213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1321 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1321  LAO/AO transport system ATPase  100 
 
 
312 aa  621  1e-177  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0581  LAO/AO transport system ATPase  56.57 
 
 
292 aa  302  5.000000000000001e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.730832  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1853  LAO/AO transport system ATPase  46.79 
 
 
309 aa  256  3e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3009  LAO/AO transport system ATPase  44.36 
 
 
308 aa  244  1.9999999999999999e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.072512 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1268  LAO/AO transport system ATPase  46.93 
 
 
312 aa  244  1.9999999999999999e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3108  LAO/AO transport system ATPase  41.89 
 
 
304 aa  243  3e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0453606 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0943  LAO/AO transport system ATPase  44.67 
 
 
314 aa  243  3e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1674  LAO/AO transport system ATPase  45 
 
 
312 aa  241  1e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1798  LAO/AO transport system ATPase  42.43 
 
 
323 aa  241  1e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1260  LAO/AO transport system ATPase  42.05 
 
 
319 aa  237  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0358  LAO/AO transport system ATPase  45.49 
 
 
318 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0389  LAO/AO transport system ATPase  46.24 
 
 
317 aa  232  6e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000146012  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1281  LAO/AO transport system ATPase  41.83 
 
 
317 aa  232  6e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.417761  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2806  LAO/AO transport system ATPase  39.48 
 
 
326 aa  230  2e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0864794  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2025  LAO/AO transport system ATPase  41.88 
 
 
312 aa  229  5e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82524  decreased coverage  0.000989669 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0899  LAO/AO transport system ATPase  39.21 
 
 
357 aa  227  2e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1045  LAO/AO transport system ATPase  42.75 
 
 
356 aa  227  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.172221  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0456  LAO/AO transport system ATPase  45.02 
 
 
325 aa  226  3e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.614853 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2365  LAO/AO transport system ATPase  48.4 
 
 
318 aa  224  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1613  LAO/AO transport system ATPase  40.7 
 
 
312 aa  224  1e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.375817 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2170  LAO/AO transport system ATPase  42.15 
 
 
341 aa  224  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300615  normal  0.661007 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0551  ArgK protein  41 
 
 
310 aa  224  2e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2473  LAO/AO transport system ATPase  40.12 
 
 
375 aa  224  2e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5998  LAO/AO transport system ATPase  42.96 
 
 
307 aa  223  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0515982 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4359  LAO/AO transport system ATPase  37.65 
 
 
364 aa  221  9.999999999999999e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.460456  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2690  LAO/AO transport system ATPase  43.45 
 
 
321 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2999  LAO/AO transport system ATPase  38.76 
 
 
316 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1579  LAO/AO transport system ATPase  46 
 
 
319 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2027  LAO/AO transport system ATPase  47.08 
 
 
316 aa  219  6e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00170815  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1698  LAO/AO transport system ATPase  45.49 
 
 
322 aa  219  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238616  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1576  ArgK protein  41.52 
 
 
320 aa  218  1e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000113447  normal  0.451299 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4647  LAO/AO transport system ATPase  38.67 
 
 
325 aa  217  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0480374  normal  0.487392 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0511  LAO/AO transport system ATPase  38.02 
 
 
378 aa  216  2.9999999999999998e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3609  LAO/AO transport system ATPase  41.22 
 
 
345 aa  216  5e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1549  LAO/AO transport system ATPase  47.35 
 
 
314 aa  215  7e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000360873 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2690  LAO/AO transport system ATPase  46.94 
 
 
314 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249774  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3990  LAO/AO transport system ATPase  40.84 
 
 
329 aa  214  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0512  LAO/AO transport system ATPase  46.56 
 
 
300 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0673  LAO/AO transport system ATPase  44.03 
 
 
340 aa  212  7e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4110  LAO/AO transport system ATPase  43.14 
 
 
316 aa  208  9e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.162136  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1911  LAO/AO transport system ATPase  39.94 
 
 
318 aa  208  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0463697  normal  0.161513 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2533  LAO/AO transport system ATPase  38.59 
 
 
316 aa  207  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.227946  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0586  LAO/AO transport system ATPase  40.15 
 
 
310 aa  206  3e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.585715  normal  0.982729 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1770  LAO/AO transport system ATPase  39.42 
 
 
322 aa  205  7e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292624  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2130  LAO/AO transport system ATPase  41.92 
 
 
327 aa  203  3e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2209  LAO/AO transport system ATPase  41.04 
 
 
344 aa  203  4e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.249756  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2297  LAO/AO transport system ATPase  41.04 
 
 
344 aa  202  6e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.413391  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3772  LAO/AO transport system ATPase  39.19 
 
 
318 aa  201  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.339101 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0801  LAO/AO transport system ATPase  46.41 
 
 
299 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2160  LAO/AO transport system ATPase  42.86 
 
 
341 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.104519 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2397  LAO/AO transport system ATPase  40.91 
 
 
303 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.73846  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3103  LAO/AO transport system ATPase  40.73 
 
 
335 aa  199  5e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0011081  hitchhiker  0.0000652797 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1649  LAO/AO transport system ATPase  40.64 
 
 
344 aa  199  6e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.840992  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2210  ArgK protein  42.12 
 
 
330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000516978  normal  0.0100138 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0153  LAO/AO transport system ATPase  42.64 
 
 
296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.677625  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5042  LAO/AO transport system ATPase  43.57 
 
 
329 aa  195  7e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13609  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4250  LAO/AO transport system ATPase  46.01 
 
 
322 aa  195  8.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0540  putative transport system kinase  37.72 
 
 
327 aa  195  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.167721  hitchhiker  0.00219183 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3988  LAO/AO transport system ATPase  42.23 
 
 
324 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2592  LAO/AO transport system ATPase  40.54 
 
 
319 aa  191  9e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3795  LAO/AO transport system ATPase  47.85 
 
 
290 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3868  LAO/AO transport system ATPase  47.85 
 
 
290 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119113  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3799  LAO/AO transport system ATPase  47.85 
 
 
290 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.205117  normal  0.899663 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2056  LAO/AO transport system ATPase  38.87 
 
 
314 aa  191  1e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1360  LAO/AO transport system ATPase  42.08 
 
 
316 aa  190  2.9999999999999997e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000108838  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5020  LAO/AO transport system ATPase  38.19 
 
 
332 aa  189  5.999999999999999e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778595  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0080  LAO/AO transport system ATPase  38.46 
 
 
315 aa  185  7e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1780  LAO/AO transport system ATPase  45.53 
 
 
321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4301  LAO/AO transport system ATPase  42.6 
 
 
292 aa  183  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.635078  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5087  LAO/AO transport system ATPase  42.22 
 
 
333 aa  183  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3656  LAO/AO transport system ATPase  36.97 
 
 
323 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.959092  normal  0.164513 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05690  arginine/ornithine transport system ATPase  35.37 
 
 
333 aa  177  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5546  LAO/AO transport system ATPase  32.87 
 
 
372 aa  176  6e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2944  ArgK protein  44.29 
 
 
319 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.162227  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0298  arginine/ornithine transport system ATPase  34.04 
 
 
346 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.206617 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0342  arginine/ornithine transport system ATPase  34.04 
 
 
329 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0374  arginine/ornithine transport system ATPase  34.28 
 
 
329 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2478  arginine/ornithine transport system ATPase  33.57 
 
 
333 aa  171  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.341293  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2490  arginine/ornithine transport system ATPase  34.4 
 
 
328 aa  171  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3019  arginine/ornithine transport system ATPase  35.38 
 
 
330 aa  169  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.527055 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6417  LAO/AO transport system ATPase  36.58 
 
 
328 aa  169  5e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0955  LAO/AO transport system ATPase  40.97 
 
 
305 aa  167  1e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0032483 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1705  arginine/ornithine transport system ATPase  36.5 
 
 
346 aa  168  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.476262  normal  0.0539762 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2763  arginine/ornithine transport system ATPase  32.63 
 
 
332 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1086  arginine/ornithine transport system ATPase  33.57 
 
 
345 aa  166  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1237  arginine/ornithine transport system ATPase  34.22 
 
 
336 aa  166  5e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3542  arginine/ornithine transport system ATPase  34.46 
 
 
330 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.749977 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3480  arginine/ornithine transport system ATPase  34.51 
 
 
328 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.46606  normal  0.0872871 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0867  arginine/ornithine transport system ATPase  37.15 
 
 
334 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11526  arginine/ornithine transport system ATPase  35.53 
 
 
334 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.139624 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2764  arginine/ornithine transport system ATPase  33.22 
 
 
331 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0468013  normal  0.748538 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2033  arginine/ornithine transport system ATPase  36.06 
 
 
329 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5021  LAO/AO transport system ATPase  38.91 
 
 
363 aa  161  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0197522  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3004  arginine/ornithine transport system ATPase  32.64 
 
 
364 aa  160  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.487769  normal  0.192606 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1283  arginine/ornithine transport system ATPase  35.74 
 
 
381 aa  160  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4005  arginine/ornithine transport system ATPase  33.08 
 
 
329 aa  160  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22160  LAO/AO transport system ATPase  32.12 
 
 
330 aa  160  3e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.436585 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3132  arginine/ornithine transport system ATPase  33.45 
 
 
325 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151852  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2293  arginine/ornithine transport system ATPase  34.97 
 
 
366 aa  159  5e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000757851  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2504  LAO/AO transport system ATPase  32.95 
 
 
329 aa  159  6e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000648266  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>