210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2592 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2592  LAO/AO transport system ATPase  100 
 
 
319 aa  618  1e-176  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2944  ArgK protein  57.14 
 
 
319 aa  299  3e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.162227  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3009  LAO/AO transport system ATPase  45.23 
 
 
308 aa  202  8e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.072512 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4647  LAO/AO transport system ATPase  48.79 
 
 
325 aa  197  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0480374  normal  0.487392 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3108  LAO/AO transport system ATPase  42.16 
 
 
304 aa  196  4.0000000000000005e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0453606 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1853  LAO/AO transport system ATPase  43.49 
 
 
309 aa  194  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2025  LAO/AO transport system ATPase  44.01 
 
 
312 aa  193  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82524  decreased coverage  0.000989669 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2999  LAO/AO transport system ATPase  46.61 
 
 
316 aa  192  5e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1260  LAO/AO transport system ATPase  44.93 
 
 
319 aa  192  9e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1321  LAO/AO transport system ATPase  40.54 
 
 
312 aa  191  1e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1674  LAO/AO transport system ATPase  42.7 
 
 
312 aa  188  9e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4194  ArgK protein  51.81 
 
 
318 aa  186  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0358  LAO/AO transport system ATPase  45.2 
 
 
318 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2690  LAO/AO transport system ATPase  40.53 
 
 
321 aa  181  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2806  LAO/AO transport system ATPase  43.18 
 
 
326 aa  181  2e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0864794  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1613  LAO/AO transport system ATPase  45.55 
 
 
312 aa  180  2.9999999999999997e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.375817 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1045  LAO/AO transport system ATPase  46.91 
 
 
356 aa  180  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.172221  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3990  LAO/AO transport system ATPase  44.66 
 
 
329 aa  179  8e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3609  LAO/AO transport system ATPase  44.66 
 
 
345 aa  177  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1268  LAO/AO transport system ATPase  37.45 
 
 
312 aa  176  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2210  ArgK protein  41.82 
 
 
330 aa  177  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000516978  normal  0.0100138 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0586  LAO/AO transport system ATPase  45.56 
 
 
310 aa  176  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.585715  normal  0.982729 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1945  arginine/ornithine transport system ATPase  42.65 
 
 
332 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.522383 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1698  LAO/AO transport system ATPase  42.47 
 
 
322 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238616  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1705  arginine/ornithine transport system ATPase  39.62 
 
 
346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.476262  normal  0.0539762 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1173  LAO/AO transport system ATPase  37.01 
 
 
329 aa  174  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2533  LAO/AO transport system ATPase  41.02 
 
 
316 aa  172  5e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.227946  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2170  LAO/AO transport system ATPase  45.24 
 
 
341 aa  172  7.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300615  normal  0.661007 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2764  arginine/ornithine transport system ATPase  41.43 
 
 
331 aa  170  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0468013  normal  0.748538 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1798  LAO/AO transport system ATPase  39.74 
 
 
323 aa  169  5e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0512  LAO/AO transport system ATPase  39.31 
 
 
300 aa  168  9e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2763  arginine/ornithine transport system ATPase  40.14 
 
 
332 aa  168  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0456  LAO/AO transport system ATPase  44.09 
 
 
325 aa  168  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.614853 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3189  arginine/ornithine transport system ATPase  43.12 
 
 
322 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  normal  0.363793 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5998  LAO/AO transport system ATPase  43.6 
 
 
307 aa  168  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0515982 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3132  arginine/ornithine transport system ATPase  40.57 
 
 
325 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151852  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3121  arginine/ornithine transport system ATPase  40.57 
 
 
325 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3182  arginine/ornithine transport system ATPase  40.57 
 
 
325 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.968151  normal  0.139966 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1911  LAO/AO transport system ATPase  40.82 
 
 
318 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0463697  normal  0.161513 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0943  LAO/AO transport system ATPase  40.66 
 
 
314 aa  167  2e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2027  LAO/AO transport system ATPase  43.19 
 
 
316 aa  167  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00170815  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0511  LAO/AO transport system ATPase  38.83 
 
 
378 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3988  LAO/AO transport system ATPase  43.9 
 
 
324 aa  167  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3103  LAO/AO transport system ATPase  50.69 
 
 
335 aa  166  4e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0011081  hitchhiker  0.0000652797 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1576  ArgK protein  44.6 
 
 
320 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000113447  normal  0.451299 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05690  arginine/ornithine transport system ATPase  41.2 
 
 
333 aa  166  5.9999999999999996e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3004  arginine/ornithine transport system ATPase  42.54 
 
 
364 aa  165  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.487769  normal  0.192606 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4110  LAO/AO transport system ATPase  43.8 
 
 
316 aa  165  8e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.162136  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1281  LAO/AO transport system ATPase  42.86 
 
 
317 aa  165  8e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.417761  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3480  arginine/ornithine transport system ATPase  38.6 
 
 
328 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.46606  normal  0.0872871 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0673  LAO/AO transport system ATPase  45.68 
 
 
340 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0342  arginine/ornithine transport system ATPase  39.01 
 
 
329 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5546  LAO/AO transport system ATPase  40.93 
 
 
372 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2473  LAO/AO transport system ATPase  37 
 
 
375 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0298  arginine/ornithine transport system ATPase  39.01 
 
 
346 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.206617 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4359  LAO/AO transport system ATPase  39.32 
 
 
364 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.460456  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2130  LAO/AO transport system ATPase  39.55 
 
 
327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4250  LAO/AO transport system ATPase  41.44 
 
 
322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2421  LAO/AO transport system ATPase  41.02 
 
 
343 aa  164  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2397  LAO/AO transport system ATPase  46.91 
 
 
303 aa  164  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.73846  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0374  arginine/ornithine transport system ATPase  38.65 
 
 
329 aa  163  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6417  LAO/AO transport system ATPase  41 
 
 
328 aa  162  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2690  LAO/AO transport system ATPase  41.26 
 
 
314 aa  162  6e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249774  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1579  LAO/AO transport system ATPase  40.25 
 
 
319 aa  162  7e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0389  LAO/AO transport system ATPase  43 
 
 
317 aa  162  7e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000146012  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1549  LAO/AO transport system ATPase  41.26 
 
 
314 aa  162  7e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000360873 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2365  LAO/AO transport system ATPase  39.11 
 
 
318 aa  162  8.000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1086  arginine/ornithine transport system ATPase  40.21 
 
 
345 aa  162  9e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3019  arginine/ornithine transport system ATPase  39.44 
 
 
330 aa  161  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.527055 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2504  LAO/AO transport system ATPase  40 
 
 
329 aa  160  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000648266  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0387  LAO/AO transport system ATPase  38.63 
 
 
332 aa  160  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0899  LAO/AO transport system ATPase  37.88 
 
 
357 aa  160  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3485  arginine/ornithine transport system ATPase  37.79 
 
 
347 aa  160  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2163  arginine/ornithine transport system ATPase  38.43 
 
 
345 aa  160  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.191923  normal  0.423822 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5020  LAO/AO transport system ATPase  39.87 
 
 
332 aa  160  4e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778595  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2695  arginine/ornithine transport system ATPase  39.23 
 
 
351 aa  159  7e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.278272 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0540  putative transport system kinase  42.01 
 
 
327 aa  159  7e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.167721  hitchhiker  0.00219183 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2114  arginine/ornithine transport system ATPase  39.86 
 
 
326 aa  159  8e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00605272 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2490  arginine/ornithine transport system ATPase  40.07 
 
 
328 aa  158  9e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3795  LAO/AO transport system ATPase  43.82 
 
 
290 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3868  LAO/AO transport system ATPase  43.82 
 
 
290 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119113  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3799  LAO/AO transport system ATPase  43.82 
 
 
290 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.205117  normal  0.899663 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3648  arginine/ornithine transport system ATPase  40.07 
 
 
332 aa  158  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11526  arginine/ornithine transport system ATPase  40.22 
 
 
334 aa  158  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.139624 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4301  LAO/AO transport system ATPase  43.4 
 
 
292 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.635078  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2478  arginine/ornithine transport system ATPase  37.41 
 
 
333 aa  157  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.341293  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2804  arginine/ornithine transport system ATPase  37.09 
 
 
352 aa  157  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0929254  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0874  LAO/AO transport system ATPase  34.02 
 
 
341 aa  157  3e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0562176  normal  0.0447783 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4372  LAO/AO transport system ATPase  38.58 
 
 
329 aa  156  4e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2106  LAO/AO transport system ATPase  39.34 
 
 
330 aa  156  4e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2160  LAO/AO transport system ATPase  41.2 
 
 
341 aa  156  4e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.104519 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1322  arginine/ornithine transport system ATPase  39.72 
 
 
351 aa  155  6e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.822906  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1015  arginine/ornithine transport system ATPase  37.66 
 
 
337 aa  156  6e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1850  arginine/ornithine transport system ATPase  38.55 
 
 
342 aa  156  6e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5087  LAO/AO transport system ATPase  43.93 
 
 
333 aa  155  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1770  LAO/AO transport system ATPase  41.33 
 
 
322 aa  155  7e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292624  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2129  arginine/ornithine transport system ATPase  35.13 
 
 
350 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.50019  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3542  arginine/ornithine transport system ATPase  37.23 
 
 
330 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.749977 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2033  arginine/ornithine transport system ATPase  37.36 
 
 
329 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2209  LAO/AO transport system ATPase  36.79 
 
 
344 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.249756  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>