212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2210 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2210  ArgK protein  100 
 
 		 330 aa  669    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000516978  normal  0.0100138 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1853  LAO/AO transport system ATPase  48.57 
 
 		 309 aa  268  1e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2025  LAO/AO transport system ATPase  43.79 
 
 		 312 aa  258  9e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82524  decreased coverage  0.000989669 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0389  LAO/AO transport system ATPase  44.3 
 
 		 317 aa  257  2e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000146012  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1281  LAO/AO transport system ATPase  44.98 
 
 		 317 aa  256  4e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.417761  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0456  LAO/AO transport system ATPase  45.31 
 
 		 325 aa  253  3e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.614853 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2027  LAO/AO transport system ATPase  41.64 
 
 		 316 aa  243  3e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00170815  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1549  LAO/AO transport system ATPase  42.3 
 
 		 314 aa  242  6e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000360873 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2690  LAO/AO transport system ATPase  42.3 
 
 		 314 aa  242  7e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249774  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2999  LAO/AO transport system ATPase  41.51 
 
 		 316 aa  241  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4647  LAO/AO transport system ATPase  42.72 
 
 		 325 aa  238  8e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0480374  normal  0.487392 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1576  ArgK protein  41.31 
 
 		 320 aa  238  9e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000113447  normal  0.451299 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1674  LAO/AO transport system ATPase  42.02 
 
 		 312 aa  238  1e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2365  LAO/AO transport system ATPase  40.38 
 
 		 318 aa  233  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1579  LAO/AO transport system ATPase  41.37 
 
 		 319 aa  233  3e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0943  LAO/AO transport system ATPase  44.59 
 
 		 314 aa  230  3e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1770  LAO/AO transport system ATPase  39.16 
 
 		 322 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292624  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1911  LAO/AO transport system ATPase  40.45 
 
 		 318 aa  226  6e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0463697  normal  0.161513 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1698  LAO/AO transport system ATPase  43.51 
 
 		 322 aa  224  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238616  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5020  LAO/AO transport system ATPase  43.4 
 
 		 332 aa  225  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1260  LAO/AO transport system ATPase  43.28 
 
 		 319 aa  223  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0899  LAO/AO transport system ATPase  39.09 
 
 		 357 aa  223  4.9999999999999996e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2806  LAO/AO transport system ATPase  41.31 
 
 		 326 aa  222  7e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0864794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2160  LAO/AO transport system ATPase  42.01 
 
 		 341 aa  222  8e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.104519 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2209  LAO/AO transport system ATPase  40.98 
 
 		 344 aa  221  9e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.249756  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2473  LAO/AO transport system ATPase  38.18 
 
 		 375 aa  221  1.9999999999999999e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1268  LAO/AO transport system ATPase  37.34 
 
 		 312 aa  219  3.9999999999999997e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2297  LAO/AO transport system ATPase  40.98 
 
 		 344 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.413391  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1649  LAO/AO transport system ATPase  39.88 
 
 		 344 aa  218  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.840992  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0540  putative transport system kinase  41.56 
 
 		 327 aa  218  1e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.167721  hitchhiker  0.00219183 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4359  LAO/AO transport system ATPase  37.84 
 
 		 364 aa  218  1e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.460456  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4110  LAO/AO transport system ATPase  42.16 
 
 		 316 aa  216  4e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.162136  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3988  LAO/AO transport system ATPase  40.26 
 
 		 324 aa  215  8e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0586  LAO/AO transport system ATPase  42.35 
 
 		 310 aa  215  9e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.585715  normal  0.982729 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3772  LAO/AO transport system ATPase  42.9 
 
 		 318 aa  214  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.339101 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3990  LAO/AO transport system ATPase  40.72 
 
 		 329 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3609  LAO/AO transport system ATPase  39.44 
 
 		 345 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3108  LAO/AO transport system ATPase  41.31 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0453606 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2170  LAO/AO transport system ATPase  42.12 
 
 		 341 aa  211  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300615  normal  0.661007 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2533  LAO/AO transport system ATPase  41.56 
 
 		 316 aa  211  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.227946  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1798  LAO/AO transport system ATPase  41.64 
 
 		 323 aa  210  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2690  LAO/AO transport system ATPase  42.07 
 
 		 321 aa  207  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3009  LAO/AO transport system ATPase  39.22 
 
 		 308 aa  206  3e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.072512 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5998  LAO/AO transport system ATPase  40.07 
 
 		 307 aa  206  5e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0515982 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2130  LAO/AO transport system ATPase  46.03 
 
 		 327 aa  206  5e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0511  LAO/AO transport system ATPase  37.82 
 
 		 378 aa  204  1e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1045  LAO/AO transport system ATPase  40.92 
 
 		 356 aa  204  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.172221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5087  LAO/AO transport system ATPase  40.19 
 
 		 333 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0673  LAO/AO transport system ATPase  45.93 
 
 		 340 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3656  LAO/AO transport system ATPase  39.47 
 
 		 323 aa  200  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.959092  normal  0.164513 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1321  LAO/AO transport system ATPase  42.12 
 
 		 312 aa  197  3e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2056  LAO/AO transport system ATPase  38.15 
 
 		 314 aa  196  6e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0358  LAO/AO transport system ATPase  39.22 
 
 		 318 aa  195  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3103  LAO/AO transport system ATPase  46.43 
 
 		 335 aa  194  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0011081  hitchhiker  0.0000652797 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0512  LAO/AO transport system ATPase  41.6 
 
 		 300 aa  193  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3795  LAO/AO transport system ATPase  43.65 
 
 		 290 aa  192  7e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3868  LAO/AO transport system ATPase  43.65 
 
 		 290 aa  192  7e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3799  LAO/AO transport system ATPase  43.65 
 
 		 290 aa  192  7e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.205117  normal  0.899663 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0080  LAO/AO transport system ATPase  38.76 
 
 		 315 aa  189  5e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5042  LAO/AO transport system ATPase  52.88 
 
 		 329 aa  186  6e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4250  LAO/AO transport system ATPase  40.2 
 
 		 322 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2397  LAO/AO transport system ATPase  40.13 
 
 		 303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.73846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1613  LAO/AO transport system ATPase  42.15 
 
 		 312 aa  180  2.9999999999999997e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.375817 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0801  LAO/AO transport system ATPase  46.33 
 
 		 299 aa  178  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4301  LAO/AO transport system ATPase  41.47 
 
 		 292 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.635078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2592  LAO/AO transport system ATPase  41.82 
 
 		 319 aa  177  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0955  LAO/AO transport system ATPase  34.53 
 
 		 305 aa  176  5e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0032483 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0153  LAO/AO transport system ATPase  37.46 
 
 		 296 aa  169  5e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.677625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0581  LAO/AO transport system ATPase  38.51 
 
 		 292 aa  167  2e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.730832  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0874  LAO/AO transport system ATPase  33.33 
 
 		 341 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0562176  normal  0.0447783 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2763  arginine/ornithine transport system ATPase  34.23 
 
 		 332 aa  166  5e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0551  ArgK protein  43.85 
 
 		 310 aa  166  5e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1360  LAO/AO transport system ATPase  33.23 
 
 		 316 aa  163  3e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000108838  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1237  arginine/ornithine transport system ATPase  32.6 
 
 		 336 aa  162  1e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2944  ArgK protein  42.21 
 
 		 319 aa  159  5e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.162227  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2764  arginine/ornithine transport system ATPase  33.64 
 
 		 331 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0468013  normal  0.748538 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2478  arginine/ornithine transport system ATPase  36.01 
 
 		 333 aa  155  6e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.341293  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2421  LAO/AO transport system ATPase  33.02 
 
 		 343 aa  155  6e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05690  arginine/ornithine transport system ATPase  33.89 
 
 		 333 aa  155  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1945  arginine/ornithine transport system ATPase  32.61 
 
 		 332 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.522383 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5021  LAO/AO transport system ATPase  30.5 
 
 		 363 aa  155  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0197522  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3004  arginine/ornithine transport system ATPase  35.79 
 
 		 364 aa  154  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.487769  normal  0.192606 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4372  LAO/AO transport system ATPase  32.81 
 
 		 329 aa  154  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11526  arginine/ornithine transport system ATPase  33.86 
 
 		 334 aa  154  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.139624 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3019  arginine/ornithine transport system ATPase  31.75 
 
 		 330 aa  153  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.527055 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3121  arginine/ornithine transport system ATPase  32.51 
 
 		 325 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3182  arginine/ornithine transport system ATPase  32.51 
 
 		 325 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.968151  normal  0.139966 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3132  arginine/ornithine transport system ATPase  32.51 
 
 		 325 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151852  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5546  LAO/AO transport system ATPase  34.62 
 
 		 372 aa  151  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3543  LAO/AO transport system ATPase  34.86 
 
 		 328 aa  150  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.569209  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1780  LAO/AO transport system ATPase  50.54 
 
 		 321 aa  151  2e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1166  arginine/ornithine transport system ATPase  31.03 
 
 		 337 aa  150  3e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00541841  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1172  LAO/AO transport system ATPase  30.67 
 
 		 335 aa  150  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.978419  decreased coverage  0.00325794 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0792  arginine/ornithine transport system ATPase  29.11 
 
 		 331 aa  149  5e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3245  arginine/ornithine transport system ATPase  29.11 
 
 		 331 aa  149  5e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3054  arginine/ornithine transport system ATPase  29.11 
 
 		 331 aa  149  6e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02749  arginine/ornithine transport system ATPase  28.8 
 
 		 331 aa  149  9e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02712  hypothetical protein  28.8 
 
 		 331 aa  149  9e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3076  arginine/ornithine transport system ATPase  28.8 
 
 		 331 aa  149  9e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4214  arginine/ornithine transport system ATPase  28.8 
 
 		 331 aa  149  9e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>