More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02846 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02846  thymidylate kinase  100 
 
 		 227 aa  444  1.0000000000000001e-124  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1726  thymidylate kinase  63.64 
 
 		 217 aa  271  7e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1654  thymidylate kinase  63.16 
 
 		 217 aa  269  2e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.969892  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1884  dTMP kinase  47.62 
 
 		 206 aa  158  6e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1788  thymidylate kinase  37.37 
 
 		 203 aa  135  4e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000115787  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0144  dTMP kinase  38.5 
 
 		 204 aa  121  7e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.049684 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0126  thymidylate kinase  39.49 
 
 		 193 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1194  dTMP kinase  36.5 
 
 		 205 aa  115  7.999999999999999e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0156  dTMP kinase  36.68 
 
 		 196 aa  112  7.000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4325  dTMP kinase  40 
 
 		 217 aa  107  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.187582 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  39.05 
 
 		 215 aa  105  5e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2120  thymidylate kinase  36.63 
 
 		 202 aa  105  7e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000730162  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  38.66 
 
 		 703 aa  104  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  43.2 
 
 		 688 aa  102  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0456  thymidylate kinase  36.36 
 
 		 197 aa  102  4e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3110  dTMP kinase  39.8 
 
 		 209 aa  102  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2545  normal  0.244995 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  35.24 
 
 		 217 aa  102  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  41.45 
 
 		 671 aa  102  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  44.1 
 
 		 232 aa  102  7e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  39.3 
 
 		 200 aa  102  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1841  thymidylate kinase  35.64 
 
 		 189 aa  101  8e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  39.41 
 
 		 213 aa  101  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1660  thymidylate kinase  34.33 
 
 		 206 aa  101  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0638751  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  36.87 
 
 		 705 aa  101  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  36.45 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2155  thymidylate kinase  37.56 
 
 		 221 aa  101  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  35.96 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  35.47 
 
 		 206 aa  99.8  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  41.14 
 
 		 688 aa  99.4  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2144  dTMP kinase  37.04 
 
 		 199 aa  99.4  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0386  thymidylate kinase  37.13 
 
 		 222 aa  99.4  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203543  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  36.27 
 
 		 206 aa  99  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1026  dTMP kinase  34.98 
 
 		 254 aa  99  6e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  40.88 
 
 		 211 aa  98.6  7e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  47.92 
 
 		 730 aa  98.2  8e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  35.96 
 
 		 206 aa  98.6  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  35.96 
 
 		 206 aa  98.6  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  35.96 
 
 		 206 aa  98.6  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  35.47 
 
 		 206 aa  98.2  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  35.47 
 
 		 206 aa  98.2  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  35.78 
 
 		 205 aa  97.8  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  39.16 
 
 		 206 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3114  thymidylate kinase  36.92 
 
 		 230 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0311212  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  40.4 
 
 		 224 aa  97.4  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  40.48 
 
 		 217 aa  96.7  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  39.89 
 
 		 686 aa  97.1  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  33.33 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  40.83 
 
 		 226 aa  97.1  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  31.61 
 
 		 199 aa  96.7  3e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  39.58 
 
 		 686 aa  96.7  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  38.69 
 
 		 210 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  30.58 
 
 		 213 aa  96.7  3e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  41.4 
 
 		 208 aa  96.3  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  37.35 
 
 		 206 aa  96.7  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0300  dTMP kinase  30.53 
 
 		 205 aa  95.9  4e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.188613 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  36.75 
 
 		 203 aa  95.9  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1005  dTMP kinase  36.42 
 
 		 226 aa  95.9  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  41.28 
 
 		 225 aa  95.9  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2443  thymidylate kinase  35.47 
 
 		 206 aa  95.9  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2320  thymidylate kinase  35.47 
 
 		 206 aa  95.9  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  34.78 
 
 		 236 aa  95.9  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  42.24 
 
 		 202 aa  95.9  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0551  thymidylate kinase  40 
 
 		 217 aa  95.1  9e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2202  dTMP kinase  40 
 
 		 217 aa  95.1  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1425  thymidylate kinase  34.98 
 
 		 206 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3388  thymidylate kinase  34.98 
 
 		 206 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.830309  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  42.28 
 
 		 216 aa  94.4  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0027  dTMP kinase  41.57 
 
 		 215 aa  94.4  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.59116  normal  0.0709229 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1189  thymidylate kinase  34.98 
 
 		 206 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2281  thymidylate kinase  34.98 
 
 		 206 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617741  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  37.42 
 
 		 217 aa  94.4  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1916  thymidylate kinase  34.98 
 
 		 206 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  34.65 
 
 		 226 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1508  dTMP kinase  40.61 
 
 		 240 aa  94  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3204  thymidylate kinase  34.76 
 
 		 225 aa  93.6  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00156948  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3591  thymidylate kinase  35.1 
 
 		 214 aa  93.6  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.389295 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  32.71 
 
 		 216 aa  93.6  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  38.21 
 
 		 244 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  38.22 
 
 		 210 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  40.34 
 
 		 210 aa  92.8  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  38.5 
 
 		 217 aa  93.2  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  40.14 
 
 		 234 aa  93.2  3e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  37.58 
 
 		 210 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  38.58 
 
 		 244 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0512  thymidylate kinase  35.29 
 
 		 208 aa  93.6  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  38.22 
 
 		 210 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  39.05 
 
 		 225 aa  92.8  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  36.81 
 
 		 217 aa  92.8  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1425  thymidylate kinase  37.35 
 
 		 205 aa  92.4  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.578696  normal  0.216838 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3493  thymidylate kinase  37.8 
 
 		 212 aa  92  6e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000071243  normal  0.0320777 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  37.44 
 
 		 226 aa  92  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1691  thymidylate kinase  37.8 
 
 		 212 aa  92  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0210927  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  35.92 
 
 		 209 aa  92  7e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1583  thymidylate kinase  37.8 
 
 		 212 aa  91.7  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000489849  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl676  thymidylate kinase  32.51 
 
 		 211 aa  91.7  9e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  34.7 
 
 		 214 aa  91.7  9e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  39.81 
 
 		 281 aa  91.7  9e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  39.49 
 
 		 210 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  36.41 
 
 		 206 aa  90.9  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  34.5 
 
 		 210 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>