16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2823 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2823  thymidylate kinase-like protein  100 
 
 		 204 aa  423  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.749447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2620  hypothetical protein  92.16 
 
 		 204 aa  397  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1812  thymidylate kinase-like  91.18 
 
 		 204 aa  394  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  30.39 
 
 		 226 aa  44.3  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  31.82 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  30.56 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  35.64 
 
 		 662 aa  43.1  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  32.08 
 
 		 206 aa  42.7  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0101  deoxynucleoside kinase  30.53 
 
 		 207 aa  42.4  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1654  thymidylate kinase  33.33 
 
 		 217 aa  42.4  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.969892  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1026  dTMP kinase  36.73 
 
 		 254 aa  42  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4251  thymidylate kinase  34.78 
 
 		 213 aa  41.6  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.993209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0126  dTMP kinase  28.69 
 
 		 208 aa  41.6  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000990938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30960  thymidylate kinase  32.17 
 
 		 220 aa  41.6  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4102  thymidylate kinase  30.58 
 
 		 226 aa  41.2  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.808086  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1878  dTMP kinase  32 
 
 		 226 aa  41.2  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.04271 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>