210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0511 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0511  LAO/AO transport system ATPase  100 
 
 
378 aa  738    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0899  LAO/AO transport system ATPase  64.15 
 
 
357 aa  416  9.999999999999999e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2806  LAO/AO transport system ATPase  61.82 
 
 
326 aa  415  9.999999999999999e-116  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0864794  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4359  LAO/AO transport system ATPase  62.25 
 
 
364 aa  402  1e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.460456  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2473  LAO/AO transport system ATPase  63.4 
 
 
375 aa  404  1e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0456  LAO/AO transport system ATPase  43.79 
 
 
325 aa  276  6e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.614853 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0389  LAO/AO transport system ATPase  44.77 
 
 
317 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000146012  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1549  LAO/AO transport system ATPase  44.97 
 
 
314 aa  273  3e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000360873 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2690  LAO/AO transport system ATPase  44.67 
 
 
314 aa  272  5.000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249774  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0943  LAO/AO transport system ATPase  45.03 
 
 
314 aa  271  1e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2160  LAO/AO transport system ATPase  47.38 
 
 
341 aa  266  4e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.104519 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1576  ArgK protein  44.74 
 
 
320 aa  264  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000113447  normal  0.451299 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2027  LAO/AO transport system ATPase  43.99 
 
 
316 aa  264  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00170815  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2209  LAO/AO transport system ATPase  44.83 
 
 
344 aa  262  6.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.249756  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2297  LAO/AO transport system ATPase  44.54 
 
 
344 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.413391  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1260  LAO/AO transport system ATPase  45.03 
 
 
319 aa  261  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1579  LAO/AO transport system ATPase  44.48 
 
 
319 aa  258  9e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1649  LAO/AO transport system ATPase  45.29 
 
 
344 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.840992  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1268  LAO/AO transport system ATPase  40 
 
 
312 aa  254  2.0000000000000002e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2025  LAO/AO transport system ATPase  43.66 
 
 
312 aa  254  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82524  decreased coverage  0.000989669 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1853  LAO/AO transport system ATPase  42.17 
 
 
309 aa  253  3e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2365  LAO/AO transport system ATPase  41.16 
 
 
318 aa  252  7e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1674  LAO/AO transport system ATPase  43.4 
 
 
312 aa  250  3e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0358  LAO/AO transport system ATPase  45.19 
 
 
318 aa  250  3e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3988  LAO/AO transport system ATPase  43.9 
 
 
324 aa  248  9e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1281  LAO/AO transport system ATPase  44.08 
 
 
317 aa  246  3e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.417761  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2999  LAO/AO transport system ATPase  49.82 
 
 
316 aa  245  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2170  LAO/AO transport system ATPase  45.11 
 
 
341 aa  243  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300615  normal  0.661007 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1045  LAO/AO transport system ATPase  44.08 
 
 
356 aa  240  4e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.172221  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1798  LAO/AO transport system ATPase  43.57 
 
 
323 aa  239  8e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1911  LAO/AO transport system ATPase  39.4 
 
 
318 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0463697  normal  0.161513 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4110  LAO/AO transport system ATPase  42.74 
 
 
316 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.162136  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1770  LAO/AO transport system ATPase  38.74 
 
 
322 aa  232  9e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292624  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1698  LAO/AO transport system ATPase  42.15 
 
 
322 aa  228  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238616  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3772  LAO/AO transport system ATPase  42.45 
 
 
318 aa  228  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.339101 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2533  LAO/AO transport system ATPase  41.59 
 
 
316 aa  227  2e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.227946  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3108  LAO/AO transport system ATPase  44 
 
 
304 aa  224  2e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0453606 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3990  LAO/AO transport system ATPase  42.73 
 
 
329 aa  224  3e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0586  LAO/AO transport system ATPase  43.27 
 
 
310 aa  223  3e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.585715  normal  0.982729 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5998  LAO/AO transport system ATPase  42.34 
 
 
307 aa  223  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0515982 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0540  putative transport system kinase  42.18 
 
 
327 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.167721  hitchhiker  0.00219183 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3009  LAO/AO transport system ATPase  42.05 
 
 
308 aa  223  4.9999999999999996e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.072512 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3609  LAO/AO transport system ATPase  45.74 
 
 
345 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4647  LAO/AO transport system ATPase  39.31 
 
 
325 aa  218  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0480374  normal  0.487392 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1321  LAO/AO transport system ATPase  38.02 
 
 
312 aa  216  5e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2130  LAO/AO transport system ATPase  43.52 
 
 
327 aa  213  5.999999999999999e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3656  LAO/AO transport system ATPase  38.64 
 
 
323 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.959092  normal  0.164513 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2210  ArgK protein  37.82 
 
 
330 aa  206  5e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000516978  normal  0.0100138 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5020  LAO/AO transport system ATPase  40.06 
 
 
332 aa  204  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778595  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3103  LAO/AO transport system ATPase  46.69 
 
 
335 aa  203  5e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0011081  hitchhiker  0.0000652797 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2690  LAO/AO transport system ATPase  39.46 
 
 
321 aa  202  7e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0581  LAO/AO transport system ATPase  37.08 
 
 
292 aa  202  9e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.730832  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1613  LAO/AO transport system ATPase  43.89 
 
 
312 aa  200  3.9999999999999996e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.375817 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4250  LAO/AO transport system ATPase  38.48 
 
 
322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0080  LAO/AO transport system ATPase  35.56 
 
 
315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0512  LAO/AO transport system ATPase  40.58 
 
 
300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5087  LAO/AO transport system ATPase  41.67 
 
 
333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0673  LAO/AO transport system ATPase  41.28 
 
 
340 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5042  LAO/AO transport system ATPase  45.71 
 
 
329 aa  196  6e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13609  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0801  LAO/AO transport system ATPase  41.64 
 
 
299 aa  194  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3795  LAO/AO transport system ATPase  39.47 
 
 
290 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3868  LAO/AO transport system ATPase  39.47 
 
 
290 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119113  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3799  LAO/AO transport system ATPase  39.47 
 
 
290 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.205117  normal  0.899663 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4301  LAO/AO transport system ATPase  40.62 
 
 
292 aa  191  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.635078  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2056  LAO/AO transport system ATPase  37.26 
 
 
314 aa  191  2.9999999999999997e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0551  ArgK protein  38.26 
 
 
310 aa  190  4e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2397  LAO/AO transport system ATPase  39.8 
 
 
303 aa  186  6e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.73846  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4005  arginine/ornithine transport system ATPase  33.52 
 
 
329 aa  176  7e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0153  LAO/AO transport system ATPase  38.58 
 
 
296 aa  176  7e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.677625  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1360  LAO/AO transport system ATPase  30.61 
 
 
316 aa  174  2.9999999999999996e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000108838  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2490  arginine/ornithine transport system ATPase  36.16 
 
 
328 aa  171  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1780  LAO/AO transport system ATPase  45.04 
 
 
321 aa  169  5e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1172  LAO/AO transport system ATPase  31.41 
 
 
335 aa  166  4e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.978419  decreased coverage  0.00325794 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2592  LAO/AO transport system ATPase  39.35 
 
 
319 aa  166  5e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0955  LAO/AO transport system ATPase  40.49 
 
 
305 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0032483 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4372  LAO/AO transport system ATPase  37.29 
 
 
329 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2944  ArgK protein  41.73 
 
 
319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.162227  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05690  arginine/ornithine transport system ATPase  36.09 
 
 
333 aa  163  4.0000000000000004e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5546  LAO/AO transport system ATPase  36.94 
 
 
372 aa  163  6e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2020  LAO/AO transport system ATPase  33.54 
 
 
339 aa  163  6e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526211 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2764  arginine/ornithine transport system ATPase  34.46 
 
 
331 aa  162  6e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0468013  normal  0.748538 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2033  arginine/ornithine transport system ATPase  35.86 
 
 
329 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22160  LAO/AO transport system ATPase  37.7 
 
 
330 aa  162  7e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.436585 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2763  arginine/ornithine transport system ATPase  35.53 
 
 
332 aa  161  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3542  arginine/ornithine transport system ATPase  35.35 
 
 
330 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.749977 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3302  LAO/AO transport system ATPase  41.28 
 
 
374 aa  160  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.107074  normal  0.916816 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3648  arginine/ornithine transport system ATPase  36.62 
 
 
332 aa  160  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0298  arginine/ornithine transport system ATPase  37.03 
 
 
346 aa  160  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.206617 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3019  arginine/ornithine transport system ATPase  33.52 
 
 
330 aa  160  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.527055 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0342  arginine/ornithine transport system ATPase  37.42 
 
 
329 aa  159  5e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0374  arginine/ornithine transport system ATPase  35.92 
 
 
329 aa  159  8e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1322  arginine/ornithine transport system ATPase  35.79 
 
 
351 aa  158  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.822906  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3485  arginine/ornithine transport system ATPase  32.01 
 
 
347 aa  158  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2478  arginine/ornithine transport system ATPase  34.22 
 
 
333 aa  157  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.341293  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0387  LAO/AO transport system ATPase  34.1 
 
 
332 aa  157  4e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2240  arginine/ornithine transport system ATPase  34.75 
 
 
326 aa  155  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0574886  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1015  arginine/ornithine transport system ATPase  35.1 
 
 
337 aa  155  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3132  arginine/ornithine transport system ATPase  34.08 
 
 
325 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151852  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1922  arginine/ornithine transport system ATPase  34.67 
 
 
330 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.597439 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0078  LAO/AO transport system ATPase  32.82 
 
 
331 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>