329 aa  181  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1322  arginine/ornithine transport system ATPase  39.13 
 
 
351 aa  181  2e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.822906  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3302  LAO/AO transport system ATPase  35.69 
 
 
374 aa  181  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.107074  normal  0.916816 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3340  arginine/ornithine transport system ATPase  36.99 
 
 
331 aa  179  4e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1919  LAO/AO transport system ATPase  35.18 
 
 
327 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.250647  normal  0.437335 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1922  arginine/ornithine transport system ATPase  41.3 
 
 
330 aa  179  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.597439 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0792  arginine/ornithine transport system ATPase  36.64 
 
 
331 aa  179  8e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3054  arginine/ornithine transport system ATPase  36.99 
 
 
331 aa  179  8e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3245  arginine/ornithine transport system ATPase  36.64 
 
 
331 aa  179  8e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02749  arginine/ornithine transport system ATPase  36.64 
 
 
331 aa  178  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0775  LAO/AO transport system ATPase  36.64 
 
 
331 aa  178  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3542  arginine/ornithine transport system ATPase  39.92 
 
 
330 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.749977 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02712  hypothetical protein  36.64 
 
 
331 aa  178  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4214  arginine/ornithine transport system ATPase  36.64 
 
 
331 aa  178  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3076  arginine/ornithine transport system ATPase  36.64 
 
 
331 aa  178  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1350  arginine/ornithine transport system ATPase  35.71 
 
 
372 aa  177  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0354539  unclonable  0.0000000282575 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3480  arginine/ornithine transport system ATPase  37.05 
 
 
328 aa  176  4e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.46606  normal  0.0872871 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>