213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1579 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1579  LAO/AO transport system ATPase  100 
 
 		 319 aa  639    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1576  ArgK protein  83.33 
 
 		 320 aa  531  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000113447  normal  0.451299 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2027  LAO/AO transport system ATPase  73.8 
 
 		 316 aa  483  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00170815  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1549  LAO/AO transport system ATPase  71.06 
 
 		 314 aa  456  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000360873 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2690  LAO/AO transport system ATPase  70.42 
 
 		 314 aa  454  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249774  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0389  LAO/AO transport system ATPase  63.72 
 
 		 317 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000146012  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1281  LAO/AO transport system ATPase  54.57 
 
 		 317 aa  341  1e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.417761  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2160  LAO/AO transport system ATPase  55.18 
 
 		 341 aa  330  2e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.104519 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2209  LAO/AO transport system ATPase  53.5 
 
 		 344 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.249756  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2297  LAO/AO transport system ATPase  53.5 
 
 		 344 aa  326  3e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.413391  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3772  LAO/AO transport system ATPase  55.81 
 
 		 318 aa  325  7e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.339101 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1649  LAO/AO transport system ATPase  53.01 
 
 		 344 aa  325  8.000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.840992  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0456  LAO/AO transport system ATPase  47.74 
 
 		 325 aa  295  8e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.614853 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1911  LAO/AO transport system ATPase  46.56 
 
 		 318 aa  289  4e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0463697  normal  0.161513 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1260  LAO/AO transport system ATPase  49.35 
 
 		 319 aa  289  5.0000000000000004e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2365  LAO/AO transport system ATPase  49.2 
 
 		 318 aa  285  5.999999999999999e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1853  LAO/AO transport system ATPase  46.47 
 
 		 309 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2473  LAO/AO transport system ATPase  45.51 
 
 		 375 aa  280  2e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2025  LAO/AO transport system ATPase  46.43 
 
 		 312 aa  278  9e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82524  decreased coverage  0.000989669 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1770  LAO/AO transport system ATPase  43.95 
 
 		 322 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292624  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1674  LAO/AO transport system ATPase  48.03 
 
 		 312 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2170  LAO/AO transport system ATPase  50 
 
 		 341 aa  271  2e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300615  normal  0.661007 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4359  LAO/AO transport system ATPase  45.54 
 
 		 364 aa  268  8e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.460456  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2999  LAO/AO transport system ATPase  47.21 
 
 		 316 aa  266  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4110  LAO/AO transport system ATPase  48.2 
 
 		 316 aa  266  5e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.162136  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0899  LAO/AO transport system ATPase  44.71 
 
 		 357 aa  265  5.999999999999999e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1798  LAO/AO transport system ATPase  48.1 
 
 		 323 aa  263  2e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1045  LAO/AO transport system ATPase  46.93 
 
 		 356 aa  263  4e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.172221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0943  LAO/AO transport system ATPase  46.89 
 
 		 314 aa  262  4.999999999999999e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0586  LAO/AO transport system ATPase  46.13 
 
 		 310 aa  260  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.585715  normal  0.982729 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2806  LAO/AO transport system ATPase  44.79 
 
 		 326 aa  260  2e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0864794  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0358  LAO/AO transport system ATPase  46.79 
 
 		 318 aa  260  3e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0511  LAO/AO transport system ATPase  43.88 
 
 		 378 aa  258  7e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3609  LAO/AO transport system ATPase  45.08 
 
 		 345 aa  256  5e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5020  LAO/AO transport system ATPase  45.87 
 
 		 332 aa  255  6e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3990  LAO/AO transport system ATPase  44.76 
 
 		 329 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3988  LAO/AO transport system ATPase  45.89 
 
 		 324 aa  254  1.0000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2690  LAO/AO transport system ATPase  49.62 
 
 		 321 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2533  LAO/AO transport system ATPase  43.53 
 
 		 316 aa  251  8.000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.227946  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1698  LAO/AO transport system ATPase  46.01 
 
 		 322 aa  250  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238616  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3108  LAO/AO transport system ATPase  48.15 
 
 		 304 aa  247  2e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0453606 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2130  LAO/AO transport system ATPase  46.75 
 
 		 327 aa  247  2e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5042  LAO/AO transport system ATPase  54.66 
 
 		 329 aa  246  4e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0540  putative transport system kinase  44.37 
 
 		 327 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.167721  hitchhiker  0.00219183 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5998  LAO/AO transport system ATPase  44.16 
 
 		 307 aa  245  6e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0515982 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3656  LAO/AO transport system ATPase  43.79 
 
 		 323 aa  239  5e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.959092  normal  0.164513 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1268  LAO/AO transport system ATPase  40.2 
 
 		 312 aa  238  8e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4647  LAO/AO transport system ATPase  42.53 
 
 		 325 aa  237  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0480374  normal  0.487392 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3009  LAO/AO transport system ATPase  45.93 
 
 		 308 aa  236  4e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.072512 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2210  ArgK protein  41.37 
 
 		 330 aa  233  3e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000516978  normal  0.0100138 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5087  LAO/AO transport system ATPase  45.93 
 
 		 333 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0673  LAO/AO transport system ATPase  52.05 
 
 		 340 aa  232  6e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3103  LAO/AO transport system ATPase  47.98 
 
 		 335 aa  221  9e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0011081  hitchhiker  0.0000652797 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1321  LAO/AO transport system ATPase  46 
 
 		 312 aa  220  1.9999999999999999e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0801  LAO/AO transport system ATPase  52.89 
 
 		 299 aa  216  4e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1613  LAO/AO transport system ATPase  44.77 
 
 		 312 aa  214  1.9999999999999998e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.375817 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0581  LAO/AO transport system ATPase  40.68 
 
 		 292 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.730832  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4250  LAO/AO transport system ATPase  44.93 
 
 		 322 aa  212  7.999999999999999e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2056  LAO/AO transport system ATPase  38.97 
 
 		 314 aa  211  2e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0153  LAO/AO transport system ATPase  43.06 
 
 		 296 aa  210  3e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.677625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3795  LAO/AO transport system ATPase  42.62 
 
 		 290 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3868  LAO/AO transport system ATPase  42.62 
 
 		 290 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3799  LAO/AO transport system ATPase  42.62 
 
 		 290 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.205117  normal  0.899663 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0512  LAO/AO transport system ATPase  38.85 
 
 		 300 aa  207  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4301  LAO/AO transport system ATPase  46.01 
 
 		 292 aa  203  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.635078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2397  LAO/AO transport system ATPase  51.5 
 
 		 303 aa  198  9e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.73846  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0080  LAO/AO transport system ATPase  36.68 
 
 		 315 aa  195  1e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1360  LAO/AO transport system ATPase  35.29 
 
 		 316 aa  193  4e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000108838  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1780  LAO/AO transport system ATPase  54.27 
 
 		 321 aa  188  1e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05690  arginine/ornithine transport system ATPase  36.19 
 
 		 333 aa  188  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0551  ArgK protein  35.18 
 
 		 310 aa  187  2e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2490  arginine/ornithine transport system ATPase  40.43 
 
 		 328 aa  187  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2763  arginine/ornithine transport system ATPase  37.93 
 
 		 332 aa  180  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3054  arginine/ornithine transport system ATPase  36.94 
 
 		 331 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5546  LAO/AO transport system ATPase  41.11 
 
 		 372 aa  179  7e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0792  arginine/ornithine transport system ATPase  36.43 
 
 		 331 aa  178  8e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3245  arginine/ornithine transport system ATPase  36.43 
 
 		 331 aa  178  8e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3340  arginine/ornithine transport system ATPase  36.43 
 
 		 331 aa  178  9e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02749  arginine/ornithine transport system ATPase  36.43 
 
 		 331 aa  178  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0775  LAO/AO transport system ATPase  36.43 
 
 		 331 aa  178  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0955  LAO/AO transport system ATPase  33.12 
 
 		 305 aa  178  1e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0032483 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02712  hypothetical protein  36.43 
 
 		 331 aa  178  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3076  arginine/ornithine transport system ATPase  36.43 
 
 		 331 aa  178  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4214  arginine/ornithine transport system ATPase  36.43 
 
 		 331 aa  178  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3480  arginine/ornithine transport system ATPase  36.36 
 
 		 328 aa  177  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.46606  normal  0.0872871 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4372  LAO/AO transport system ATPase  36.25 
 
 		 329 aa  176  5e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0298  arginine/ornithine transport system ATPase  36.28 
 
 		 346 aa  176  6e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.206617 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3542  arginine/ornithine transport system ATPase  34.5 
 
 		 330 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.749977 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2033  arginine/ornithine transport system ATPase  35.26 
 
 		 329 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0342  arginine/ornithine transport system ATPase  36.28 
 
 		 329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2504  LAO/AO transport system ATPase  40.32 
 
 		 329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000648266  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11526  arginine/ornithine transport system ATPase  40.33 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.139624 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3132  arginine/ornithine transport system ATPase  36.71 
 
 		 325 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22160  LAO/AO transport system ATPase  39.46 
 
 		 330 aa  173  3.9999999999999995e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.436585 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3121  arginine/ornithine transport system ATPase  36.71 
 
 		 325 aa  172  5e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3182  arginine/ornithine transport system ATPase  36.71 
 
 		 325 aa  172  5e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.968151  normal  0.139966 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3485  arginine/ornithine transport system ATPase  33.77 
 
 		 347 aa  172  5.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4005  arginine/ornithine transport system ATPase  32.79 
 
 		 329 aa  172  6.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0374  arginine/ornithine transport system ATPase  36.84 
 
 		 329 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3189  arginine/ornithine transport system ATPase  37.72 
 
 		 322 aa  172  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  normal  0.363793 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>