216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2130 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2130  LAO/AO transport system ATPase  100 
 
 		 327 aa  645    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1549  LAO/AO transport system ATPase  54.83 
 
 		 314 aa  260  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000360873 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2690  LAO/AO transport system ATPase  54.44 
 
 		 314 aa  259  3e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249774  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1853  LAO/AO transport system ATPase  43.75 
 
 		 309 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1576  ArgK protein  46.75 
 
 		 320 aa  251  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000113447  normal  0.451299 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1674  LAO/AO transport system ATPase  53.6 
 
 		 312 aa  249  5e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1579  LAO/AO transport system ATPase  46.75 
 
 		 319 aa  247  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0389  LAO/AO transport system ATPase  50.19 
 
 		 317 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000146012  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2025  LAO/AO transport system ATPase  51.14 
 
 		 312 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82524  decreased coverage  0.000989669 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3988  LAO/AO transport system ATPase  54.62 
 
 		 324 aa  243  3e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0586  LAO/AO transport system ATPase  50.19 
 
 		 310 aa  242  5e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.585715  normal  0.982729 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2999  LAO/AO transport system ATPase  52.42 
 
 		 316 aa  240  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2027  LAO/AO transport system ATPase  54.89 
 
 		 316 aa  239  4e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00170815  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1260  LAO/AO transport system ATPase  46.62 
 
 		 319 aa  238  9e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2365  LAO/AO transport system ATPase  52.02 
 
 		 318 aa  235  7e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3108  LAO/AO transport system ATPase  44.63 
 
 		 304 aa  235  9e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0453606 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0456  LAO/AO transport system ATPase  43.84 
 
 		 325 aa  233  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.614853 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5087  LAO/AO transport system ATPase  43.65 
 
 		 333 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0673  LAO/AO transport system ATPase  54.1 
 
 		 340 aa  232  6e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4110  LAO/AO transport system ATPase  46.6 
 
 		 316 aa  231  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.162136  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3009  LAO/AO transport system ATPase  44.59 
 
 		 308 aa  231  1e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.072512 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2170  LAO/AO transport system ATPase  50.37 
 
 		 341 aa  230  2e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300615  normal  0.661007 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0358  LAO/AO transport system ATPase  44.3 
 
 		 318 aa  229  4e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1281  LAO/AO transport system ATPase  47.83 
 
 		 317 aa  228  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.417761  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1798  LAO/AO transport system ATPase  44.51 
 
 		 323 aa  227  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4359  LAO/AO transport system ATPase  39.71 
 
 		 364 aa  226  5.0000000000000005e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.460456  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2806  LAO/AO transport system ATPase  44.24 
 
 		 326 aa  225  6e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0864794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0899  LAO/AO transport system ATPase  40.24 
 
 		 357 aa  224  1e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2473  LAO/AO transport system ATPase  39.94 
 
 		 375 aa  224  1e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1045  LAO/AO transport system ATPase  44.98 
 
 		 356 aa  223  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.172221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5998  LAO/AO transport system ATPase  46.77 
 
 		 307 aa  222  8e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0515982 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5020  LAO/AO transport system ATPase  55.17 
 
 		 332 aa  221  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1268  LAO/AO transport system ATPase  41.33 
 
 		 312 aa  219  3.9999999999999997e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3990  LAO/AO transport system ATPase  44.48 
 
 		 329 aa  219  5e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1649  LAO/AO transport system ATPase  49.62 
 
 		 344 aa  219  5e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.840992  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2209  LAO/AO transport system ATPase  47.27 
 
 		 344 aa  218  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.249756  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3609  LAO/AO transport system ATPase  43.51 
 
 		 345 aa  218  8.999999999999998e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2690  LAO/AO transport system ATPase  50 
 
 		 321 aa  217  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3656  LAO/AO transport system ATPase  53.14 
 
 		 323 aa  217  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.959092  normal  0.164513 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2297  LAO/AO transport system ATPase  49.25 
 
 		 344 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.413391  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0540  putative transport system kinase  48.15 
 
 		 327 aa  216  4e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.167721  hitchhiker  0.00219183 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2160  LAO/AO transport system ATPase  47.97 
 
 		 341 aa  216  4e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.104519 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3772  LAO/AO transport system ATPase  47.18 
 
 		 318 aa  216  5e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.339101 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0511  LAO/AO transport system ATPase  43.52 
 
 		 378 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1698  LAO/AO transport system ATPase  44.84 
 
 		 322 aa  211  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238616  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4647  LAO/AO transport system ATPase  44.84 
 
 		 325 aa  207  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0480374  normal  0.487392 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2210  ArgK protein  46.03 
 
 		 330 aa  206  5e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000516978  normal  0.0100138 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0943  LAO/AO transport system ATPase  46.06 
 
 		 314 aa  205  1e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2533  LAO/AO transport system ATPase  40.4 
 
 		 316 aa  204  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.227946  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1321  LAO/AO transport system ATPase  41.92 
 
 		 312 aa  203  3e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1911  LAO/AO transport system ATPase  46.61 
 
 		 318 aa  202  6e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0463697  normal  0.161513 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1770  LAO/AO transport system ATPase  39.78 
 
 		 322 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292624  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3103  LAO/AO transport system ATPase  48.52 
 
 		 335 aa  196  5.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0011081  hitchhiker  0.0000652797 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3795  LAO/AO transport system ATPase  44.19 
 
 		 290 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3868  LAO/AO transport system ATPase  44.19 
 
 		 290 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3799  LAO/AO transport system ATPase  44.19 
 
 		 290 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.205117  normal  0.899663 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1613  LAO/AO transport system ATPase  51.46 
 
 		 312 aa  193  4e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.375817 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5042  LAO/AO transport system ATPase  47.52 
 
 		 329 aa  192  8e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2397  LAO/AO transport system ATPase  51.11 
 
 		 303 aa  191  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.73846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2056  LAO/AO transport system ATPase  36.33 
 
 		 314 aa  190  2e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0512  LAO/AO transport system ATPase  44 
 
 		 300 aa  191  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4250  LAO/AO transport system ATPase  44.41 
 
 		 322 aa  189  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0581  LAO/AO transport system ATPase  42.13 
 
 		 292 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.730832  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0080  LAO/AO transport system ATPase  37.4 
 
 		 315 aa  180  2e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0153  LAO/AO transport system ATPase  42.63 
 
 		 296 aa  181  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.677625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0801  LAO/AO transport system ATPase  47.62 
 
 		 299 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4301  LAO/AO transport system ATPase  51.95 
 
 		 292 aa  178  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.635078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2478  arginine/ornithine transport system ATPase  41.33 
 
 		 333 aa  178  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.341293  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4372  LAO/AO transport system ATPase  38.96 
 
 		 329 aa  173  5e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3019  arginine/ornithine transport system ATPase  36.42 
 
 		 330 aa  172  7.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.527055 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1360  LAO/AO transport system ATPase  37.76 
 
 		 316 aa  171  1e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000108838  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0551  ArgK protein  34.41 
 
 		 310 aa  170  4e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0955  LAO/AO transport system ATPase  41.92 
 
 		 305 aa  169  5e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0032483 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3121  arginine/ornithine transport system ATPase  39.25 
 
 		 325 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3182  arginine/ornithine transport system ATPase  39.25 
 
 		 325 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.968151  normal  0.139966 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3132  arginine/ornithine transport system ATPase  39.75 
 
 		 325 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151852  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5546  LAO/AO transport system ATPase  38.58 
 
 		 372 aa  169  9e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1780  LAO/AO transport system ATPase  48.5 
 
 		 321 aa  168  1e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2764  arginine/ornithine transport system ATPase  38.87 
 
 		 331 aa  168  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0468013  normal  0.748538 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11526  arginine/ornithine transport system ATPase  39.19 
 
 		 334 aa  168  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.139624 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3648  arginine/ornithine transport system ATPase  38.44 
 
 		 332 aa  167  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2490  arginine/ornithine transport system ATPase  40.15 
 
 		 328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2763  arginine/ornithine transport system ATPase  38.75 
 
 		 332 aa  165  9e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2592  LAO/AO transport system ATPase  39.55 
 
 		 319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4005  arginine/ornithine transport system ATPase  36.7 
 
 		 329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2421  LAO/AO transport system ATPase  38.17 
 
 		 343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2033  arginine/ornithine transport system ATPase  38.1 
 
 		 329 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3004  arginine/ornithine transport system ATPase  39.25 
 
 		 364 aa  162  7e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.487769  normal  0.192606 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3480  arginine/ornithine transport system ATPase  41.92 
 
 		 328 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.46606  normal  0.0872871 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3542  arginine/ornithine transport system ATPase  37.01 
 
 		 330 aa  162  9e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.749977 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0874  LAO/AO transport system ATPase  35.85 
 
 		 341 aa  161  1e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0562176  normal  0.0447783 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1945  arginine/ornithine transport system ATPase  39.3 
 
 		 332 aa  160  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.522383 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2382  arginine/ornithine transport system ATPase  36.99 
 
 		 334 aa  160  4e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0374  arginine/ornithine transport system ATPase  38.46 
 
 		 329 aa  159  5e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3485  arginine/ornithine transport system ATPase  36.01 
 
 		 347 aa  159  7e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0342  arginine/ornithine transport system ATPase  38.97 
 
 		 329 aa  159  8e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0298  arginine/ornithine transport system ATPase  38.97 
 
 		 346 aa  158  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.206617 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2106  LAO/AO transport system ATPase  37.62 
 
 		 330 aa  158  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1237  arginine/ornithine transport system ATPase  34.54 
 
 		 336 aa  157  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1922  arginine/ornithine transport system ATPase  36.67 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.597439 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>