215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0540 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0540  putative transport system kinase  100 
 
 		 327 aa  651    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.167721  hitchhiker  0.00219183 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5020  LAO/AO transport system ATPase  66.26 
 
 		 332 aa  429  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3656  LAO/AO transport system ATPase  60.83 
 
 		 323 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.959092  normal  0.164513 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5087  LAO/AO transport system ATPase  50.32 
 
 		 333 aa  271  1e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0586  LAO/AO transport system ATPase  49.35 
 
 		 310 aa  250  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.585715  normal  0.982729 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2025  LAO/AO transport system ATPase  46.52 
 
 		 312 aa  250  3e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82524  decreased coverage  0.000989669 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1579  LAO/AO transport system ATPase  44.37 
 
 		 319 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2027  LAO/AO transport system ATPase  42.99 
 
 		 316 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00170815  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1853  LAO/AO transport system ATPase  42.52 
 
 		 309 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2999  LAO/AO transport system ATPase  46.35 
 
 		 316 aa  244  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1260  LAO/AO transport system ATPase  45.31 
 
 		 319 aa  242  7.999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0389  LAO/AO transport system ATPase  44.16 
 
 		 317 aa  241  9e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000146012  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1549  LAO/AO transport system ATPase  43.67 
 
 		 314 aa  241  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000360873 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2690  LAO/AO transport system ATPase  43.67 
 
 		 314 aa  241  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249774  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2806  LAO/AO transport system ATPase  44.23 
 
 		 326 aa  239  4e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0864794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0899  LAO/AO transport system ATPase  42.48 
 
 		 357 aa  239  4e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1576  ArgK protein  42.54 
 
 		 320 aa  235  8e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000113447  normal  0.451299 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3772  LAO/AO transport system ATPase  44.37 
 
 		 318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.339101 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3988  LAO/AO transport system ATPase  46.75 
 
 		 324 aa  234  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1911  LAO/AO transport system ATPase  40.26 
 
 		 318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0463697  normal  0.161513 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2365  LAO/AO transport system ATPase  41.27 
 
 		 318 aa  232  5e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1698  LAO/AO transport system ATPase  47.02 
 
 		 322 aa  232  7.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238616  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1281  LAO/AO transport system ATPase  43.26 
 
 		 317 aa  229  3e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.417761  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0456  LAO/AO transport system ATPase  42.95 
 
 		 325 aa  229  4e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.614853 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4647  LAO/AO transport system ATPase  42.9 
 
 		 325 aa  229  5e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0480374  normal  0.487392 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1674  LAO/AO transport system ATPase  48.95 
 
 		 312 aa  229  6e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1798  LAO/AO transport system ATPase  45.6 
 
 		 323 aa  229  7e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3990  LAO/AO transport system ATPase  52.26 
 
 		 329 aa  228  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2473  LAO/AO transport system ATPase  39.59 
 
 		 375 aa  226  4e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3609  LAO/AO transport system ATPase  51.64 
 
 		 345 aa  225  8e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0943  LAO/AO transport system ATPase  39.68 
 
 		 314 aa  224  1e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0358  LAO/AO transport system ATPase  44.1 
 
 		 318 aa  224  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2690  LAO/AO transport system ATPase  42.59 
 
 		 321 aa  223  3e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0511  LAO/AO transport system ATPase  42.18 
 
 		 378 aa  223  3e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4110  LAO/AO transport system ATPase  45 
 
 		 316 aa  222  7e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.162136  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2297  LAO/AO transport system ATPase  41.33 
 
 		 344 aa  222  8e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.413391  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2209  LAO/AO transport system ATPase  40.87 
 
 		 344 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.249756  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5998  LAO/AO transport system ATPase  43.52 
 
 		 307 aa  220  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0515982 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2533  LAO/AO transport system ATPase  46.85 
 
 		 316 aa  218  7.999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.227946  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2210  ArgK protein  41.56 
 
 		 330 aa  218  1e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000516978  normal  0.0100138 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1649  LAO/AO transport system ATPase  40.35 
 
 		 344 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.840992  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1770  LAO/AO transport system ATPase  37.46 
 
 		 322 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292624  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2160  LAO/AO transport system ATPase  43.9 
 
 		 341 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.104519 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4359  LAO/AO transport system ATPase  39.47 
 
 		 364 aa  217  2e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.460456  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2130  LAO/AO transport system ATPase  48.15 
 
 		 327 aa  216  4e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3108  LAO/AO transport system ATPase  45.02 
 
 		 304 aa  213  2.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0453606 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2170  LAO/AO transport system ATPase  50.21 
 
 		 341 aa  212  5.999999999999999e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300615  normal  0.661007 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1045  LAO/AO transport system ATPase  48.46 
 
 		 356 aa  210  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.172221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1268  LAO/AO transport system ATPase  39.29 
 
 		 312 aa  209  7e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0801  LAO/AO transport system ATPase  49.55 
 
 		 299 aa  208  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3009  LAO/AO transport system ATPase  44.36 
 
 		 308 aa  207  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.072512 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1613  LAO/AO transport system ATPase  45.45 
 
 		 312 aa  205  7e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.375817 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0551  ArgK protein  35.02 
 
 		 310 aa  204  2e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0673  LAO/AO transport system ATPase  49.38 
 
 		 340 aa  203  3e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3795  LAO/AO transport system ATPase  45.13 
 
 		 290 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3868  LAO/AO transport system ATPase  45.13 
 
 		 290 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3799  LAO/AO transport system ATPase  45.13 
 
 		 290 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.205117  normal  0.899663 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5042  LAO/AO transport system ATPase  53.59 
 
 		 329 aa  200  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0512  LAO/AO transport system ATPase  44.9 
 
 		 300 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0080  LAO/AO transport system ATPase  37.77 
 
 		 315 aa  199  7e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3103  LAO/AO transport system ATPase  45.97 
 
 		 335 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0011081  hitchhiker  0.0000652797 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2397  LAO/AO transport system ATPase  42.32 
 
 		 303 aa  194  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.73846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1321  LAO/AO transport system ATPase  37.72 
 
 		 312 aa  195  1e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4250  LAO/AO transport system ATPase  41.75 
 
 		 322 aa  192  8e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4301  LAO/AO transport system ATPase  44.41 
 
 		 292 aa  191  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.635078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0153  LAO/AO transport system ATPase  48.8 
 
 		 296 aa  187  3e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.677625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0955  LAO/AO transport system ATPase  44.39 
 
 		 305 aa  180  2e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0032483 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2763  arginine/ornithine transport system ATPase  37.75 
 
 		 332 aa  179  7e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1780  LAO/AO transport system ATPase  50 
 
 		 321 aa  177  2e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2056  LAO/AO transport system ATPase  35.56 
 
 		 314 aa  177  2e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5021  LAO/AO transport system ATPase  34.98 
 
 		 363 aa  177  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0197522  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0581  LAO/AO transport system ATPase  36.23 
 
 		 292 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.730832  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1360  LAO/AO transport system ATPase  33.12 
 
 		 316 aa  172  6.999999999999999e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000108838  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1322  arginine/ornithine transport system ATPase  42.06 
 
 		 351 aa  172  7.999999999999999e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.822906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3543  LAO/AO transport system ATPase  38.41 
 
 		 328 aa  172  7.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.569209  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4372  LAO/AO transport system ATPase  35.96 
 
 		 329 aa  172  7.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2764  arginine/ornithine transport system ATPase  38.3 
 
 		 331 aa  171  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0468013  normal  0.748538 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0298  arginine/ornithine transport system ATPase  39.93 
 
 		 346 aa  171  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.206617 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05690  arginine/ornithine transport system ATPase  39.2 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0374  arginine/ornithine transport system ATPase  40.15 
 
 		 329 aa  171  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0342  arginine/ornithine transport system ATPase  40.75 
 
 		 329 aa  169  7e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3121  arginine/ornithine transport system ATPase  38.76 
 
 		 325 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3182  arginine/ornithine transport system ATPase  38.76 
 
 		 325 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.968151  normal  0.139966 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2020  LAO/AO transport system ATPase  34.06 
 
 		 339 aa  169  7e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526211 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3132  arginine/ornithine transport system ATPase  38.76 
 
 		 325 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1086  arginine/ornithine transport system ATPase  38.81 
 
 		 345 aa  168  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0321  arginine/ornithine transport system ATPase  34.83 
 
 		 343 aa  167  2.9999999999999998e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.659399 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3302  LAO/AO transport system ATPase  35.67 
 
 		 374 aa  166  5.9999999999999996e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.107074  normal  0.916816 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3004  arginine/ornithine transport system ATPase  36.48 
 
 		 364 aa  164  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.487769  normal  0.192606 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5546  LAO/AO transport system ATPase  38.08 
 
 		 372 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1919  LAO/AO transport system ATPase  36.57 
 
 		 327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.250647  normal  0.437335 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3259  LAO/AO transport system ATPase  33.97 
 
 		 322 aa  163  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00849768  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1705  arginine/ornithine transport system ATPase  38.29 
 
 		 346 aa  164  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.476262  normal  0.0539762 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3019  arginine/ornithine transport system ATPase  37.63 
 
 		 330 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.527055 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11526  arginine/ornithine transport system ATPase  40.08 
 
 		 334 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.139624 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3480  arginine/ornithine transport system ATPase  40.67 
 
 		 328 aa  162  7e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.46606  normal  0.0872871 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2114  arginine/ornithine transport system ATPase  38.81 
 
 		 326 aa  161  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00605272 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1754  arginine/ornithine transport system ATPase  36.98 
 
 		 331 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.151104 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2478  arginine/ornithine transport system ATPase  36 
 
 		 333 aa  161  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.341293  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1945  arginine/ornithine transport system ATPase  37.32 
 
 		 332 aa  160  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.522383 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>